MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 4975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018673	CGG	2	6	148572	148577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_018673	TC	3	6	148593	148598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_018673	GTAT	2	8	148660	148667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018673	AG	3	6	148717	148722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018673	GA	3	6	148724	148729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018673	CAA	2	6	151785	151790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018673	T	8	8	151802	151809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018673	GTA	2	6	151815	151820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018673	AGT	2	6	151829	151834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018673	T	7	7	154094	154100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018673	CACAA	2	10	156458	156467	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
512	NC_018673	GAT	2	6	156491	156496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018673	TAA	3	9	156498	156506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018673	T	6	6	157784	157789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018673	ATG	2	6	157791	157796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018673	G	6	6	159334	159339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018673	AG	3	6	159342	159347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018673	GAAA	2	8	159359	159366	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018673	GA	3	6	159373	159378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018673	AGA	2	6	159414	159419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018673	AAG	2	6	159455	159460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018673	ATAGT	2	10	159502	159511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018673	AGCG	2	8	159544	159551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_018673	GAG	2	6	159556	159561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018673	ATA	2	6	159611	159616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018673	ACA	2	6	159631	159636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018673	TGT	3	9	159680	159688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018673	TAA	2	6	159698	159703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018673	AACA	2	8	159731	159738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_018673	GGC	2	6	159847	159852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018673	AGTG	2	8	159905	159912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018673	TTAG	2	8	160060	160067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018673	TGG	2	6	160069	160074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018673	ATG	2	6	160095	160100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018673	GA	3	6	160113	160118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018673	CGC	2	6	160214	160219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_018673	GT	3	6	160220	160225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018673	TGT	2	6	160253	160258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018673	GAA	2	6	160263	160268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018673	TACCA	2	10	160302	160311	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
541	NC_018673	CAG	2	6	160335	160340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018673	AGCG	2	8	160390	160397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_018673	GGTT	2	8	160403	160410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018673	AT	3	6	160520	160525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018673	GAA	2	6	160527	160532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018673	GCG	2	6	160538	160543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018673	GGC	2	6	160546	160551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_018673	AGG	2	6	160651	160656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018673	GAA	2	6	160790	160795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018673	GGT	2	6	160865	160870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018673	GTC	3	9	160876	160884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_018673	TCGTG	2	10	160888	160897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
553	NC_018673	GGA	2	6	160991	160996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018673	GAC	2	6	161004	161009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018673	ATC	2	6	161015	161020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018673	AC	3	6	161042	161047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018673	CGC	2	6	161181	161186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_018673	AC	3	6	161211	161216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_018673	AGG	2	6	161270	161275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018673	CCT	2	6	161352	161357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_018673	GCA	2	6	161557	161562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018673	TAA	2	6	161608	161613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018673	ACA	2	6	161640	161645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018673	A	6	6	161647	161652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018673	GTTAA	2	10	161733	161742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018673	GTG	2	6	161752	161757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018673	TAAC	2	8	161790	161797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_018673	AT	3	6	161888	161893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018673	AGC	2	6	161936	161941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_018673	AGAA	2	8	161948	161955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018673	GCG	2	6	161974	161979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018673	AT	3	6	162035	162040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018673	ACG	2	6	162289	162294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018673	AAG	2	6	162300	162305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018673	TGT	2	6	162435	162440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018673	A	6	6	162521	162526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_018673	AT	3	6	162783	162788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018673	AGC	2	6	162842	162847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_018673	ACT	2	6	162994	162999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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583	NC_018673	AGG	2	6	163202	163207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018673	GA	3	6	163420	163425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_018673	TAGG	2	8	163864	163871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018673	TAC	2	6	163919	163924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018673	CCT	2	6	164007	164012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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591	NC_018673	GGT	2	6	164143	164148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018673	CGT	2	6	164338	164343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018673	GAG	2	6	164387	164392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018673	GTT	2	6	164441	164446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018673	GAGAT	2	10	164522	164531	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018673	GAT	2	6	164565	164570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_018673	AGT	2	6	164816	164821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018673	GCTG	2	8	164831	164838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_018673	ACA	2	6	164882	164887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018673	AG	3	6	164895	164900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018673	AGT	2	6	165204	165209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018673	TGG	2	6	165235	165240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018673	AT	3	6	165359	165364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018673	AGG	2	6	165406	165411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_018673	GTC	2	6	165568	165573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018673	AGA	2	6	165598	165603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018673	C	6	6	165665	165670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
611	NC_018673	CAA	2	6	165754	165759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018673	ACT	2	6	165772	165777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_018673	TCG	2	6	165931	165936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_018673	GCCT	2	8	166009	166016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_018673	CGG	2	6	166127	166132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_018673	T	7	7	166384	166390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018673	TTA	2	6	166442	166447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018673	GTT	2	6	166476	166481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018673	TGA	2	6	166485	166490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018673	ACA	2	6	166494	166499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_018673	TAGT	2	8	166524	166531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018673	GTC	2	6	166547	166552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_018673	GAT	2	6	166563	166568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018673	TA	3	6	166575	166580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018673	AT	3	6	166589	166594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018673	GGT	2	6	166603	166608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018673	T	6	6	166638	166643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018673	AT	3	6	168049	168054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018673	T	7	7	168069	168075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018673	TTA	2	6	168095	168100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018673	ATT	2	6	168156	168161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018673	TG	3	6	168220	168225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018673	GAA	2	6	170803	170808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018673	ATT	2	6	171880	171885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018673	TATAA	2	10	171908	171917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018673	TGG	2	6	175042	175047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018673	TAAAA	2	10	175095	175104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_018673	ATTCTG	2	12	175212	175223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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922	NC_018673	CTA	2	6	280367	280372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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932	NC_018673	TTAT	2	8	281619	281626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
933	NC_018673	GTA	2	6	281665	281670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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943	NC_018673	TAT	2	6	285783	285788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_018673	ATT	2	6	286354	286359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_018673	ATA	2	6	286419	286424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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966	NC_018673	GTG	2	6	286775	286780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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