MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 8479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017545	TGC	2	6	1377329	1377334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017545	T	7	7	1377770	1377776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017545	TAT	2	6	1377791	1377796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017545	A	7	7	1379129	1379135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017545	T	6	6	1379140	1379145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017545	TAA	2	6	1379178	1379183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017545	GAA	2	6	1380331	1380336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017545	AGG	2	6	1380382	1380387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017545	TAC	2	6	1380964	1380969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017545	TTC	2	6	1380982	1380987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017545	T	6	6	1381073	1381078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017545	TAT	2	6	1381087	1381092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017545	AGC	2	6	1383385	1383390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017545	TTGA	2	8	1383786	1383793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017545	T	6	6	1383831	1383836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017545	AAT	2	6	1383840	1383845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017545	T	6	6	1387231	1387236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017545	AT	3	6	1387240	1387245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017545	ATT	2	6	1387296	1387301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017545	AAC	2	6	1387327	1387332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017545	AAT	2	6	1387365	1387370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017545	AC	3	6	1387382	1387387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_017545	GAG	2	6	1387388	1387393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017545	T	6	6	1387610	1387615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017545	T	6	6	1387650	1387655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017545	ATT	2	6	1387667	1387672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017545	TAA	2	6	1387707	1387712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017545	A	6	6	1387728	1387733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017545	T	6	6	1390563	1390568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017545	GAA	2	6	1390603	1390608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017545	TTG	2	6	1391065	1391070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017545	TTGC	2	8	1392786	1392793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_017545	ATT	2	6	1392832	1392837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017545	AAC	2	6	1392851	1392856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017545	T	6	6	1392876	1392881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017545	T	8	8	1392896	1392903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017545	AAT	2	6	1393774	1393779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017545	GGA	2	6	1393895	1393900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017545	AGG	2	6	1394976	1394981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017545	AGG	2	6	1396428	1396433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017545	AGG	2	6	1397439	1397444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017545	GTA	2	6	1399795	1399800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017545	TGC	2	6	1399809	1399814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017545	T	7	7	1399817	1399823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017545	GAG	2	6	1399824	1399829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017545	A	7	7	1399836	1399842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017545	ATA	2	6	1399910	1399915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017545	ACT	2	6	1399951	1399956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017545	T	6	6	1399956	1399961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017545	GAA	2	6	1399975	1399980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017545	CTC	2	6	1399983	1399988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017545	AT	5	10	1400005	1400014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017545	CTTA	2	8	1400015	1400022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_017545	GAA	2	6	1400070	1400075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017545	A	7	7	1401189	1401195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017545	AAT	2	6	1401200	1401205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017545	GATT	2	8	1401209	1401216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017545	AAG	2	6	1401225	1401230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017545	ATG	2	6	1401250	1401255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017545	TAA	2	6	1401303	1401308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017545	GAA	2	6	1401318	1401323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017545	T	6	6	1402786	1402791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017545	A	8	8	1402827	1402834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017545	TTA	2	6	1402859	1402864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017545	GTT	2	6	1402865	1402870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4067	NC_017545	TCC	2	6	1405942	1405947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_017545	AAT	2	6	1405958	1405963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017545	ACT	2	6	1406317	1406322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017545	T	7	7	1406660	1406666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017545	TAA	2	6	1406718	1406723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017545	TAT	2	6	1406727	1406732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017545	GGA	2	6	1407119	1407124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017545	GCT	2	6	1408215	1408220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017545	T	7	7	1408240	1408246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017545	AAT	2	6	1409246	1409251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017545	ATACT	2	10	1409273	1409282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_017545	CTT	2	6	1409327	1409332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017545	TTA	2	6	1409375	1409380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017545	TGA	2	6	1409402	1409407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017545	AT	3	6	1410400	1410405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017545	T	6	6	1410426	1410431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017545	TTTG	2	8	1410446	1410453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017545	TAA	2	6	1410499	1410504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017545	A	7	7	1410512	1410518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017545	TGGG	2	8	1410523	1410530	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017545	ATT	2	6	1413701	1413706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017545	TAT	2	6	1413712	1413717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017545	A	7	7	1413796	1413802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017545	TTAT	3	12	1413865	1413876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017545	CATA	2	8	1413951	1413958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_017545	TGTT	2	8	1413979	1413986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017545	CTAA	2	8	1414000	1414007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_017545	TC	3	6	1414015	1414020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_017545	TAT	2	6	1415168	1415173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017545	A	8	8	1415190	1415197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017545	AAT	2	6	1415247	1415252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017545	AATG	2	8	1415277	1415284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017545	AAATA	2	10	1415293	1415302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017545	T	6	6	1415313	1415318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017545	CATA	2	8	1415347	1415354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_017545	TAA	2	6	1415362	1415367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017545	ACA	2	6	1415379	1415384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017545	AAC	2	6	1415415	1415420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017545	A	6	6	1415429	1415434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017545	CTT	2	6	1415443	1415448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017545	GGA	2	6	1415451	1415456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017545	GGC	2	6	1415469	1415474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017545	GA	3	6	1415482	1415487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017545	CG	3	6	1415490	1415495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_017545	GAC	2	6	1415522	1415527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017545	GAA	2	6	1415537	1415542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017545	T	7	7	1419111	1419117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017545	TG	3	6	1419130	1419135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017545	CAA	2	6	1419139	1419144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017545	T	7	7	1421766	1421772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017545	A	6	6	1421778	1421783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017545	A	7	7	1422584	1422590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017545	T	6	6	1423599	1423604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017545	A	6	6	1423628	1423633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017545	GA	3	6	1423635	1423640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017545	A	7	7	1424230	1424236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017545	TG	3	6	1424246	1424251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017545	T	7	7	1424253	1424259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017545	A	6	6	1424266	1424271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017545	TAG	2	6	1425548	1425553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017545	A	7	7	1425572	1425578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017545	ATGA	2	8	1425585	1425592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017545	A	6	6	1425594	1425599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017545	GAA	2	6	1425636	1425641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017545	AGC	2	6	1425642	1425647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017545	A	6	6	1425665	1425670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017545	TGCT	2	8	1425692	1425699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4135	NC_017545	GA	4	8	1425754	1425761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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