MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017474	TAT	2	6	2632405	2632410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017474	TGG	2	6	2632476	2632481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017474	TCC	2	6	2633143	2633148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_017474	CCG	2	6	2633175	2633180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_017474	AAGC	2	8	2633311	2633318	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_017474	TCGC	2	8	2633343	2633350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_017474	CTA	2	6	2633353	2633358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_017474	TTTC	2	8	2633371	2633378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_017474	GCC	2	6	2633419	2633424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_017474	CTTA	2	8	2633502	2633509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8011	NC_017474	ATGCG	2	10	2633621	2633630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8012	NC_017474	TCG	2	6	2633732	2633737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_017474	GGA	2	6	2633759	2633764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017474	CCT	2	6	2633785	2633790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_017474	GTT	2	6	2633837	2633842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017474	GT	3	6	2633983	2633988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017474	AGG	2	6	2634027	2634032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017474	GCTC	2	8	2634105	2634112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_017474	GT	3	6	2634171	2634176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017474	CCAT	2	8	2634324	2634331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_017474	GT	3	6	2634340	2634345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017474	ATG	2	6	2634365	2634370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017474	TCC	2	6	2634391	2634396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8024	NC_017474	CACGA	2	10	2634490	2634499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8025	NC_017474	GAC	2	6	2634503	2634508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_017474	CAC	2	6	2634516	2634521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_017474	TC	3	6	2634553	2634558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_017474	TTC	2	6	2634591	2634596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_017474	CAGAC	2	10	2634824	2634833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8030	NC_017474	GCC	2	6	2634835	2634840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8031	NC_017474	TTC	2	6	2634854	2634859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017474	AT	3	6	2634861	2634866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017474	CAA	2	6	2635126	2635131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017474	CTT	2	6	2635154	2635159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017474	CTG	2	6	2635213	2635218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017474	ATC	2	6	2635287	2635292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_017474	CGC	2	6	2635329	2635334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_017474	TCCA	2	8	2635338	2635345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_017474	ATC	2	6	2635511	2635516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_017474	CGC	2	6	2635551	2635556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_017474	TGT	2	6	2635621	2635626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017474	CTT	2	6	2635654	2635659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017474	GAC	2	6	2635723	2635728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_017474	AT	3	6	2635749	2635754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017474	AAT	2	6	2635904	2635909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017474	TGG	2	6	2635947	2635952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017474	A	6	6	2635974	2635979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017474	GCC	2	6	2635981	2635986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_017474	TCC	2	6	2637515	2637520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_017474	TGA	3	9	2637542	2637550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017474	CAA	2	6	2637605	2637610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_017474	GT	3	6	2637623	2637628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017474	CTTG	2	8	2638664	2638671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_017474	GATG	2	8	2639641	2639648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017474	GTC	2	6	2639674	2639679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017474	AAC	2	6	2639696	2639701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_017474	TTTC	2	8	2639730	2639737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8058	NC_017474	A	6	6	2639741	2639746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017474	ATTG	2	8	2639772	2639779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017474	TCC	2	6	2640760	2640765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_017474	CCCT	2	8	2645544	2645551	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8062	NC_017474	ATT	2	6	2645566	2645571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017474	TAA	2	6	2645584	2645589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017474	TTTAT	2	10	2645595	2645604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017474	A	6	6	2645623	2645628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017474	CAA	2	6	2645629	2645634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017474	TA	5	10	2645642	2645651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017474	GAT	2	6	2645717	2645722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017474	TATT	2	8	2645723	2645730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017474	ATT	2	6	2645806	2645811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017474	GATC	2	8	2645822	2645829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_017474	T	7	7	2645835	2645841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017474	AC	3	6	2645853	2645858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_017474	CTG	2	6	2645887	2645892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_017474	CAT	2	6	2645899	2645904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_017474	AAG	2	6	2645924	2645929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017474	A	6	6	2645933	2645938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017474	AAG	2	6	2645960	2645965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017474	TA	3	6	2648168	2648173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_017474	ACA	2	6	2648185	2648190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_017474	TCC	2	6	2650055	2650060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_017474	A	7	7	2650613	2650619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017474	TCC	2	6	2650624	2650629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_017474	AGCC	2	8	2650683	2650690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_017474	AGCCT	2	10	2650939	2650948	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8086	NC_017474	TTAC	2	8	2651400	2651407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8087	NC_017474	AATA	2	8	2651457	2651464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017474	CCT	2	6	2653320	2653325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_017474	TGAT	2	8	2653362	2653369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017474	TCA	2	6	2653380	2653385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_017474	AATG	2	8	2653407	2653414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017474	CTT	2	6	2656970	2656975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_017474	TCT	2	6	2656976	2656981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_017474	TCC	2	6	2657600	2657605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_017474	T	7	7	2657638	2657644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017474	TCT	2	6	2657687	2657692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_017474	GCG	2	6	2657809	2657814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_017474	GCTT	2	8	2658083	2658090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8099	NC_017474	GTA	2	6	2658115	2658120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017474	T	6	6	2658134	2658139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017474	TGCA	2	8	2658222	2658229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8102	NC_017474	GAT	2	6	2658240	2658245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017474	TAAG	2	8	2659249	2659256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017474	T	7	7	2659280	2659286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017474	T	6	6	2659332	2659337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017474	AAT	2	6	2659338	2659343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017474	GAA	2	6	2659494	2659499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017474	AGG	2	6	2659501	2659506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017474	T	6	6	2660965	2660970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017474	ATG	2	6	2661580	2661585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017474	TTG	2	6	2661630	2661635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017474	ATAA	2	8	2661640	2661647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017474	TAA	2	6	2663959	2663964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017474	GGA	2	6	2663982	2663987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017474	A	7	7	2664584	2664590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017474	GTT	2	6	2664599	2664604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017474	CCAA	2	8	2664628	2664635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8118	NC_017474	AAG	2	6	2664685	2664690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017474	TAA	2	6	2664701	2664706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017474	T	7	7	2664718	2664724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017474	TGG	2	6	2664767	2664772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017474	TTG	2	6	2664895	2664900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017474	GGA	2	6	2664923	2664928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017474	AATC	2	8	2665670	2665677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_017474	GACT	2	8	2665678	2665685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8126	NC_017474	CTC	2	6	2667209	2667214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_017474	TTA	2	6	2671806	2671811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017474	TAA	2	6	2671859	2671864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017474	T	6	6	2671882	2671887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017474	T	6	6	2672032	2672037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017474	T	6	6	2672039	2672044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017474	GTT	2	6	2672046	2672051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_017474	TCC	2	6	2672593	2672598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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