MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 9335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017492	CTTT	2	8	1426410	1426417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_017492	TTA	2	6	1426452	1426457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017492	TAA	2	6	1426463	1426468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017492	TTC	2	6	1426488	1426493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017492	A	7	7	1426552	1426558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017492	ATT	2	6	1426566	1426571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017492	ACT	2	6	1426611	1426616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017492	A	6	6	1426636	1426641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017492	T	6	6	1426665	1426670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017492	TAAA	2	8	1428302	1428309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017492	T	7	7	1428389	1428395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017492	AATG	2	8	1428407	1428414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017492	AAT	3	9	1428425	1428433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017492	TTTC	2	8	1428487	1428494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_017492	A	6	6	1428515	1428520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017492	ATT	2	6	1428539	1428544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017492	ATC	2	6	1430535	1430540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017492	A	6	6	1430567	1430572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017492	AT	3	6	1431417	1431422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017492	T	7	7	1431427	1431433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017492	T	8	8	1431435	1431442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017492	T	8	8	1431487	1431494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017492	A	6	6	1431553	1431558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017492	T	6	6	1432229	1432234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017492	CTT	2	6	1432260	1432265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017492	TTTTA	2	10	1432275	1432284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017492	TAA	2	6	1432285	1432290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017492	AAGT	2	8	1432334	1432341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017492	ATG	2	6	1434547	1434552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017492	TCAT	2	8	1434615	1434622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_017492	AATG	2	8	1434635	1434642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017492	ACG	2	6	1434646	1434651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017492	AAT	2	6	1434666	1434671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5035	NC_017492	AAT	2	6	1434799	1434804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017492	AGCT	2	8	1434854	1434861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_017492	GAC	2	6	1434871	1434876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5039	NC_017492	AG	3	6	1434925	1434930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017492	TAAA	2	8	1435917	1435924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017492	A	7	7	1435986	1435992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017492	TCT	2	6	1436004	1436009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017492	TGAC	2	8	1437668	1437675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_017492	TTA	2	6	1437701	1437706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017492	A	6	6	1437756	1437761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017492	T	6	6	1437788	1437793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017492	TAA	2	6	1437831	1437836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017492	CAG	2	6	1437849	1437854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017492	ACT	2	6	1437856	1437861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017492	AAT	2	6	1437862	1437867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017492	TTTTA	2	10	1437899	1437908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017492	TAA	2	6	1437921	1437926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017492	ATT	2	6	1437942	1437947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017492	CAA	2	6	1437949	1437954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017492	CCTAA	2	10	1439105	1439114	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5056	NC_017492	T	6	6	1439142	1439147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017492	ATA	2	6	1439148	1439153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017492	TA	3	6	1439168	1439173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017492	TAGA	2	8	1439175	1439182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017492	TAC	2	6	1440145	1440150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017492	TTA	2	6	1440174	1440179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017492	CTAAA	2	10	1440192	1440201	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5063	NC_017492	A	6	6	1440225	1440230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017492	GAT	2	6	1440244	1440249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5066	NC_017492	TCAT	2	8	1441664	1441671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_017492	A	6	6	1441698	1441703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017492	TAG	2	6	1441754	1441759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5070	NC_017492	TAA	2	6	1442872	1442877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017492	AAT	2	6	1445314	1445319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017492	ATAA	2	8	1445446	1445453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017492	GTT	2	6	1445467	1445472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_017492	TTTG	2	8	1445605	1445612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_017492	TTG	2	6	1445778	1445783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017492	A	7	7	1445794	1445800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017492	A	6	6	1447374	1447379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017492	AAACA	2	10	1447414	1447423	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5093	NC_017492	A	6	6	1448579	1448584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017492	GT	3	6	1448616	1448621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_017492	CTT	2	6	1453711	1453716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_017492	TAT	2	6	1455022	1455027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017492	TCG	2	6	1455046	1455051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5106	NC_017492	CT	3	6	1455720	1455725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5112	NC_017492	GGT	2	6	1460552	1460557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017492	TTTGA	2	10	1460601	1460610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_017492	A	6	6	1461496	1461501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_017492	AAT	2	6	1461534	1461539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017492	CTT	2	6	1461544	1461549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017492	TAA	2	6	1461560	1461565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017492	A	7	7	1461571	1461577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017492	TAA	2	6	1461593	1461598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_017492	T	7	7	1461656	1461662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017492	A	7	7	1461692	1461698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017492	ATT	2	6	1461730	1461735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017492	A	6	6	1461739	1461744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017492	TCC	2	6	1463011	1463016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_017492	CAA	2	6	1463019	1463024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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