MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 10187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	ATTT	2	8	15	22	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017486	TTA	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017486	ACTG	2	8	74	81	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017486	T	7	7	109	115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017486	AAT	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017486	T	7	7	149	155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017486	A	7	7	209	215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017486	TAA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017486	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017486	CTTT	2	8	268	275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017486	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017486	CTA	3	9	1833	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017486	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017486	TGTC	2	8	3069	3076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017486	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017486	GATA	2	8	10062	10069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017486	TTAAAT	2	12	10847	10858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017486	ATTT	2	8	10872	10879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017486	GGT	2	6	10924	10929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017486	TGA	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017486	TAAT	2	8	11088	11095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017486	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017486	GAA	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017486	A	6	6	12309	12314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017486	AAGG	2	8	12334	12341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017486	T	7	7	12694	12700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017486	ATTAA	2	10	12753	12762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017486	T	7	7	12764	12770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017486	AAAT	2	8	12788	12795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017486	TATCA	2	10	12847	12856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017486	GAA	2	6	12857	12862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017486	GATA	2	8	12878	12885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017486	TAGC	2	8	12889	12896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017486	AGG	2	6	12912	12917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017486	TGA	2	6	15914	15919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017486	T	8	8	15952	15959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017486	CTC	2	6	15960	15965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017486	TAAA	2	8	15970	15977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017486	TAA	2	6	15985	15990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017486	AGA	2	6	16574	16579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017486	A	7	7	20653	20659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017486	TA	3	6	20682	20687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017486	A	6	6	20695	20700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017486	TAA	2	6	20708	20713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017486	A	6	6	20726	20731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017486	A	6	6	20741	20746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017486	A	7	7	21274	21280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017486	TAA	2	6	21305	21310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017486	ATG	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017486	TTA	3	9	21335	21343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017486	TAAA	2	8	21344	21351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017486	CAAA	2	8	21360	21367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017486	ATC	2	6	21663	21668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017486	A	6	6	22399	22404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017486	TAT	2	6	22405	22410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017486	T	6	6	22415	22420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017486	CTATT	2	10	22427	22436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017486	ACA	2	6	22493	22498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017486	ATT	2	6	22502	22507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017486	ATGGA	2	10	22510	22519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017486	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017486	TACT	2	8	25736	25743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017486	TTA	2	6	25808	25813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017486	AAG	2	6	25825	25830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017486	TAA	3	9	25848	25856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017486	T	8	8	27978	27985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017486	A	6	6	28021	28026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017486	GAC	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017486	TTA	2	6	28076	28081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017486	ATT	2	6	28094	28099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017486	A	7	7	28129	28135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017486	ATA	2	6	28147	28152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017486	CAA	2	6	28176	28181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017486	CGG	2	6	28224	28229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017486	GGA	2	6	28264	28269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017486	GCGT	2	8	28323	28330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017486	TCC	2	6	28347	28352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017486	AGC	2	6	28374	28379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017486	TCG	2	6	28388	28393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017486	CGG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017486	CTTAA	2	10	28595	28604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017486	TATT	2	8	28692	28699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017486	AAGTC	2	10	28736	28745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017486	GTA	2	6	28827	28832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017486	ATG	2	6	28850	28855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017486	T	7	7	28906	28912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017486	TTTA	2	8	28964	28971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017486	A	6	6	30900	30905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017486	A	6	6	33335	33340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017486	T	6	6	33361	33366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017486	TA	3	6	33403	33408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017486	TAAA	2	8	33447	33454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017486	AGTA	2	8	33460	33467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017486	GA	3	6	34635	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017486	TGA	2	6	34641	34646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017486	T	6	6	34647	34652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017486	A	8	8	34695	34702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017486	TTA	2	6	34714	34719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017486	T	7	7	34761	34767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017486	CGAA	2	8	34825	34832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017486	T	7	7	34921	34927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017486	CAG	2	6	34934	34939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017486	AAG	2	6	34955	34960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017486	CCA	2	6	34994	34999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017486	TAA	2	6	35026	35031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017486	TAA	2	6	35038	35043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017486	A	7	7	35042	35048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017486	T	6	6	35096	35101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017486	T	6	6	35112	35117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017486	TAA	2	6	35127	35132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017486	AT	3	6	35187	35192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017486	T	7	7	35192	35198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017486	AT	4	8	35199	35206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017486	A	7	7	35213	35219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017486	C	6	6	35240	35245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_017486	T	7	7	35246	35252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017486	C	6	6	35292	35297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_017486	TA	3	6	35298	35303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017486	GAT	2	6	35333	35338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017486	TG	4	8	35344	35351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017486	CGGG	2	8	35371	35378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017486	A	6	6	35386	35391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017486	TAATC	2	10	35392	35401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017486	TAA	2	6	35432	35437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017486	ATCA	2	8	35443	35450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017486	T	7	7	35479	35485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017486	TAA	3	9	35492	35500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017486	TCAA	2	8	35510	35517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017486	CG	3	6	35523	35528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017486	CTTT	2	8	35548	35555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017486	CGTT	2	8	35607	35614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017486	TCA	3	9	35685	35693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017486	TTC	2	6	35747	35752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017486	CAAA	2	8	35846	35853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017486	TCT	2	6	35877	35882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017486	T	7	7	35899	35905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017486	CT	3	6	35908	35913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017486	CT	3	6	35937	35942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017486	T	6	6	36007	36012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017486	TA	4	8	36180	36187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017486	TG	3	6	36216	36221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017486	T	6	6	36785	36790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017486	A	6	6	36807	36812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017486	GTA	2	6	37446	37451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017486	GTA	2	6	37456	37461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017486	T	6	6	37462	37467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017486	ACA	2	6	37471	37476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017486	T	6	6	37510	37515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017486	TTGC	2	8	40644	40651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017486	CTG	2	6	40728	40733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017486	ATC	2	6	40768	40773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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