MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017474	T	6	6	1110658	1110663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017474	TTTGG	2	10	1110666	1110675	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017474	GTG	2	6	1110680	1110685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017474	GCT	2	6	1110836	1110841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017474	GTT	2	6	1110996	1111001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017474	CAG	2	6	1113290	1113295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017474	GC	3	6	1113303	1113308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_017474	CTA	2	6	1114700	1114705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017474	GAT	2	6	1114715	1114720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017474	TAG	2	6	1114780	1114785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017474	GGTTG	2	10	1117887	1117896	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017474	T	6	6	1117980	1117985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017474	T	6	6	1118037	1118042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017474	CAAAT	2	10	1118052	1118061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_017474	GTT	2	6	1118068	1118073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017474	AGTTT	2	10	1118113	1118122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017474	TAGA	2	8	1119839	1119846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017474	GAG	2	6	1119877	1119882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017474	T	6	6	1122656	1122661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017474	GTA	2	6	1122687	1122692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017474	TGA	2	6	1122713	1122718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017474	A	6	6	1122725	1122730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017474	GTC	2	6	1122893	1122898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017474	GAT	2	6	1123140	1123145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017474	AGT	3	9	1123413	1123421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017474	CA	3	6	1123542	1123547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_017474	GCG	2	6	1126455	1126460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017474	AAT	2	6	1129070	1129075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017474	AGTG	2	8	1129078	1129085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017474	CTCA	2	8	1129086	1129093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_017474	TCA	2	6	1129143	1129148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_017474	TTG	2	6	1129164	1129169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017474	GCT	2	6	1129191	1129196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017474	ATT	2	6	1129271	1129276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017474	GGA	2	6	1129302	1129307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017474	GAA	2	6	1131264	1131269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017474	CTG	2	6	1132640	1132645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017474	T	7	7	1132708	1132714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017474	AT	4	8	1132812	1132819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017474	GCTTT	2	10	1132879	1132888	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_017474	CAA	2	6	1132889	1132894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_017474	A	7	7	1132902	1132908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017474	T	6	6	1134909	1134914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017474	GAA	2	6	1134965	1134970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017474	TAT	2	6	1136805	1136810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017474	T	7	7	1138193	1138199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017474	AT	3	6	1138229	1138234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017474	T	6	6	1141933	1141938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017474	CTTGT	2	10	1143025	1143034	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_017474	T	7	7	1143039	1143045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017474	GGT	2	6	1143081	1143086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017474	GCT	2	6	1143090	1143095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_017474	T	6	6	1143692	1143697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017474	T	7	7	1143762	1143768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017474	AGG	2	6	1143786	1143791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017474	TGAG	2	8	1145193	1145200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017474	AAT	2	6	1145251	1145256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017474	ATT	2	6	1145275	1145280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017474	TCA	2	6	1145349	1145354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_017474	AG	4	8	1145369	1145376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017474	TTG	2	6	1148859	1148864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017474	T	7	7	1148889	1148895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017474	TGC	2	6	1148963	1148968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017474	GC	3	6	1149012	1149017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_017474	CTTG	2	8	1149032	1149039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_017474	AGG	2	6	1149074	1149079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017474	AAT	2	6	1149102	1149107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017474	TGC	2	6	1149154	1149159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_017474	GAC	2	6	1149273	1149278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_017474	GCA	2	6	1149302	1149307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_017474	GAT	2	6	1149366	1149371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017474	GAT	2	6	1149402	1149407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017474	CGA	2	6	1149445	1149450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_017474	TTG	2	6	1149513	1149518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017474	GTTC	2	8	1149561	1149568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_017474	TGA	2	6	1149601	1149606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017474	GTT	2	6	1149657	1149662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017474	GTG	2	6	1149745	1149750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017474	GCA	2	6	1149807	1149812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_017474	TGG	2	6	1149986	1149991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017474	TTG	2	6	1150024	1150029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017474	ATT	2	6	1150038	1150043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017474	AGC	2	6	1150063	1150068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_017474	GTC	2	6	1150074	1150079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_017474	ACTT	2	8	1150098	1150105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_017474	GAA	2	6	1150118	1150123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017474	GAT	2	6	1150179	1150184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017474	GGTT	2	8	1150185	1150192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017474	CG	3	6	1150198	1150203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_017474	TAA	2	6	1150238	1150243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_017474	A	6	6	1150384	1150389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017474	GTC	2	6	1150445	1150450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_017474	TCA	2	6	1150479	1150484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_017474	TTC	2	6	1150583	1150588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_017474	GCT	2	6	1150627	1150632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_017474	ATTG	2	8	1150651	1150658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017474	CGG	2	6	1150669	1150674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017474	TGG	2	6	1150675	1150680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017474	TGA	2	6	1150729	1150734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017474	CGC	2	6	1150848	1150853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_017474	GGC	2	6	1150873	1150878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017474	AC	3	6	1151157	1151162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_017474	CA	3	6	1151180	1151185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_017474	TCC	2	6	1151205	1151210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_017474	CAG	2	6	1151339	1151344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017474	TGC	2	6	1151381	1151386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_017474	A	7	7	1151434	1151440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017474	TTGT	2	8	1151496	1151503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017474	TCC	2	6	1151962	1151967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_017474	GAC	2	6	1152044	1152049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017474	AAC	2	6	1152067	1152072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_017474	GGC	2	6	1152264	1152269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017474	CTA	2	6	1152274	1152279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_017474	AAT	2	6	1152322	1152327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017474	GACCC	2	10	1152338	1152347	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3618	NC_017474	TTA	2	6	1152380	1152385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017474	AGC	2	6	1152386	1152391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017474	TGA	2	6	1152439	1152444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017474	GAGCC	2	10	1152447	1152456	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3622	NC_017474	CAG	2	6	1153768	1153773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_017474	A	6	6	1153899	1153904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017474	TGA	2	6	1153914	1153919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017474	TCA	2	6	1153931	1153936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_017474	TTAT	2	8	1153994	1154001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017474	GGC	2	6	1154091	1154096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_017474	GAT	2	6	1154112	1154117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3630	NC_017474	GCC	2	6	1154203	1154208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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