MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 1647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017499	CAC	2	6	216015	216020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_017499	AGA	2	6	216028	216033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017499	CCA	2	6	216071	216076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_017499	TAT	2	6	216147	216152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017499	TGA	2	6	216155	216160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017499	CATTA	2	10	216193	216202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1507	NC_017499	CCA	2	6	217704	217709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017499	ATT	2	6	218882	218887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017499	TAGA	2	8	218904	218911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017499	ATA	2	6	218928	218933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017499	TTC	2	6	218952	218957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017499	TGA	2	6	219001	219006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017499	TAA	2	6	219007	219012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017499	TAG	2	6	219130	219135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017499	GAA	2	6	219170	219175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017499	T	6	6	219188	219193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017499	AGA	2	6	219253	219258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017499	ATG	2	6	219282	219287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017499	T	7	7	219294	219300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017499	ATA	2	6	219321	219326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017499	AAAG	2	8	219337	219344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017499	TTTA	2	8	219386	219393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017499	AAATT	2	10	219401	219410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017499	CAC	2	6	219466	219471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017499	TGT	2	6	219677	219682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017499	GAC	2	6	219771	219776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017499	TTCT	2	8	219810	219817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_017499	TTCTCT	2	12	219835	219846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017499	CAA	2	6	219903	219908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_017499	T	7	7	219910	219916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017499	TA	3	6	219920	219925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017499	TTC	2	6	220018	220023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017499	CTA	2	6	220035	220040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017499	TAA	2	6	220081	220086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017499	AAT	2	6	220111	220116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017499	AAT	2	6	220156	220161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017499	TCA	2	6	220175	220180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017499	AGCTTT	2	12	220183	220194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1539	NC_017499	AT	3	6	220215	220220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017499	T	6	6	220225	220230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017499	GCT	2	6	220256	220261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017499	AGA	2	6	221167	221172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017499	A	7	7	221172	221178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017499	GAA	2	6	221201	221206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017499	GCT	2	6	221207	221212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017499	CTG	2	6	221310	221315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017499	TAT	2	6	221327	221332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017499	ATT	2	6	221358	221363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017499	AATTC	2	10	221366	221375	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_017499	ATT	2	6	222096	222101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017499	A	7	7	222110	222116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017499	TA	3	6	222136	222141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017499	TGC	2	6	222173	222178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017499	GTT	2	6	222192	222197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017499	GAA	2	6	222243	222248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017499	GAA	2	6	222267	222272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017499	ATA	2	6	222979	222984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017499	TCG	2	6	223007	223012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017499	ATT	2	6	223865	223870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017499	TAA	2	6	224591	224596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017499	TCA	2	6	224602	224607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017499	TTA	2	6	224632	224637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017499	AGT	2	6	224691	224696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017499	ATT	2	6	224719	224724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017499	T	6	6	226222	226227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017499	TCATT	2	10	226243	226252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_017499	ATT	2	6	226262	226267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017499	T	6	6	226270	226275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017499	AAT	2	6	226336	226341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017499	T	7	7	226350	226356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017499	TTA	2	6	226375	226380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017499	ACT	2	6	226381	226386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017499	T	8	8	226411	226418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017499	ATT	2	6	226456	226461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017499	ACT	2	6	226483	226488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_017499	A	7	7	226580	226586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017499	T	6	6	226601	226606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017499	CTTT	2	8	228773	228780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_017499	TTC	2	6	228786	228791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017499	ATTT	2	8	231592	231599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017499	ATTT	2	8	231617	231624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017499	GCAACT	2	12	231673	231684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017499	TTC	2	6	231716	231721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017499	CCA	2	6	231729	231734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_017499	TTTC	2	8	231759	231766	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_017499	CCA	2	6	231825	231830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_017499	CAA	2	6	231865	231870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_017499	ATTA	2	8	231911	231918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017499	TG	3	6	231970	231975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017499	CTA	2	6	234798	234803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_017499	ATA	2	6	234876	234881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017499	ATT	2	6	234911	234916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017499	T	6	6	234925	234930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017499	AT	3	6	234960	234965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017499	TCA	2	6	234966	234971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017499	TTG	3	9	235009	235017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017499	GAA	2	6	235152	235157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017499	ACC	2	6	235166	235171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_017499	TTC	2	6	235196	235201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_017499	A	8	8	236353	236360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017499	ACT	2	6	236424	236429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017499	TAG	2	6	236456	236461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017499	AAT	2	6	236469	236474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017499	ATT	2	6	237322	237327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017499	TGG	2	6	237346	237351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017499	AATC	2	8	239859	239866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_017499	CTT	2	6	240015	240020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_017499	TGAC	2	8	240039	240046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_017499	GAA	2	6	240096	240101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017499	AAG	2	6	240174	240179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017499	ATT	2	6	240187	240192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017499	A	6	6	241044	241049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017499	T	6	6	241114	241119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017499	AGT	2	6	241167	241172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017499	TAG	2	6	241310	241315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017499	TCA	2	6	241326	241331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017499	CAT	2	6	241363	241368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017499	A	7	7	241382	241388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017499	CCA	2	6	241410	241415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_017499	TTTC	2	8	241456	241463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_017499	ATA	2	6	241473	241478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017499	CT	3	6	241501	241506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_017499	TAAA	2	8	241511	241518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017499	TAT	2	6	241531	241536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017499	AT	3	6	241535	241540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017499	AAAT	2	8	241573	241580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017499	A	6	6	241616	241621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017499	T	6	6	241715	241720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017499	CTT	2	6	241786	241791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017499	T	7	7	241790	241796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017499	TTTTA	2	10	241879	241888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017499	TTG	2	6	241948	241953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017499	A	6	6	241955	241960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017499	TTC	2	6	241999	242004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017499	TAA	2	6	242010	242015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017499	TA	3	6	242026	242031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017499	TTA	2	6	242054	242059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017499	T	6	6	242165	242170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_017499	ATTC	2	8	242194	242201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1640	NC_017499	ATT	2	6	242214	242219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1641	NC_017499	TAA	2	6	242235	242240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1642	NC_017499	TGT	2	6	242325	242330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1643	NC_017499	ATGA	2	8	242413	242420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1644	NC_017499	TTC	2	6	242437	242442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1645	NC_017499	GAAA	2	8	242473	242480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_017499	AGA	2	6	242525	242530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1647	NC_017499	CAAA	2	8	242534	242541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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