MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 7962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_020127	TAA	2	6	119407	119412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020127	TA	3	6	119424	119429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020127	CTT	2	6	119446	119451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020127	T	6	6	121714	121719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020127	AT	3	6	123022	123027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020127	TAG	2	6	123049	123054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020127	T	12	12	123500	123511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020127	TAA	2	6	123532	123537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020127	A	6	6	123540	123545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020127	ATAG	2	8	123561	123568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020127	TAA	2	6	123575	123580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020127	ATTA	2	8	123606	123613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020127	TA	3	6	123625	123630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020127	GA	3	6	123650	123655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020127	AT	3	6	123669	123674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020127	AT	3	6	123760	123765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020127	ATA	2	6	123775	123780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020127	GTTA	2	8	123837	123844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020127	AAAT	2	8	123883	123890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020127	CAT	2	6	123932	123937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020127	ACT	2	6	123938	123943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020127	ATT	2	6	123963	123968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020127	TATTAC	2	12	123985	123996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_020127	AAT	2	6	124016	124021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020127	TA	3	6	124054	124059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1030	NC_020127	TTTA	2	8	124140	124147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020127	TA	3	6	124146	124151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1033	NC_020127	TTA	2	6	124213	124218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020127	GAAT	2	8	124229	124236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020127	TA	3	6	124252	124257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1037	NC_020127	TTA	2	6	124287	124292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_020127	T	11	11	125319	125329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020127	A	7	7	125333	125339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020127	TAA	2	6	125367	125372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020127	TAT	2	6	125382	125387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_020127	TAT	2	6	125463	125468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_020127	TATT	2	8	127601	127608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_020127	AAT	2	6	130983	130988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020127	A	6	6	130994	130999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020127	TAA	2	6	131047	131052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020127	T	6	6	131108	131113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_020127	TCTA	2	8	133183	133190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1091	NC_020127	TAG	2	6	137136	137141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_020127	AGT	2	6	137206	137211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_020127	TAT	2	6	138254	138259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020127	TAA	2	6	138263	138268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020127	TTA	2	6	138270	138275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_020127	AGT	2	6	138358	138363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020127	GTAT	2	8	138369	138376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_020127	AGGT	2	8	138377	138384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_020127	ATAA	2	8	138487	138494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020127	TAA	2	6	138537	138542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_020127	ATGA	2	8	138650	138657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020127	AAG	2	6	138667	138672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020127	TTG	2	6	138688	138693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_020127	TTA	2	6	140799	140804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020127	ATA	2	6	141755	141760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020127	TA	3	6	141789	141794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020127	A	8	8	142821	142828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020127	ATA	2	6	142851	142856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020127	GATA	2	8	142861	142868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020127	TA	3	6	142867	142872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020127	T	9	9	142895	142903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020127	T	6	6	142915	142920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020127	T	6	6	144325	144330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020127	ATA	3	9	144353	144361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_020127	TAT	2	6	144373	144378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_020127	CT	3	6	180511	180516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1477	NC_020127	T	6	6	181979	181984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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