MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes M7 chromosome

Total Repeats: 8638

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017537	T	6	6	2907089	2907094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_017537	GTT	2	6	2907158	2907163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_017537	A	6	6	2907179	2907184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_017537	TCCT	2	8	2908391	2908398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_017537	AT	3	6	2908424	2908429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_017537	A	7	7	2908511	2908517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_017537	TAGA	2	8	2908518	2908525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_017537	GCT	2	6	2908526	2908531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_017537	CTAT	2	8	2908546	2908553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8510	NC_017537	TTC	2	6	2910254	2910259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_017537	TCC	2	6	2911399	2911404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8512	NC_017537	AAG	2	6	2911436	2911441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_017537	TG	3	6	2912882	2912887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_017537	CTC	3	9	2914618	2914626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_017537	TATCAA	2	12	2914689	2914700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8516	NC_017537	AAATGA	2	12	2914703	2914714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_017537	A	6	6	2914755	2914760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_017537	TAAAAA	2	12	2914773	2914784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_017537	T	6	6	2915532	2915537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_017537	TAT	2	6	2915546	2915551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_017537	ATT	2	6	2915639	2915644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_017537	AAGTAT	2	12	2915648	2915659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_017537	TTGC	2	8	2915844	2915851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8524	NC_017537	CAA	2	6	2915928	2915933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_017537	TATC	2	8	2915948	2915955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_017537	TGT	2	6	2918001	2918006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_017537	CTTT	2	8	2918053	2918060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8528	NC_017537	T	7	7	2918058	2918064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_017537	GTTT	2	8	2918077	2918084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_017537	TTAG	2	8	2918091	2918098	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_017537	TCA	2	6	2918459	2918464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_017537	TGT	2	6	2918513	2918518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_017537	CTT	2	6	2918567	2918572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_017537	T	6	6	2918571	2918576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_017537	CT	3	6	2918620	2918625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8536	NC_017537	ATT	2	6	2918964	2918969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_017537	TAT	2	6	2918984	2918989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_017537	CTG	2	6	2919015	2919020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_017537	TAT	2	6	2919048	2919053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_017537	TCT	2	6	2919070	2919075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_017537	T	6	6	2919075	2919080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_017537	ATC	2	6	2919439	2919444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_017537	ATT	2	6	2919445	2919450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_017537	TAT	2	6	2919465	2919470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_017537	CA	3	6	2919483	2919488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8546	NC_017537	A	6	6	2919545	2919550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_017537	GTA	3	9	2919622	2919630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_017537	ATTT	2	8	2922695	2922702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_017537	CTT	2	6	2922734	2922739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_017537	CTCTTA	2	12	2922740	2922751	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_017537	TAA	2	6	2922752	2922757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_017537	A	6	6	2922939	2922944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_017537	ATT	2	6	2922949	2922954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_017537	GTA	2	6	2923019	2923024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_017537	A	6	6	2924943	2924948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_017537	CAA	2	6	2926412	2926417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_017537	TTA	2	6	2926479	2926484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_017537	TAA	2	6	2926506	2926511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_017537	AGG	2	6	2926667	2926672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_017537	TAG	2	6	2927539	2927544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_017537	CT	3	6	2928848	2928853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8562	NC_017537	TAT	2	6	2929422	2929427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_017537	A	6	6	2930282	2930287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_017537	GGA	2	6	2930288	2930293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_017537	TCC	2	6	2930313	2930318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8566	NC_017537	CACTC	2	10	2931527	2931536	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8567	NC_017537	A	8	8	2935469	2935476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017537	AAG	2	6	2935486	2935491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_017537	T	6	6	2935497	2935502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_017537	TCT	2	6	2935525	2935530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_017537	A	7	7	2935578	2935584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_017537	ACT	2	6	2935590	2935595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_017537	TAT	2	6	2937991	2937996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_017537	ATTG	2	8	2938011	2938018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_017537	GTTT	2	8	2938019	2938026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_017537	ATT	2	6	2938096	2938101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_017537	TAA	2	6	2938110	2938115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_017537	A	6	6	2939233	2939238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_017537	ACA	2	6	2939264	2939269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_017537	TGTA	2	8	2939271	2939278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_017537	TTC	2	6	2939288	2939293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_017537	GTCT	2	8	2939331	2939338	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_017537	AGT	2	6	2939341	2939346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_017537	T	7	7	2939350	2939356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_017537	TCC	2	6	2940984	2940989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8586	NC_017537	ATT	2	6	2941046	2941051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_017537	TAA	2	6	2941059	2941064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_017537	TC	3	6	2943345	2943350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8589	NC_017537	TTAC	2	8	2943371	2943378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8590	NC_017537	AAT	2	6	2943392	2943397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_017537	TGT	2	6	2943456	2943461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_017537	A	6	6	2943470	2943475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_017537	TAT	2	6	2943553	2943558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_017537	AAAT	2	8	2943603	2943610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_017537	A	6	6	2943635	2943640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_017537	AAT	2	6	2945321	2945326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_017537	AAC	2	6	2945333	2945338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_017537	TAT	2	6	2945339	2945344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_017537	TAT	2	6	2945769	2945774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_017537	A	6	6	2945809	2945814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_017537	T	6	6	2945816	2945821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_017537	GTAA	2	8	2945907	2945914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_017537	A	6	6	2946562	2946567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_017537	AT	3	6	2946990	2946995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_017537	T	6	6	2947011	2947016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_017537	TCCG	2	8	2952050	2952057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_017537	CCT	2	6	2955685	2955690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8608	NC_017537	A	6	6	2955720	2955725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_017537	ACTC	2	8	2955735	2955742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8610	NC_017537	CCT	2	6	2958751	2958756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8611	NC_017537	AAG	2	6	2958775	2958780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_017537	T	6	6	2958826	2958831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_017537	AT	3	6	2958863	2958868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_017537	GAT	2	6	2958915	2958920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_017537	AG	4	8	2958949	2958956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_017537	TGG	2	6	2960055	2960060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_017537	A	6	6	2960097	2960102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_017537	T	6	6	2960124	2960129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_017537	T	7	7	2962104	2962110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_017537	AATA	3	12	2964150	2964161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_017537	AACA	2	8	2964163	2964170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_017537	A	6	6	2964173	2964178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_017537	A	7	7	2964222	2964228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_017537	TTA	2	6	2964238	2964243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_017537	TAA	2	6	2964804	2964809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_017537	A	7	7	2964808	2964814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_017537	CTTT	2	8	2964866	2964873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8628	NC_017537	ATC	2	6	2964874	2964879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_017537	CCT	2	6	2971576	2971581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8630	NC_017537	TCC	2	6	2973188	2973193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8631	NC_017537	A	7	7	2973195	2973201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8632	NC_017537	TCT	2	6	2975126	2975131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8633	NC_017537	A	10	10	2975173	2975182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8634	NC_017537	TATCA	2	10	2975463	2975472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8635	NC_017537	T	7	7	2975992	2975998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8636	NC_017537	TAA	2	6	2976076	2976081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8637	NC_017537	T	7	7	2976087	2976093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8638	NC_017537	AC	3	6	2976145	2976150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous12...6789101112131415161718Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.