MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 4975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018673	CTT	2	6	1531670	1531675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_018673	A	7	7	1531689	1531695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018673	TCA	2	6	1531782	1531787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_018673	CTA	2	6	1531794	1531799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_018673	TA	3	6	1531842	1531847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018673	TA	3	6	1531872	1531877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_018673	A	6	6	1531974	1531979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_018673	ATGA	2	8	1531994	1532001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018673	TACA	2	8	1532066	1532073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_018673	TTA	2	6	1533534	1533539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_018673	TAAA	2	8	1534234	1534241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_018673	TTTAT	2	10	1534278	1534287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018673	A	6	6	1534310	1534315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018673	T	6	6	1534356	1534361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018673	TA	3	6	1534386	1534391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018673	TTG	2	6	1534402	1534407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_018673	ATT	2	6	1534433	1534438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_018673	A	6	6	1536145	1536150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_018673	ATATTT	2	12	1536177	1536188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_018673	AATT	2	8	1536249	1536256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018673	TGA	2	6	1536282	1536287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_018673	T	6	6	1536331	1536336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_018673	ATT	2	6	1536343	1536348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_018673	ATG	2	6	1536364	1536369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018673	TAT	2	6	1536372	1536377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_018673	TAT	3	9	1536416	1536424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_018673	CAT	2	6	1536432	1536437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4529	NC_018673	ATTA	2	8	1536481	1536488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_018673	AACC	2	8	1536512	1536519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_018673	T	6	6	1536564	1536569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_018673	CTT	2	6	1536570	1536575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_018673	A	6	6	1536584	1536589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_018673	TCT	2	6	1536590	1536595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4536	NC_018673	TTTA	2	8	1536656	1536663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_018673	TGT	2	6	1536668	1536673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4539	NC_018673	TAA	2	6	1536738	1536743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_018673	ATT	2	6	1536757	1536762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_018673	ATC	2	6	1536778	1536783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4543	NC_018673	GGT	2	6	1536801	1536806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_018673	ATG	2	6	1537814	1537819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_018673	ACAT	2	8	1537866	1537873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_018673	TTTA	2	8	1539435	1539442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_018673	TAAA	2	8	1539460	1539467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_018673	TAA	2	6	1539470	1539475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_018673	TTATT	2	10	1539488	1539497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_018673	A	6	6	1539514	1539519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_018673	TCA	2	6	1539595	1539600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4555	NC_018673	A	6	6	1539650	1539655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_018673	TTA	2	6	1539676	1539681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4558	NC_018673	TTA	2	6	1541107	1541112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_018673	AAT	2	6	1541139	1541144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4561	NC_018673	T	7	7	1542458	1542464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_018673	CCT	2	6	1543354	1543359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_018673	TA	3	6	1543438	1543443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018673	CAT	2	6	1543518	1543523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4569	NC_018673	TTTTA	2	10	1547904	1547913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_018673	GAG	2	6	1548309	1548314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_018673	AAT	2	6	1548315	1548320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4573	NC_018673	ATT	2	6	1548749	1548754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4575	NC_018673	ATT	2	6	1548815	1548820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4584	NC_018673	A	7	7	1550255	1550261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_018673	ATTT	2	8	1554052	1554059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_018673	AAAATT	2	12	1554098	1554109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_018673	GA	4	8	1554143	1554150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_018673	A	6	6	1555168	1555173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_018673	T	8	8	1555194	1555201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_018673	ATC	2	6	1555225	1555230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_018673	TTA	2	6	1555598	1555603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_018673	TCC	2	6	1556980	1556985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_018673	A	6	6	1557001	1557006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_018673	ACA	2	6	1557031	1557036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_018673	ACC	2	6	1557069	1557074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_018673	GTG	3	9	1557133	1557141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_018673	AAT	2	6	1557160	1557165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_018673	AT	3	6	1557164	1557169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_018673	GC	3	6	1557171	1557176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_018673	CAC	2	6	1557219	1557224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_018673	TTTA	2	8	1557269	1557276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_018673	ATT	2	6	1558542	1558547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_018673	AT	3	6	1558558	1558563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_018673	TAA	2	6	1558627	1558632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_018673	AATA	2	8	1558639	1558646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_018673	ATTAA	2	10	1558655	1558664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_018673	A	7	7	1560149	1560155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_018673	A	6	6	1560164	1560169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_018673	T	6	6	1560197	1560202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_018673	TTA	2	6	1562043	1562048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4623	NC_018673	TAA	2	6	1562192	1562197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_018673	AATA	2	8	1562207	1562214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_018673	ATT	2	6	1562231	1562236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4628	NC_018673	ATA	2	6	1562299	1562304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_018673	TC	3	6	1563014	1563019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_018673	TGA	2	6	1563799	1563804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_018673	AAT	2	6	1563824	1563829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.