MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 9303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017728	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017728	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017728	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017728	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017728	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017728	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017728	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017728	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017728	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017728	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017728	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017728	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017728	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017728	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017728	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017728	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017728	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017728	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017728	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017728	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017728	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017728	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017728	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017728	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017728	AAC	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017728	GTT	2	6	15914	15919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017728	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017728	ATA	2	6	16210	16215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017728	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017728	T	6	6	16247	16252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017728	ACC	3	9	16271	16279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017728	CAAA	2	8	16289	16296	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017728	T	7	7	16325	16331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017728	C	6	6	16384	16389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_017728	CAA	2	6	16408	16413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017728	CCA	2	6	16445	16450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017728	TA	3	6	16466	16471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017728	T	6	6	16475	16480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017728	AAG	2	6	16490	16495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017728	TAT	2	6	16529	16534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017728	TCA	2	6	16566	16571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017728	ATCT	2	8	16595	16602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017728	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017728	AATT	2	8	16706	16713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017728	AAT	2	6	16721	16726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017728	TTC	2	6	16730	16735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017728	T	6	6	16759	16764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017728	CCAA	2	8	16790	16797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017728	ATC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017728	TCA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017728	TTG	2	6	16874	16879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017728	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017728	ATT	2	6	16895	16900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017728	TAT	2	6	16915	16920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017728	A	6	6	16939	16944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017728	AACC	2	8	17013	17020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017728	TAT	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017728	ATA	2	6	17048	17053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017728	TTG	2	6	17062	17067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017728	ATT	2	6	17082	17087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017728	AATT	2	8	17123	17130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017728	ATA	2	6	17297	17302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017728	CCAA	2	8	17507	17514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017728	CT	3	6	17567	17572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017728	T	7	7	17588	17594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017728	AAG	2	6	17599	17604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017728	AAT	2	6	17641	17646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017728	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017728	GTT	2	6	17736	17741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017728	CAT	2	6	17798	17803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017728	ATC	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017728	TAT	2	6	17879	17884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017728	ATT	2	6	17927	17932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017728	T	6	6	17931	17936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017728	A	6	6	17943	17948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017728	T	6	6	17993	17998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017728	AT	3	6	18057	18062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017728	A	6	6	18146	18151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017728	T	7	7	18161	18167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017728	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017728	CTT	2	6	18221	18226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017728	G	6	6	19411	19416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017728	CTC	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017728	T	8	8	23581	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017728	A	6	6	23643	23648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017728	ATT	2	6	23655	23660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017728	GAG	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017728	TCA	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017728	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017728	TTA	2	6	26154	26159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017728	A	6	6	26202	26207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017728	CG	3	6	26246	26251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017728	AAG	2	6	27926	27931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017728	GGA	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017728	ATT	2	6	30304	30309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017728	T	6	6	30317	30322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017728	GGA	2	6	30323	30328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017728	AAAT	2	8	30985	30992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017728	A	8	8	31000	31007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017728	AT	3	6	31032	31037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017728	TCA	2	6	31043	31048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017728	A	6	6	31149	31154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017728	AGGA	2	8	31163	31170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017728	GTC	2	6	31172	31177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017728	TAA	2	6	33093	33098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017728	T	8	8	35403	35410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017728	TCC	2	6	35438	35443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017728	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017728	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017728	T	6	6	38222	38227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017728	T	6	6	38322	38327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017728	A	6	6	38360	38365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017728	A	7	7	38720	38726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017728	T	7	7	38745	38751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017728	CCTT	2	8	39568	39575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017728	ATA	2	6	40729	40734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017728	CAA	2	6	40788	40793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017728	TCT	2	6	46703	46708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017728	A	7	7	46773	46779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017728	ATG	2	6	46813	46818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017728	AAAT	2	8	46866	46873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017728	AGG	2	6	47928	47933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017728	AGA	2	6	47934	47939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017728	C	6	6	47959	47964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_017728	AGG	2	6	51494	51499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017728	ATAA	2	8	53428	53435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017728	GACTT	2	10	53457	53466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017728	A	7	7	53491	53497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017728	AGTG	2	8	53506	53513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017728	T	7	7	54187	54193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017728	TC	3	6	54207	54212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017728	TTAG	2	8	54239	54246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017728	TGA	2	6	54254	54259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017728	GTTA	2	8	55604	55611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017728	ATA	2	6	55622	55627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017728	ATT	2	6	55649	55654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017728	GCTC	2	8	55659	55666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017728	ATGGT	2	10	55709	55718	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017728	AGG	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017728	ATTC	2	8	56063	56070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017728	GAG	2	6	56099	56104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017728	AGG	2	6	56682	56687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017728	T	6	6	56972	56977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017728	AAG	2	6	57015	57020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017728	TATT	2	8	57032	57039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017728	TA	3	6	57051	57056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017728	A	7	7	57062	57068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017728	T	6	6	57742	57747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017728	ACTT	2	8	57757	57764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017728	AAATA	2	10	57765	57774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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