MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 18293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019683	TGA	2	6	4206677	4206682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_019683	TCA	2	6	4206688	4206693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_019683	AAT	2	6	4206728	4206733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_019683	TTGA	2	8	4206829	4206836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_019683	TCT	2	6	4206857	4206862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_019683	GGTA	2	8	4206917	4206924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_019683	AGT	2	6	4206959	4206964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_019683	CAC	2	6	4206982	4206987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_019683	CAG	2	6	4207094	4207099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_019683	GTT	2	6	4207127	4207132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_019683	GGT	2	6	4207165	4207170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_019683	CAAG	2	8	4207295	4207302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15013	NC_019683	GAG	2	6	4207432	4207437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_019683	CTA	2	6	4207461	4207466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_019683	CGC	2	6	4207580	4207585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15016	NC_019683	GAA	2	6	4207600	4207605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_019683	AT	3	6	4207609	4207614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_019683	ACA	2	6	4207619	4207624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_019683	GAA	3	9	4207628	4207636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_019683	T	6	6	4208607	4208612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_019683	GTA	2	6	4208613	4208618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_019683	CAA	2	6	4208654	4208659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_019683	TCA	2	6	4208665	4208670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_019683	ATG	2	6	4210254	4210259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_019683	GCG	2	6	4210279	4210284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_019683	AAC	2	6	4210293	4210298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_019683	ACA	2	6	4210330	4210335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_019683	CG	3	6	4210339	4210344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15029	NC_019683	ACA	2	6	4210345	4210350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_019683	AAC	3	9	4210353	4210361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_019683	TCG	2	6	4210426	4210431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_019683	TAG	2	6	4210516	4210521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_019683	T	6	6	4211496	4211501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_019683	GTA	2	6	4211502	4211507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_019683	AAG	2	6	4211527	4211532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_019683	CAA	2	6	4211543	4211548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15037	NC_019683	T	6	6	4211581	4211586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_019683	ATT	2	6	4211608	4211613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_019683	ATCA	2	8	4211638	4211645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_019683	TAGA	2	8	4211655	4211662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_019683	ATT	2	6	4218432	4218437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_019683	TAT	2	6	4218485	4218490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_019683	ATGCC	2	10	4218542	4218551	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15044	NC_019683	GCC	2	6	4218589	4218594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_019683	CTT	2	6	4218630	4218635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_019683	ACG	2	6	4218672	4218677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_019683	A	8	8	4218873	4218880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_019683	AG	4	8	4218896	4218903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_019683	TA	3	6	4218964	4218969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_019683	ATA	2	6	4218988	4218993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_019683	AG	3	6	4219028	4219033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_019683	GAT	2	6	4219084	4219089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_019683	ATT	3	9	4219200	4219208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_019683	TGG	2	6	4219252	4219257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_019683	CAC	2	6	4219297	4219302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15056	NC_019683	AGG	2	6	4219342	4219347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_019683	TAAG	2	8	4219348	4219355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_019683	TCA	2	6	4219357	4219362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_019683	AGA	2	6	4219363	4219368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_019683	GCT	2	6	4219430	4219435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_019683	AGAC	2	8	4219464	4219471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_019683	AGGT	2	8	4219503	4219510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_019683	TA	3	6	4219536	4219541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_019683	GAG	2	6	4219542	4219547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_019683	TAC	2	6	4219556	4219561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_019683	ATT	2	6	4219649	4219654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_019683	T	6	6	4219676	4219681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_019683	AGA	2	6	4219755	4219760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_019683	TCTT	2	8	4219774	4219781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15070	NC_019683	CA	3	6	4219820	4219825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15071	NC_019683	AG	3	6	4219848	4219853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_019683	AAG	2	6	4219862	4219867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_019683	ATT	2	6	4219873	4219878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_019683	AAG	2	6	4229858	4229863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_019683	TAAA	2	8	4229874	4229881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_019683	TAG	2	6	4229906	4229911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_019683	TA	3	6	4229925	4229930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_019683	TGA	2	6	4230886	4230891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_019683	CTTA	2	8	4230894	4230901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15080	NC_019683	GATA	2	8	4230915	4230922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_019683	TTC	2	6	4233995	4234000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_019683	CAA	2	6	4234016	4234021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_019683	AT	3	6	4235703	4235708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_019683	CAATC	2	10	4235794	4235803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15085	NC_019683	GAT	2	6	4235824	4235829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_019683	TAC	2	6	4235841	4235846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_019683	AGTC	2	8	4235855	4235862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15088	NC_019683	TTC	2	6	4235884	4235889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_019683	ATT	2	6	4235908	4235913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_019683	TAG	2	6	4235934	4235939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_019683	TACC	2	8	4236008	4236015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15092	NC_019683	GAA	2	6	4236022	4236027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_019683	CATT	2	8	4236073	4236080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15094	NC_019683	AAC	2	6	4236101	4236106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_019683	GTA	2	6	4236163	4236168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_019683	TATC	2	8	4236194	4236201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15097	NC_019683	AAC	2	6	4236229	4236234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_019683	AAT	3	9	4236295	4236303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_019683	GA	3	6	4236380	4236385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_019683	ATC	2	6	4236399	4236404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_019683	AAT	2	6	4236457	4236462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_019683	ATG	2	6	4236527	4236532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_019683	CAT	2	6	4236575	4236580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_019683	AGT	2	6	4236624	4236629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_019683	TGA	2	6	4237647	4237652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_019683	A	6	6	4237735	4237740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_019683	ACT	2	6	4237790	4237795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_019683	TAAG	3	12	4237799	4237810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_019683	GTTT	2	8	4237811	4237818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_019683	TC	3	6	4237840	4237845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15111	NC_019683	AG	3	6	4237853	4237858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_019683	TCA	2	6	4237867	4237872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_019683	A	6	6	4237876	4237881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_019683	TCT	2	6	4237884	4237889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_019683	CAACT	2	10	4239572	4239581	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15116	NC_019683	ATC	2	6	4239590	4239595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_019683	CT	3	6	4239598	4239603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15118	NC_019683	T	8	8	4239603	4239610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_019683	G	6	6	4239611	4239616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_019683	CAA	2	6	4239645	4239650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_019683	AG	3	6	4239675	4239680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_019683	ACT	2	6	4239681	4239686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_019683	GAA	2	6	4241657	4241662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_019683	CAT	2	6	4241689	4241694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15125	NC_019683	T	6	6	4241714	4241719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_019683	TGA	2	6	4241738	4241743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_019683	TTTG	2	8	4250494	4250501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15129	NC_019683	AGT	2	6	4250551	4250556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15392	NC_019683	TCA	2	6	4328059	4328064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15393	NC_019683	GAT	2	6	4328070	4328075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_019683	T	7	7	4328155	4328161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15395	NC_019683	AAGT	2	8	4328172	4328179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15396	NC_019683	GAGT	2	8	4328197	4328204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15397	NC_019683	CAT	2	6	4328261	4328266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15399	NC_019683	TA	3	6	4328388	4328393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15400	NC_019683	CCA	2	6	4329004	4329009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15452	NC_019683	GAG	2	6	4338797	4338802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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