MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 8479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017545	T	7	7	2794399	2794405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017545	T	6	6	2794410	2794415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017545	TCC	2	6	2794427	2794432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_017545	TCC	2	6	2797839	2797844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_017545	T	6	6	2797845	2797850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017545	ATG	2	6	2797860	2797865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017545	TCC	2	6	2798181	2798186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_017545	TAAT	2	8	2798187	2798194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017545	TGC	2	6	2798195	2798200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_017545	TCC	2	6	2798702	2798707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_017545	TTCT	2	8	2798713	2798720	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_017545	CCT	2	6	2800805	2800810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_017545	TAAATC	2	12	2800825	2800836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8014	NC_017545	TAA	2	6	2800837	2800842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017545	CAT	2	6	2800886	2800891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_017545	T	6	6	2800909	2800914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017545	AGGT	2	8	2800990	2800997	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017545	GTT	2	6	2801050	2801055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017545	TCT	2	6	2801056	2801061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_017545	TTCT	2	8	2801084	2801091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_017545	A	6	6	2801103	2801108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017545	A	7	7	2801115	2801121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017545	A	6	6	2801134	2801139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017545	CTT	2	6	2803683	2803688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_017545	TTTA	2	8	2803692	2803699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017545	AGG	2	6	2804250	2804255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017545	T	6	6	2804757	2804762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017545	TTA	2	6	2804772	2804777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017545	TAA	2	6	2804841	2804846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017545	TA	3	6	2804867	2804872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017545	TCA	2	6	2804906	2804911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017545	TCC	2	6	2807344	2807349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8033	NC_017545	ACA	2	6	2815122	2815127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017545	ATAAA	2	10	2815129	2815138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017545	CAA	2	6	2815144	2815149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017545	GAT	2	6	2815159	2815164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017545	AAC	2	6	2815180	2815185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017545	CCA	2	6	2815221	2815226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_017545	CAA	2	6	2815237	2815242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_017545	TG	3	6	2815303	2815308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017545	AC	3	6	2815317	2815322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_017545	A	7	7	2815323	2815329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017545	A	6	6	2815344	2815349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017545	AT	3	6	2815400	2815405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017545	AGG	2	6	2815431	2815436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017545	AAT	2	6	2815438	2815443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017545	AGCT	3	12	2815766	2815777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_017545	A	6	6	2815787	2815792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017545	TAA	2	6	2815807	2815812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017545	A	6	6	2815868	2815873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017545	A	6	6	2817523	2817528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017545	GTC	2	6	2817535	2817540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_017545	T	7	7	2817552	2817558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017545	T	7	7	2817606	2817612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017545	ATTT	2	8	2817614	2817621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017545	TTAG	2	8	2817631	2817638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017545	CTT	2	6	2817717	2817722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_017545	AT	3	6	2817727	2817732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017545	ATT	2	6	2817842	2817847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017545	T	7	7	2817846	2817852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017545	TA	3	6	2817930	2817935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017545	TC	3	6	2818507	2818512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_017545	GTTTC	2	10	2818523	2818532	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8064	NC_017545	AT	3	6	2818598	2818603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017545	ATT	2	6	2818652	2818657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017545	GAC	2	6	2818660	2818665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017545	TTCT	2	8	2823489	2823496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_017545	TTC	2	6	2823580	2823585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_017545	TGG	2	6	2823602	2823607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017545	A	7	7	2823656	2823662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017545	ATT	2	6	2823681	2823686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017545	ATA	2	6	2823690	2823695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017545	A	7	7	2823702	2823708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017545	TAT	2	6	2823933	2823938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017545	TTTA	2	8	2824008	2824015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017545	TAAG	2	8	2824614	2824621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017545	ATCA	2	8	2824686	2824693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_017545	TAA	2	6	2824712	2824717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017545	T	7	7	2826602	2826608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017545	ATTAA	2	10	2826609	2826618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017545	ATCT	2	8	2826667	2826674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8082	NC_017545	AT	4	8	2826760	2826767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017545	CA	3	6	2826835	2826840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_017545	AAT	2	6	2826898	2826903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017545	CTT	2	6	2826967	2826972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_017545	TAA	2	6	2826976	2826981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017545	TATT	2	8	2826982	2826989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017545	TAA	2	6	2827364	2827369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017545	GTT	2	6	2827378	2827383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017545	T	6	6	2827385	2827390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017545	TGAT	2	8	2827413	2827420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017545	T	6	6	2827420	2827425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017545	TTTA	2	8	2827466	2827473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017545	TTG	2	6	2827499	2827504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_017545	TGT	2	6	2827557	2827562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8098	NC_017545	CT	3	6	2827609	2827614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_017545	TG	3	6	2827691	2827696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017545	TA	3	6	2827738	2827743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017545	T	6	6	2827767	2827772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017545	TAA	2	6	2827778	2827783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017545	ATAA	2	8	2827869	2827876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017545	TGA	2	6	2827910	2827915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017545	ATA	2	6	2828018	2828023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017545	TTTA	2	8	2828037	2828044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017545	GA	3	6	2828058	2828063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017545	ATAG	2	8	2828076	2828083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017545	TC	3	6	2828090	2828095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_017545	GAG	2	6	2828769	2828774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017545	TAT	2	6	2828795	2828800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017545	TAA	2	6	2828825	2828830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017545	TCA	2	6	2828848	2828853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_017545	ATTT	2	8	2828872	2828879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017545	ATCT	2	8	2829356	2829363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8116	NC_017545	T	7	7	2829363	2829369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017545	TAT	2	6	2829371	2829376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017545	CAAA	2	8	2829379	2829386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8119	NC_017545	TTTCC	2	10	2830077	2830086	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8120	NC_017545	TC	3	6	2831522	2831527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_017545	TAA	2	6	2831601	2831606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017545	AGG	2	6	2831668	2831673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017545	T	6	6	2831674	2831679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017545	GGA	2	6	2832683	2832688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017545	T	6	6	2833711	2833716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017545	ATT	2	6	2833730	2833735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017545	A	7	7	2834663	2834669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017545	A	7	7	2834725	2834731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017545	A	6	6	2835587	2835592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017545	T	6	6	2835608	2835613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017545	TGT	2	6	2835615	2835620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017545	TAA	2	6	2835678	2835683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017545	AGG	2	6	2835692	2835697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.