MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 10187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017486	AG	3	6	2379048	2379053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017486	TCC	2	6	2379073	2379078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_017486	AT	3	6	2379079	2379084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017486	CTCTC	2	10	2379117	2379126	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10005	NC_017486	TAA	2	6	2379192	2379197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_017486	ACC	2	6	2379198	2379203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_017486	GCT	2	6	2379262	2379267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_017486	TGA	2	6	2379310	2379315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_017486	TTC	2	6	2379336	2379341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_017486	CTT	2	6	2379372	2379377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_017486	CTG	2	6	2379431	2379436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_017486	ATC	2	6	2379505	2379510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017486	ATC	2	6	2379556	2379561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_017486	TGT	2	6	2379641	2379646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_017486	GCT	2	6	2379690	2379695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017486	CGC	2	6	2379750	2379755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_017486	ATT	2	6	2379830	2379835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017486	TAC	2	6	2379860	2379865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_017486	TTC	2	6	2379879	2379884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_017486	TAT	2	6	2379944	2379949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_017486	CTAA	2	8	2379962	2379969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_017486	T	7	7	2380002	2380008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_017486	T	6	6	2380056	2380061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_017486	TAT	2	6	2380085	2380090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_017486	AG	3	6	2380111	2380116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017486	A	8	8	2380150	2380157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_017486	AT	3	6	2380188	2380193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_017486	AAT	2	6	2380195	2380200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_017486	GTTC	2	8	2380598	2380605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_017486	CAG	2	6	2381094	2381099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_017486	ATC	2	6	2381167	2381172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017486	ATT	2	6	2381180	2381185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_017486	TTTA	2	8	2381223	2381230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_017486	CTT	2	6	2381231	2381236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_017486	T	6	6	2381252	2381257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_017486	GCA	2	6	2381310	2381315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_017486	T	6	6	2381339	2381344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_017486	TA	3	6	2381355	2381360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_017486	TA	3	6	2381406	2381411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_017486	T	6	6	2383213	2383218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_017486	ATT	2	6	2383220	2383225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_017486	ACA	2	6	2383228	2383233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_017486	TAA	2	6	2383253	2383258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017486	ATT	2	6	2383262	2383267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_017486	TAA	2	6	2383270	2383275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_017486	TAAA	2	8	2384843	2384850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017486	TAT	2	6	2385708	2385713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_017486	TTA	2	6	2385735	2385740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_017486	A	7	7	2385850	2385856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_017486	A	6	6	2385905	2385910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_017486	T	7	7	2385911	2385917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_017486	AATA	2	8	2385920	2385927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017486	TAT	2	6	2385928	2385933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_017486	A	7	7	2386003	2386009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_017486	ATT	2	6	2386040	2386045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_017486	A	6	6	2388253	2388258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_017486	AAAAC	2	10	2388261	2388270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10058	NC_017486	GAG	2	6	2388280	2388285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_017486	ATTT	2	8	2388356	2388363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_017486	AAG	2	6	2388381	2388386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_017486	TTC	2	6	2388416	2388421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_017486	AGC	2	6	2388428	2388433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_017486	CGCAA	2	10	2388434	2388443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10064	NC_017486	CTTA	2	8	2388920	2388927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_017486	CTTT	2	8	2389417	2389424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_017486	T	6	6	2389447	2389452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_017486	AAG	2	6	2389487	2389492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017486	TAATA	2	10	2389544	2389553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_017486	T	6	6	2389557	2389562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017486	T	6	6	2389581	2389586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_017486	A	6	6	2389600	2389605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_017486	TATC	2	8	2389620	2389627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10073	NC_017486	GTAA	2	8	2391007	2391014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017486	A	7	7	2391025	2391031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_017486	T	6	6	2391052	2391057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_017486	T	7	7	2391972	2391978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_017486	A	7	7	2391983	2391989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_017486	T	8	8	2392012	2392019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_017486	A	6	6	2392022	2392027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_017486	TCA	2	6	2392672	2392677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_017486	ATT	2	6	2392685	2392690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_017486	TA	3	6	2392693	2392698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_017486	TTTC	2	8	2392729	2392736	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_017486	TAT	2	6	2392738	2392743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_017486	A	6	6	2392759	2392764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_017486	CCT	2	6	2392783	2392788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10087	NC_017486	ATC	2	6	2393741	2393746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_017486	TC	3	6	2393745	2393750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10089	NC_017486	TAA	2	6	2393797	2393802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_017486	A	7	7	2393801	2393807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_017486	GAC	2	6	2393853	2393858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_017486	TAA	2	6	2393933	2393938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_017486	CCG	2	6	2393970	2393975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_017486	CCG	2	6	2394067	2394072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_017486	ATG	2	6	2394126	2394131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_017486	TTC	2	6	2394178	2394183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_017486	ATATT	2	10	2394203	2394212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_017486	CTTCCA	2	12	2394272	2394283	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_017486	ATC	2	6	2394297	2394302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_017486	TC	3	6	2394301	2394306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_017486	TCCCT	2	10	2394380	2394389	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10103	NC_017486	AAC	2	6	2394419	2394424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_017486	ACG	2	6	2394522	2394527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_017486	CGA	2	6	2394602	2394607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_017486	ACC	2	6	2394717	2394722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_017486	GATT	2	8	2394801	2394808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017486	CCAA	2	8	2394810	2394817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_017486	AGG	2	6	2394853	2394858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_017486	GTA	2	6	2394941	2394946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_017486	CAA	2	6	2394950	2394955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_017486	CCTA	2	8	2394993	2395000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_017486	TC	3	6	2395113	2395118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10114	NC_017486	GCC	2	6	2395210	2395215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_017486	CTC	2	6	2395260	2395265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_017486	AG	3	6	2395322	2395327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017486	GGCT	2	8	2395368	2395375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_017486	TC	3	6	2395439	2395444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_017486	AG	3	6	2395541	2395546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_017486	CTT	2	6	2395844	2395849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_017486	CTC	2	6	2395862	2395867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_017486	GCT	2	6	2396012	2396017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_017486	AT	3	6	2396071	2396076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017486	GA	3	6	2396271	2396276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_017486	CAT	2	6	2396421	2396426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_017486	CAT	2	6	2396490	2396495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_017486	CTT	2	6	2396555	2396560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_017486	TCC	2	6	2396675	2396680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_017486	ATT	2	6	2396756	2396761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_017486	CTT	2	6	2396843	2396848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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