MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 5066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018649	TCG	2	6	2360744	2360749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_018649	GTT	2	6	2360755	2360760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_018649	GA	3	6	2362009	2362014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018649	GAT	2	6	2362073	2362078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018649	AAT	2	6	2362122	2362127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018649	TAT	2	6	2362177	2362182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018649	GAC	2	6	2362201	2362206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_018649	TCA	2	6	2362213	2362218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_018649	TC	3	6	2362241	2362246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_018649	T	6	6	2362285	2362290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018649	GA	3	6	2362352	2362357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_018649	AAAG	2	8	2362365	2362372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_018649	AGA	2	6	2362399	2362404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018649	TCT	2	6	2362413	2362418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_018649	TTC	2	6	2362427	2362432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018649	GAT	2	6	2362433	2362438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018649	CCT	2	6	2364750	2364755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_018649	C	7	7	2366373	2366379	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5019	NC_018649	GGA	2	6	2368804	2368809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018649	TAA	2	6	2368848	2368853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018649	TC	3	6	2371777	2371782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_018649	GAAA	2	8	2371802	2371809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018649	A	6	6	2371812	2371817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018649	ACG	2	6	2372159	2372164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_018649	A	6	6	2372245	2372250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018649	CA	3	6	2372252	2372257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_018649	GTAAT	2	10	2372263	2372272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018649	T	6	6	2372272	2372277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_018649	TAT	2	6	2372351	2372356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018649	GCCCT	2	10	2372402	2372411	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5031	NC_018649	GAG	2	6	2372412	2372417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018649	CAT	2	6	2372485	2372490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_018649	A	6	6	2372537	2372542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_018649	GA	3	6	2372567	2372572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018649	CCT	2	6	2373033	2373038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_018649	ATCC	2	8	2373158	2373165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_018649	AACA	2	8	2373204	2373211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_018649	TG	3	6	2373985	2373990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018649	CAG	2	6	2374333	2374338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_018649	A	7	7	2374365	2374371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018649	T	6	6	2374390	2374395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018649	T	6	6	2374409	2374414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018649	A	6	6	2378651	2378656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018649	TCCC	2	8	2383684	2383691	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5045	NC_018649	GACC	2	8	2384416	2384423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_018649	GT	3	6	2385394	2385399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018649	CTC	2	6	2388572	2388577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_018649	CCTT	2	8	2388605	2388612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_018649	GAG	2	6	2390357	2390362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018649	AGG	2	6	2392813	2392818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018649	AGG	2	6	2392827	2392832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018649	TCC	2	6	2394336	2394341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_018649	TCCT	2	8	2394361	2394368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_018649	A	6	6	2394513	2394518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018649	T	9	9	2395206	2395214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018649	TG	3	6	2395222	2395227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018649	GGT	2	6	2395234	2395239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018649	CCCT	2	8	2396911	2396918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5059	NC_018649	GA	3	6	2403283	2403288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018649	AT	3	6	2405676	2405681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018649	TGTC	2	8	2405705	2405712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_018649	ATTC	2	8	2405734	2405741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_018649	GTA	2	6	2405813	2405818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018649	ATG	2	6	2405912	2405917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018649	GGT	2	6	2405922	2405927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018649	GGTT	2	8	2405947	2405954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.