MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 8189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017544	CGC	2	6	2820006	2820011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_017544	T	7	7	2820049	2820055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017544	TGT	3	9	2820058	2820066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017544	A	6	6	2820072	2820077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017544	T	6	6	2820082	2820087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017544	TCC	2	6	2820101	2820106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_017544	AAAT	2	8	2820138	2820145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017544	AT	3	6	2820154	2820159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017544	A	6	6	2820222	2820227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017544	A	7	7	2820345	2820351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017544	TTAACT	2	12	2820425	2820436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8012	NC_017544	ATTT	2	8	2820439	2820446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017544	CCA	2	6	2820506	2820511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_017544	AT	3	6	2820531	2820536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017544	A	6	6	2820556	2820561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017544	CCA	2	6	2820633	2820638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_017544	T	7	7	2820656	2820662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017544	ATAA	2	8	2820668	2820675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017544	ATT	2	6	2820676	2820681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017544	T	6	6	2820690	2820695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017544	A	6	6	2821888	2821893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017544	TTTA	2	8	2821927	2821934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017544	TCA	2	6	2821939	2821944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_017544	TA	3	6	2821959	2821964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017544	TA	3	6	2821968	2821973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017544	A	6	6	2822006	2822011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017544	TAA	2	6	2822569	2822574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017544	ATT	2	6	2822595	2822600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017544	AATT	2	8	2822629	2822636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017544	TA	4	8	2822662	2822669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017544	A	9	9	2822775	2822783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017544	AC	3	6	2822794	2822799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_017544	TA	4	8	2823935	2823942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017544	T	6	6	2823990	2823995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017544	TAT	2	6	2824006	2824011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017544	CAAA	2	8	2824022	2824029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8037	NC_017544	CCAC	2	8	2824033	2824040	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8038	NC_017544	A	6	6	2824042	2824047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017544	CTC	2	6	2826676	2826681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_017544	A	6	6	2826688	2826693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017544	A	6	6	2827003	2827008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017544	TCC	2	6	2827010	2827015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_017544	T	6	6	2828314	2828319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017544	CCT	2	6	2828323	2828328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_017544	CTTT	2	8	2828352	2828359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_017544	TAAA	2	8	2828364	2828371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017544	A	7	7	2828411	2828417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017544	TC	3	6	2828432	2828437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_017544	A	6	6	2828439	2828444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017544	CTC	2	6	2830389	2830394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_017544	AATT	2	8	2830400	2830407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017544	TAG	2	6	2830466	2830471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017544	A	6	6	2830552	2830557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017544	TA	3	6	2832060	2832065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017544	TAA	2	6	2832098	2832103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017544	TTA	2	6	2832104	2832109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017544	GA	3	6	2832138	2832143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017544	GA	3	6	2832184	2832189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017544	A	6	6	2835142	2835147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017544	TCC	2	6	2835173	2835178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_017544	CTC	2	6	2836056	2836061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_017544	A	7	7	2836122	2836128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017544	TTA	2	6	2836158	2836163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017544	A	6	6	2836177	2836182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017544	TCT	2	6	2838085	2838090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_017544	AAAT	2	8	2838131	2838138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017544	TAAAA	2	10	2838216	2838225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017544	A	7	7	2838222	2838228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017544	CAAC	2	8	2838230	2838237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_017544	T	6	6	2839055	2839060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017544	AAATC	2	10	2839102	2839111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8072	NC_017544	GTT	2	6	2839124	2839129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017544	T	6	6	2839134	2839139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017544	A	6	6	2839146	2839151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017544	TCCT	2	8	2840349	2840356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_017544	AT	3	6	2840382	2840387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017544	A	6	6	2840469	2840474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017544	TAGA	2	8	2840475	2840482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017544	GCT	2	6	2840483	2840488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_017544	CTAT	2	8	2840503	2840510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8081	NC_017544	TTC	2	6	2842211	2842216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_017544	TCC	2	6	2843356	2843361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_017544	AAG	2	6	2843393	2843398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017544	TG	3	6	2844839	2844844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017544	CTC	3	9	2846575	2846583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_017544	AAATGA	2	12	2846660	2846671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017544	A	6	6	2846712	2846717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017544	GTT	3	9	2846722	2846730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017544	T	6	6	2846762	2846767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017544	T	6	6	2847489	2847494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017544	ATT	2	6	2847588	2847593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017544	AAGTAT	2	12	2847597	2847608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017544	TGT	2	6	2849950	2849955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017544	CTTT	2	8	2850003	2850010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_017544	T	8	8	2850008	2850015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017544	GTTT	2	8	2850028	2850035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017544	TTAG	2	8	2850042	2850049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017544	TAT	2	6	2850432	2850437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017544	TGT	2	6	2850464	2850469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017544	CTTT	2	8	2850518	2850525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_017544	T	6	6	2850523	2850528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017544	CAGAGA	2	12	2850529	2850540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8103	NC_017544	CTT	2	6	2850547	2850552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_017544	T	8	8	2850578	2850585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017544	TCTGAC	2	12	2850591	2850602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_017544	GTCT	2	8	2851031	2851038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8107	NC_017544	TCT	3	9	2851036	2851044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_017544	TTAA	2	8	2851063	2851070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017544	A	6	6	2851078	2851083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017544	ATT	2	6	2851088	2851093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017544	GTA	2	6	2851158	2851163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017544	A	6	6	2853082	2853087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017544	CAA	2	6	2854551	2854556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_017544	TTA	2	6	2854618	2854623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017544	TAA	2	6	2854645	2854650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017544	TAT	2	6	2854662	2854667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017544	AGG	2	6	2854806	2854811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017544	TTGA	2	8	2855660	2855667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017544	T	6	6	2855675	2855680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017544	CT	3	6	2856413	2856418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_017544	TAT	2	6	2856987	2856992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017544	A	6	6	2857003	2857008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017544	A	6	6	2857073	2857078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017544	TAAC	2	8	2857080	2857087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_017544	A	6	6	2857847	2857852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017544	GGA	2	6	2857853	2857858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017544	TCC	2	6	2857878	2857883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_017544	CACTC	2	10	2859092	2859101	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8129	NC_017544	TAT	2	6	2863029	2863034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017544	A	9	9	2863035	2863043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017544	AAG	2	6	2863052	2863057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017544	T	6	6	2863063	2863068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017544	TCT	2	6	2863091	2863096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_017544	A	7	7	2863144	2863150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_017544	TAT	2	6	2865558	2865563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_017544	T	6	6	2865591	2865596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.