MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017491	CAA	2	6	497460	497465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017491	CGG	2	6	497476	497481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017491	GAA	2	6	497490	497495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017491	GTG	2	6	497500	497505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017491	ATCG	2	8	497638	497645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_017491	A	6	6	497654	497659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017491	GCC	2	6	497711	497716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_017491	AGC	2	6	497721	497726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017491	TTG	2	6	497728	497733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017491	AGC	2	6	497752	497757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017491	GAAAAA	2	12	497836	497847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017491	TAA	2	6	497862	497867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017491	TA	3	6	497875	497880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017491	AAC	2	6	497895	497900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017491	CAA	2	6	497915	497920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017491	CGG	2	6	497931	497936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017491	GAA	2	6	497945	497950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017491	TTG	2	6	498057	498062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017491	ATCG	2	8	498093	498100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_017491	A	6	6	498109	498114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017491	CGTCA	2	10	498117	498126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1522	NC_017491	TTAA	2	8	498148	498155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017491	GCC	2	6	498166	498171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_017491	AGC	2	6	498176	498181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017491	TTG	2	6	498183	498188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017491	TATT	2	8	498368	498375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017491	ATG	2	6	498388	498393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017491	TTA	2	6	498438	498443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017491	GAA	2	6	498458	498463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017491	GGT	2	6	498643	498648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017491	GAC	2	6	498670	498675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017491	TGG	2	6	498681	498686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017491	T	6	6	498700	498705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017491	TGA	3	9	498738	498746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017491	CAGA	2	8	499621	499628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_017491	GGC	2	6	499629	499634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017491	TAA	2	6	499698	499703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017491	A	6	6	499721	499726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017491	CGG	2	6	499749	499754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017491	CA	4	8	499789	499796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_017491	AGG	2	6	499813	499818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017491	CAG	2	6	500912	500917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017491	A	6	6	500928	500933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017491	TTAA	2	8	500993	501000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017491	CTG	2	6	501006	501011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017491	TTA	2	6	502020	502025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017491	GGT	2	6	502047	502052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017491	GA	3	6	502081	502086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017491	A	6	6	502095	502100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017491	T	6	6	502154	502159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017491	T	6	6	502216	502221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017491	AAG	2	6	504141	504146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017491	ATG	2	6	504163	504168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017491	A	6	6	504768	504773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017491	ATG	2	6	507060	507065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017491	TCA	2	6	507089	507094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1559	NC_017491	TTG	2	6	507598	507603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017491	TATT	2	8	507693	507700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017491	AATT	2	8	507724	507731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017491	AT	3	6	507766	507771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017491	TCA	2	6	507874	507879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_017491	A	6	6	507957	507962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017491	AT	3	6	507966	507971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017491	AGT	2	6	507985	507990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017491	TAT	2	6	508029	508034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017491	TTGCT	2	10	508809	508818	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_017491	TTA	2	6	508863	508868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017491	ATG	2	6	509047	509052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_017491	AAT	2	6	509163	509168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017491	CAT	2	6	509199	509204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_017491	T	6	6	510273	510278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017491	TCAT	2	8	510293	510300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_017491	TA	3	6	510325	510330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_017491	T	6	6	511421	511426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017491	CCT	2	6	512870	512875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1602	NC_017491	TAAG	2	8	514004	514011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017491	AT	3	6	514014	514019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017491	GA	3	6	514039	514044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017491	TTG	2	6	514079	514084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_017491	T	6	6	514938	514943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_017491	ATA	2	6	517007	517012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_017491	ATT	2	6	518888	518893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017491	AAATG	2	10	518925	518934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017491	TCAA	2	8	518942	518949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_017491	AT	3	6	518958	518963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017491	TTC	2	6	518991	518996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_017491	TA	3	6	519004	519009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017491	ACA	2	6	519030	519035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_017491	GCA	2	6	519326	519331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017491	GA	3	6	519356	519361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017491	A	6	6	519418	519423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017491	AGT	2	6	520240	520245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_017491	TGT	2	6	520330	520335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017491	AAAAG	2	10	520353	520362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017491	ATG	2	6	520372	520377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017491	GAAA	2	8	520406	520413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017491	A	6	6	520472	520477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017491	ATTG	2	8	520482	520489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017491	CAA	2	6	520537	520542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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