MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 10682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_018528	CAC	2	6	2097532	2097537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_018528	GTA	2	6	2097540	2097545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_018528	T	7	7	2097553	2097559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_018528	T	6	6	2097624	2097629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_018528	A	6	6	2097645	2097650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_018528	TG	3	6	2097656	2097661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_018528	TTA	2	6	2097683	2097688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_018528	AAGA	2	8	2097710	2097717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_018528	AAG	2	6	2098379	2098384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_018528	AAT	2	6	2099089	2099094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_018528	AG	3	6	2099119	2099124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_018528	TTCTTT	2	12	2099165	2099176	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10513	NC_018528	TTTG	2	8	2099251	2099258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_018528	GCT	2	6	2099304	2099309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_018528	AGC	2	6	2099346	2099351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_018528	TAA	2	6	2099434	2099439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_018528	ACT	2	6	2099499	2099504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_018528	TCA	2	6	2099565	2099570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_018528	T	6	6	2099574	2099579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_018528	AGC	2	6	2099604	2099609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_018528	CT	3	6	2099615	2099620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_018528	TGAAT	2	10	2099660	2099669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_018528	TCT	2	6	2099833	2099838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_018528	TGA	2	6	2099868	2099873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_018528	TCA	2	6	2099925	2099930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_018528	ATG	2	6	2099972	2099977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_018528	ATA	2	6	2100070	2100075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_018528	AATT	2	8	2100291	2100298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_018528	CTT	2	6	2100318	2100323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_018528	ATA	2	6	2100358	2100363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_018528	ATT	2	6	2100399	2100404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_018528	AC	3	6	2100420	2100425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10533	NC_018528	T	6	6	2100456	2100461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_018528	TCC	2	6	2100478	2100483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_018528	T	6	6	2100484	2100489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_018528	A	6	6	2100498	2100503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_018528	ATA	2	6	2100561	2100566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_018528	AAT	2	6	2101444	2101449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_018528	ATT	2	6	2101489	2101494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_018528	TAG	2	6	2101501	2101506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_018528	ATA	2	6	2101513	2101518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_018528	A	6	6	2101518	2101523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_018528	TAT	2	6	2101526	2101531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_018528	TAA	2	6	2101538	2101543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_018528	GA	5	10	2101623	2101632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_018528	GAAT	2	8	2102946	2102953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_018528	AAAG	2	8	2102956	2102963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_018528	A	6	6	2102980	2102985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_018528	T	6	6	2103002	2103007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_018528	AATC	2	8	2104257	2104264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_018528	CCT	2	6	2105091	2105096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_018528	ATT	2	6	2105196	2105201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_018528	TTAA	2	8	2105220	2105227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_018528	TA	3	6	2105238	2105243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_018528	CAAAA	2	10	2106749	2106758	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10556	NC_018528	AGT	2	6	2106764	2106769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_018528	A	7	7	2106782	2106788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_018528	ATT	2	6	2106861	2106866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_018528	TTTC	2	8	2106890	2106897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10560	NC_018528	GAA	2	6	2106965	2106970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_018528	AGA	2	6	2106991	2106996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_018528	TCAA	2	8	2107005	2107012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_018528	AGA	3	9	2107041	2107049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_018528	AGC	2	6	2107155	2107160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10566	NC_018528	AAG	2	6	2107276	2107281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_018528	ATG	2	6	2107294	2107299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_018528	AAG	2	6	2107311	2107316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_018528	AG	3	6	2107434	2107439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_018528	GTC	2	6	2107471	2107476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10572	NC_018528	AT	3	6	2107502	2107507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_018528	ATC	2	6	2107539	2107544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_018528	TGG	2	6	2107556	2107561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_018528	TGA	2	6	2107586	2107591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10577	NC_018528	AAG	2	6	2107938	2107943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10585	NC_018528	ATC	2	6	2109822	2109827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10591	NC_018528	ACTT	2	8	2110566	2110573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10592	NC_018528	A	6	6	2110594	2110599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_018528	TA	3	6	2110634	2110639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_018528	TCG	2	6	2110640	2110645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10596	NC_018528	T	6	6	2110772	2110777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10599	NC_018528	T	7	7	2112140	2112146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_018528	TTA	2	6	2112159	2112164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_018528	TCTT	2	8	2112475	2112482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10602	NC_018528	T	7	7	2112481	2112487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_018528	AGG	2	6	2112545	2112550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10605	NC_018528	ATTAT	2	10	2115666	2115675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_018528	ATTA	2	8	2115679	2115686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_018528	AAGC	2	8	2115701	2115708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_018528	TGCT	2	8	2115711	2115718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10609	NC_018528	ATA	2	6	2115729	2115734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_018528	A	6	6	2115750	2115755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_018528	TGA	2	6	2115813	2115818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_018528	GTG	2	6	2115824	2115829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_018528	AT	3	6	2115895	2115900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_018528	ATTG	2	8	2115943	2115950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_018528	CT	3	6	2115980	2115985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_018528	GAATCG	2	12	2116092	2116103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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10618	NC_018528	CATA	2	8	2116227	2116234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10619	NC_018528	ATT	2	6	2116307	2116312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_018528	ATT	2	6	2116318	2116323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_018528	CTT	2	6	2116330	2116335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_018528	A	6	6	2116382	2116387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_018528	TAA	2	6	2116390	2116395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_018528	ATC	2	6	2116397	2116402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10625	NC_018528	GAA	3	9	2116436	2116444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_018528	AGA	2	6	2116447	2116452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_018528	TAG	2	6	2116510	2116515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_018528	TCT	2	6	2116522	2116527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10630	NC_018528	GAAT	2	8	2116588	2116595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.