MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 10682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018528	AAG	2	6	990619	990624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018528	CCCTG	2	10	990657	990666	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5003	NC_018528	TAT	2	6	990682	990687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018528	TGA	2	6	990771	990776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018528	CAA	2	6	990826	990831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_018528	TTAA	2	8	990836	990843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018528	TC	3	6	990920	990925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_018528	ATG	2	6	990981	990986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018528	TGA	2	6	990993	990998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_018528	TGA	2	6	991173	991178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018528	CCT	2	6	991181	991186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_018528	CTT	2	6	992141	992146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_018528	ATC	2	6	992217	992222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_018528	CTT	2	6	992224	992229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_018528	AG	3	6	992262	992267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_018528	TGCC	2	8	992278	992285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_018528	CTTCT	2	10	992366	992375	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5018	NC_018528	TTC	2	6	992417	992422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_018528	TTG	2	6	992446	992451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018528	GAAT	2	8	992455	992462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018528	ATG	2	6	992502	992507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018528	CAA	2	6	992535	992540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_018528	TCA	2	6	992549	992554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_018528	TGAT	2	8	992630	992637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018528	CAAA	2	8	993601	993608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_018528	A	6	6	993606	993611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_018528	TTTC	2	8	993642	993649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_018528	ATT	2	6	993912	993917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_018528	AGTT	2	8	993954	993961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018528	T	7	7	996735	996741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018528	CAATA	2	10	996850	996859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5032	NC_018528	AGT	2	6	996862	996867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018528	TAA	2	6	996877	996882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_018528	ATGA	2	8	997542	997549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018528	AATT	2	8	997557	997564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018528	GATTG	2	10	997602	997611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018528	A	7	7	997615	997621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018528	AGAA	2	8	997630	997637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018528	ATGA	2	8	997648	997655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018528	TCAA	2	8	997685	997692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_018528	T	6	6	997707	997712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018528	TAT	2	6	997831	997836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018528	TCA	2	6	997902	997907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_018528	AGC	2	6	997928	997933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_018528	AAG	2	6	998219	998224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018528	ACT	2	6	998231	998236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_018528	TCATG	2	10	998400	998409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5048	NC_018528	AAT	2	6	998451	998456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018528	CCAA	2	8	998636	998643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_018528	A	6	6	998829	998834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018528	A	6	6	998837	998842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018528	GAA	2	6	998900	998905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018528	ACTA	2	8	998922	998929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_018528	ATAA	2	8	998935	998942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018528	T	6	6	998988	998993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018528	TA	3	6	999287	999292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018528	CTT	2	6	999302	999307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_018528	ATT	2	6	999343	999348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_018528	T	6	6	999373	999378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018528	GAA	2	6	999409	999414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018528	T	6	6	1000331	1000336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018528	ATCT	2	8	1000836	1000843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_018528	T	6	6	1000860	1000865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018528	AT	3	6	1000869	1000874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018528	TCA	2	6	1000879	1000884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_018528	GAC	2	6	1000931	1000936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_018528	ATTG	2	8	1000941	1000948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_018528	GTT	2	6	1000954	1000959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018528	TAA	2	6	1000967	1000972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018528	AT	3	6	1001198	1001203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018528	TGT	2	6	1001212	1001217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018528	TAA	2	6	1001235	1001240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018528	A	6	6	1002598	1002603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_018528	CA	3	6	1002717	1002722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_018528	AAC	2	6	1002766	1002771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_018528	A	6	6	1002777	1002782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_018528	ATT	2	6	1002819	1002824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_018528	TA	4	8	1003834	1003841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018528	A	6	6	1006641	1006646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018528	A	6	6	1006653	1006658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018528	TAA	2	6	1006682	1006687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018528	ATTT	2	8	1006695	1006702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018528	A	6	6	1007698	1007703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018528	TA	3	6	1007723	1007728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_018528	AGA	2	6	1007729	1007734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_018528	T	7	7	1007736	1007742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_018528	T	7	7	1007768	1007774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_018528	ATTT	2	8	1007840	1007847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_018528	ATT	2	6	1007889	1007894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018528	GA	3	6	1007912	1007917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018528	GAT	2	6	1009335	1009340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018528	ATC	2	6	1009362	1009367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_018528	T	7	7	1009368	1009374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_018528	ATT	2	6	1009385	1009390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_018528	CTT	2	6	1009499	1009504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_018528	TCTT	2	8	1009507	1009514	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_018528	TCA	2	6	1009761	1009766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_018528	TGAT	2	8	1009791	1009798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018528	CATC	2	8	1009819	1009826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_018528	CTT	2	6	1009888	1009893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_018528	TCA	2	6	1010025	1010030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_018528	ATTA	2	8	1010066	1010073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_018528	CAT	2	6	1010146	1010151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_018528	AAC	2	6	1010218	1010223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_018528	AAT	2	6	1010245	1010250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018528	TGAG	2	8	1010259	1010266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_018528	TA	3	6	1010304	1010309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018528	CCG	2	6	1010384	1010389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_018528	CCA	2	6	1010408	1010413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_018528	AT	3	6	1010444	1010449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018528	AAG	2	6	1010520	1010525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018528	AGC	2	6	1010540	1010545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_018528	CCAG	2	8	1010605	1010612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_018528	AAC	2	6	1010662	1010667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_018528	CTT	2	6	1010676	1010681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_018528	ATTGA	2	10	1010728	1010737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_018528	TAA	2	6	1010766	1010771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018528	ATC	2	6	1010812	1010817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_018528	TTGA	2	8	1010818	1010825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_018528	ATT	2	6	1010840	1010845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_018528	TC	3	6	1010848	1010853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_018528	TA	3	6	1010859	1010864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_018528	TGT	2	6	1010868	1010873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_018528	TTAA	2	8	1010879	1010886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_018528	TTA	2	6	1010897	1010902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_018528	ATTT	2	8	1010938	1010945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_018528	CAAA	2	8	1010956	1010963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_018528	A	7	7	1010961	1010967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_018528	TCCA	2	8	1010983	1010990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_018528	TCATT	2	10	1011143	1011152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5131	NC_018528	TCT	2	6	1011155	1011160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_018528	AT	3	6	1011189	1011194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_018528	TTTA	2	8	1011201	1011208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_018528	AAT	2	6	1011219	1011224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_018528	TA	3	6	1011425	1011430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_018528	TAT	2	6	1011465	1011470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_018528	TAC	2	6	1011580	1011585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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