MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017474	TGA	2	6	2489569	2489574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_017474	ACGC	2	8	2489643	2489650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_017474	GT	3	6	2489979	2489984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_017474	AGCC	2	8	2490041	2490048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_017474	TAA	3	9	2490680	2490688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_017474	TTA	2	6	2490730	2490735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_017474	ACAA	2	8	2490754	2490761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_017474	A	6	6	2490760	2490765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_017474	TC	3	6	2490811	2490816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7510	NC_017474	AT	3	6	2492088	2492093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_017474	A	7	7	2492134	2492140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_017474	GGC	2	6	2492147	2492152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_017474	T	6	6	2492181	2492186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_017474	TTAT	2	8	2492320	2492327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_017474	ACA	2	6	2492394	2492399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_017474	CCT	2	6	2499376	2499381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_017474	TC	3	6	2499398	2499403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7518	NC_017474	TTC	2	6	2499404	2499409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_017474	ACT	2	6	2499613	2499618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_017474	TTAT	2	8	2499625	2499632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_017474	TTTAGA	2	12	2500217	2500228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_017474	AAC	2	6	2501510	2501515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_017474	GCT	2	6	2501540	2501545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_017474	A	6	6	2501581	2501586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_017474	ACA	2	6	2501602	2501607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_017474	ATC	2	6	2502824	2502829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_017474	AGCA	2	8	2502861	2502868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7528	NC_017474	CAA	2	6	2502894	2502899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_017474	CATC	2	8	2502901	2502908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7530	NC_017474	A	6	6	2502972	2502977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_017474	CAA	2	6	2503002	2503007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_017474	GGT	2	6	2503016	2503021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_017474	CCA	2	6	2503660	2503665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_017474	T	6	6	2503708	2503713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_017474	ACTC	2	8	2503742	2503749	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7536	NC_017474	AGG	2	6	2503781	2503786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_017474	CTTG	2	8	2505757	2505764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7538	NC_017474	GTAG	2	8	2505780	2505787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_017474	TCC	2	6	2506080	2506085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7540	NC_017474	CTG	2	6	2506537	2506542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_017474	CCAA	2	8	2506955	2506962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7542	NC_017474	ATG	2	6	2506963	2506968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_017474	CTT	3	9	2508342	2508350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_017474	A	6	6	2508370	2508375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_017474	AGC	2	6	2508496	2508501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_017474	CAG	2	6	2508507	2508512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_017474	CAT	2	6	2508537	2508542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_017474	CCT	2	6	2508554	2508559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7549	NC_017474	CTG	2	6	2508960	2508965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_017474	GT	3	6	2509000	2509005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_017474	TCCCA	2	10	2509400	2509409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7552	NC_017474	TG	3	6	2509455	2509460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_017474	CGT	2	6	2509500	2509505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_017474	CCT	2	6	2513130	2513135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7555	NC_017474	A	6	6	2513181	2513186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_017474	GATAT	2	10	2513358	2513367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_017474	TAA	2	6	2513396	2513401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_017474	TA	3	6	2513402	2513407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_017474	TA	3	6	2513418	2513423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_017474	TTA	2	6	2513424	2513429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_017474	GTA	2	6	2513432	2513437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_017474	TTAA	2	8	2513448	2513455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_017474	AAT	2	6	2513466	2513471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_017474	GGTT	2	8	2513506	2513513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_017474	GCGA	2	8	2513555	2513562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7566	NC_017474	TCC	2	6	2513734	2513739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7567	NC_017474	CTTGTT	2	12	2513797	2513808	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7568	NC_017474	TCT	2	6	2513858	2513863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_017474	T	6	6	2513880	2513885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_017474	AT	3	6	2513990	2513995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_017474	T	7	7	2513995	2514001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_017474	T	8	8	2514025	2514032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_017474	ACA	2	6	2514059	2514064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7576	NC_017474	ACT	2	6	2514196	2514201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7579	NC_017474	AAT	2	6	2514329	2514334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_017474	T	6	6	2516037	2516042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_017474	CTA	2	6	2516050	2516055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_017474	TGA	2	6	2516073	2516078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_017474	A	6	6	2516095	2516100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_017474	CTG	2	6	2516160	2516165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_017474	ACA	2	6	2516172	2516177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_017474	GTT	2	6	2516186	2516191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_017474	A	6	6	2516894	2516899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_017474	AAAT	2	8	2516927	2516934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_017474	ATCA	2	8	2517000	2517007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7595	NC_017474	TAA	2	6	2517048	2517053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7597	NC_017474	AT	3	6	2517383	2517388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_017474	A	6	6	2517510	2517515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_017474	TCA	2	6	2517518	2517523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_017474	GTC	2	6	2517535	2517540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_017474	TCC	2	6	2517824	2517829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7605	NC_017474	GCTA	2	8	2518098	2518105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7606	NC_017474	AC	3	6	2518110	2518115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7607	NC_017474	T	7	7	2518174	2518180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_017474	A	6	6	2518196	2518201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7610	NC_017474	A	6	6	2518216	2518221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_017474	ACG	2	6	2518231	2518236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_017474	T	6	6	2518241	2518246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_017474	TTA	2	6	2518273	2518278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_017474	ATG	2	6	2518289	2518294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_017474	ACCA	2	8	2518579	2518586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7616	NC_017474	TGGT	2	8	2518613	2518620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_017474	T	6	6	2518624	2518629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_017474	ATA	2	6	2518655	2518660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_017474	CAG	2	6	2518699	2518704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7621	NC_017474	AAC	2	6	2518813	2518818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_017474	T	6	6	2518875	2518880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_017474	TAA	2	6	2519119	2519124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_017474	GTA	2	6	2519127	2519132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_017474	TGC	2	6	2519271	2519276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_017474	AATG	2	8	2520158	2520165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_017474	CGT	2	6	2520189	2520194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_017474	ATC	2	6	2520218	2520223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_017474	A	7	7	2520256	2520262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_017474	ACTCT	2	10	2520283	2520292	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7631	NC_017474	AAG	3	9	2520303	2520311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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