MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017491	A	6	6	2377138	2377143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017491	TTG	2	6	2377152	2377157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_017491	CAT	2	6	2378559	2378564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_017491	C	6	6	2380127	2380132	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7005	NC_017491	AAG	2	6	2380209	2380214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_017491	GGA	2	6	2380215	2380220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_017491	TTTAT	2	10	2380459	2380468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017491	AAAT	2	8	2380507	2380514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017491	GCA	2	6	2380525	2380530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_017491	TGAA	2	8	2381211	2381218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017491	TCA	2	6	2381267	2381272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017491	A	7	7	2381639	2381645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017491	AGA	2	6	2384345	2384350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017491	GA	3	6	2384349	2384354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017491	T	6	6	2384365	2384370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017491	CCA	2	6	2384409	2384414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_017491	ATTA	2	8	2384530	2384537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017491	GTT	2	6	2384605	2384610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017491	T	6	6	2384612	2384617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017491	CGTA	2	8	2384621	2384628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_017491	AACC	2	8	2384939	2384946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_017491	CCGACA	2	12	2384953	2384964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_017491	CTT	2	6	2385203	2385208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_017491	A	7	7	2385220	2385226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017491	T	7	7	2385242	2385248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017491	GGAA	2	8	2385282	2385289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017491	TCAC	2	8	2386268	2386275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_017491	A	6	6	2386285	2386290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017491	TGA	2	6	2386310	2386315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017491	CAA	2	6	2386318	2386323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_017491	T	7	7	2386386	2386392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017491	CCA	2	6	2387156	2387161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7033	NC_017491	A	7	7	2387163	2387169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017491	T	7	7	2387229	2387235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017491	TTC	2	6	2387809	2387814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_017491	TTCA	2	8	2387821	2387828	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_017491	CAT	2	6	2387950	2387955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_017491	AT	3	6	2387988	2387993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017491	TCA	2	6	2388023	2388028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_017491	TACGC	2	10	2388064	2388073	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7041	NC_017491	TCA	2	6	2388083	2388088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_017491	GAG	2	6	2388101	2388106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_017491	GGC	2	6	2389403	2389408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_017491	ATC	2	6	2389453	2389458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_017491	TCT	2	6	2389493	2389498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_017491	CAT	2	6	2389524	2389529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_017491	A	6	6	2389548	2389553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017491	TAA	2	6	2389566	2389571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_017491	ACT	2	6	2389584	2389589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_017491	T	6	6	2389621	2389626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017491	T	6	6	2389693	2389698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017491	ATA	2	6	2389827	2389832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017491	TGC	2	6	2389852	2389857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_017491	T	6	6	2389942	2389947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_017491	CAT	2	6	2389948	2389953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_017491	ATC	2	6	2389971	2389976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_017491	CAA	2	6	2390658	2390663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_017491	TCT	2	6	2390691	2390696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_017491	GAC	2	6	2390704	2390709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_017491	TA	3	6	2390727	2390732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017491	CTC	2	6	2390743	2390748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_017491	TTA	2	6	2390791	2390796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017491	TAT	2	6	2390814	2390819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017491	CTT	2	6	2390837	2390842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_017491	TTC	2	6	2391654	2391659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_017491	CG	3	6	2391663	2391668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7067	NC_017491	A	7	7	2391686	2391692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_017491	AGGT	2	8	2391715	2391722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_017491	TCA	2	6	2391724	2391729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_017491	AAT	2	6	2391781	2391786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017491	TGAT	2	8	2391812	2391819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017491	CAA	2	6	2391913	2391918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7075	NC_017491	TGT	2	6	2392103	2392108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7079	NC_017491	TGT	2	6	2393939	2393944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017491	ATA	2	6	2393976	2393981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_017491	AGT	2	6	2394057	2394062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_017491	TTA	2	6	2394078	2394083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017491	A	8	8	2394258	2394265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7086	NC_017491	GTG	2	6	2397115	2397120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017491	GTT	2	6	2397198	2397203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_017491	ATC	2	6	2397213	2397218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_017491	TGA	2	6	2402446	2402451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_017491	TAG	2	6	2402461	2402466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7092	NC_017491	AAG	2	6	2402633	2402638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_017491	GCTG	2	8	2403361	2403368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_017491	T	6	6	2403370	2403375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017491	GGGA	2	8	2403380	2403387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_017491	GGTT	2	8	2403400	2403407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_017491	CCGA	2	8	2403915	2403922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7098	NC_017491	CCA	2	6	2403990	2403995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7099	NC_017491	TTGATG	2	12	2404135	2404146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_017491	GAAA	2	8	2404801	2404808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_017491	GTC	2	6	2408640	2408645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017491	TGTA	2	8	2409897	2409904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017491	GTC	2	6	2409943	2409948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_017491	ATCA	2	8	2409959	2409966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7106	NC_017491	AACA	2	8	2410016	2410023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7107	NC_017491	TCA	2	6	2410032	2410037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_017491	A	7	7	2410171	2410177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_017491	TCC	2	6	2411120	2411125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_017491	CTA	2	6	2411190	2411195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_017491	CTA	2	6	2411240	2411245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_017491	CTT	2	6	2411323	2411328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_017491	TCT	2	6	2411986	2411991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_017491	T	7	7	2413870	2413876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_017491	AGC	3	9	2413906	2413914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_017491	CAT	2	6	2413975	2413980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_017491	CAT	2	6	2414283	2414288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_017491	CTGCGA	2	12	2414428	2414439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_017491	TCC	2	6	2414490	2414495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7120	NC_017491	CCA	2	6	2414501	2414506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_017491	C	6	6	2414546	2414551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7122	NC_017491	ATTTC	2	10	2415381	2415390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7123	NC_017491	CAG	2	6	2415438	2415443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_017491	A	6	6	2415570	2415575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_017491	TG	4	8	2415579	2415586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017491	CTT	2	6	2418826	2418831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_017491	TTG	2	6	2418875	2418880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017491	CCG	2	6	2418929	2418934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_017491	TAG	2	6	2419667	2419672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_017491	CG	3	6	2419716	2419721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7131	NC_017491	TGGC	2	8	2419725	2419732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7132	NC_017491	T	6	6	2419752	2419757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_017491	CAA	2	6	2419840	2419845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_017491	GCTT	2	8	2419856	2419863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7135	NC_017491	A	7	7	2420010	2420016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7136	NC_017491	ATG	2	6	2420024	2420029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7138	NC_017491	GTTG	2	8	2420118	2420125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7139	NC_017491	CCT	2	6	2420543	2420548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7140	NC_017491	CCT	2	6	2421970	2421975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7141	NC_017491	CCT	2	6	2422357	2422362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7142	NC_017491	T	6	6	2422364	2422369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7143	NC_017491	TAT	2	6	2422376	2422381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7151	NC_017491	TTC	2	6	2422835	2422840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7165	NC_017491	CTT	2	6	2427762	2427767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7167	NC_017491	CCT	2	6	2428675	2428680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7174	NC_017491	CCT	2	6	2433823	2433828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7176	NC_017491	CCT	2	6	2434157	2434162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7177	NC_017491	TAT	2	6	2434168	2434173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7192	NC_017491	TGC	2	6	2437295	2437300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7263	NC_017491	CAT	2	6	2445231	2445236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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