MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 8937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017491	GTG	2	6	2233810	2233815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017491	AAT	2	6	2233822	2233827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017491	ATT	2	6	2237570	2237575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017491	TAC	2	6	2237611	2237616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_017491	CCA	2	6	2237636	2237641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_017491	ATTC	2	8	2237680	2237687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6507	NC_017491	ACT	2	6	2237690	2237695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_017491	CTT	2	6	2237717	2237722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_017491	TG	3	6	2237735	2237740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017491	TAA	2	6	2237752	2237757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017491	CAC	2	6	2237791	2237796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_017491	TGA	2	6	2237827	2237832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017491	TTG	2	6	2237947	2237952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017491	GGC	2	6	2237987	2237992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_017491	GTA	2	6	2238018	2238023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017491	GCC	2	6	2238044	2238049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_017491	ACT	2	6	2238089	2238094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_017491	ACT	2	6	2238164	2238169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_017491	ACT	2	6	2238182	2238187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_017491	ACT	2	6	2238212	2238217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_017491	GCC	2	6	2238224	2238229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_017491	TCGC	2	8	2238285	2238292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_017491	CTG	3	9	2238294	2238302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017491	ACTTGC	2	12	2238314	2238325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_017491	ACT	2	6	2238356	2238361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_017491	CCGATG	2	12	2238453	2238464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_017491	AAT	2	6	2238468	2238473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017491	TCT	2	6	2238490	2238495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_017491	CCA	2	6	2238526	2238531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_017491	AATA	2	8	2238575	2238582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017491	T	6	6	2238600	2238605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017491	GTG	2	6	2238651	2238656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_017491	ATC	2	6	2238659	2238664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_017491	GCAA	2	8	2238682	2238689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_017491	GTTA	2	8	2241803	2241810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_017491	ATTA	2	8	2241828	2241835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017491	TATC	2	8	2241856	2241863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_017491	ACT	2	6	2241941	2241946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_017491	A	6	6	2241964	2241969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_017491	AT	3	6	2241977	2241982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_017491	T	7	7	2242082	2242088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017491	ATT	2	6	2242094	2242099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017491	ATC	2	6	2242113	2242118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_017491	A	6	6	2242122	2242127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_017491	CCA	2	6	2242133	2242138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_017491	T	6	6	2242162	2242167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017491	A	6	6	2242208	2242213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017491	CAA	2	6	2242235	2242240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_017491	CTTA	2	8	2243703	2243710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_017491	CGA	2	6	2243773	2243778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_017491	CAA	2	6	2243804	2243809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_017491	AAT	2	6	2243816	2243821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_017491	CAA	2	6	2243829	2243834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_017491	GTC	2	6	2243835	2243840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_017491	AAAAGA	2	12	2244438	2244449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_017491	AATG	2	8	2244481	2244488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_017491	TCC	2	6	2245190	2245195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_017491	CCT	2	6	2245711	2245716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_017491	ATG	2	6	2245735	2245740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017491	AAG	2	6	2245815	2245820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_017491	A	6	6	2245853	2245858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017491	TA	3	6	2248502	2248507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017491	TCC	2	6	2248555	2248560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_017491	GTC	2	6	2248582	2248587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_017491	AGCA	2	8	2248591	2248598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_017491	TCA	2	6	2248620	2248625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_017491	TTA	2	6	2248656	2248661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_017491	TCA	2	6	2248667	2248672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_017491	GTTT	2	8	2248690	2248697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_017491	TAT	2	6	2248759	2248764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_017491	TCA	2	6	2248783	2248788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_017491	A	6	6	2248814	2248819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_017491	CTG	2	6	2248898	2248903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_017491	TTG	2	6	2248923	2248928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017491	AGCC	2	8	2250698	2250705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_017491	CCT	2	6	2251382	2251387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6577	NC_017491	TCC	2	6	2252333	2252338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_017491	TCCC	2	8	2254598	2254605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6579	NC_017491	A	6	6	2254716	2254721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_017491	A	6	6	2254736	2254741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017491	ATC	2	6	2254776	2254781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_017491	TCC	2	6	2255338	2255343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_017491	AGCA	2	8	2255345	2255352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_017491	CAT	2	6	2255429	2255434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_017491	AAT	2	6	2255461	2255466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_017491	TCT	2	6	2255494	2255499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_017491	A	6	6	2256950	2256955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_017491	ATT	2	6	2257205	2257210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_017491	T	6	6	2257258	2257263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_017491	AAT	2	6	2257304	2257309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_017491	CTTT	2	8	2257343	2257350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6592	NC_017491	AGCA	2	8	2257408	2257415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_017491	GTG	2	6	2257527	2257532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_017491	TA	3	6	2260949	2260954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_017491	TA	3	6	2260995	2261000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_017491	TTGA	2	8	2261010	2261017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_017491	CATTT	2	10	2261025	2261034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6598	NC_017491	TCA	2	6	2261072	2261077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_017491	ACTT	2	8	2262328	2262335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6600	NC_017491	GAT	2	6	2262454	2262459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_017491	TG	3	6	2262474	2262479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_017491	ACGC	2	8	2262523	2262530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_017491	TCG	2	6	2262534	2262539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_017491	TCA	2	6	2262553	2262558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_017491	TAA	2	6	2262595	2262600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_017491	GGT	2	6	2262610	2262615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_017491	GTTGCA	2	12	2262653	2262664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6608	NC_017491	AC	3	6	2263077	2263082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_017491	AAGAA	2	10	2263151	2263160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_017491	ATT	2	6	2263174	2263179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_017491	TAA	2	6	2263211	2263216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_017491	CTT	2	6	2263227	2263232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_017491	TTTAG	2	10	2264211	2264220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_017491	TCAAA	2	10	2264225	2264234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6615	NC_017491	A	7	7	2264232	2264238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_017491	TAT	2	6	2264254	2264259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_017491	T	6	6	2264273	2264278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_017491	AG	3	6	2264341	2264346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_017491	ATAC	2	8	2264393	2264400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_017491	T	6	6	2266383	2266388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_017491	GCT	2	6	2266401	2266406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_017491	CAT	2	6	2266453	2266458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_017491	CAG	2	6	2268521	2268526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_017491	GTT	2	6	2268538	2268543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_017491	T	7	7	2268542	2268548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_017491	ACA	2	6	2268563	2268568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_017491	T	6	6	2268741	2268746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_017491	GTGA	2	8	2269578	2269585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_017491	GAGG	2	8	2270381	2270388	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_017491	TTAG	2	8	2270424	2270431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_017491	A	7	7	2270501	2270507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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