MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017474	A	6	6	2307459	2307464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017474	TCA	2	6	2307473	2307478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017474	CGC	2	6	2309092	2309097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_017474	TTCT	2	8	2311070	2311077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_017474	CAA	2	6	2311400	2311405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017474	GCC	2	6	2312365	2312370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_017474	G	6	6	2312388	2312393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017474	CTTT	2	8	2315737	2315744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_017474	AAT	2	6	2315785	2315790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017474	T	7	7	2315809	2315815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017474	TCA	2	6	2315864	2315869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017474	ACA	2	6	2315892	2315897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_017474	C	6	6	2316355	2316360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7014	NC_017474	TCA	2	6	2316383	2316388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_017474	A	6	6	2316438	2316443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017474	TCA	2	6	2316486	2316491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_017474	AG	3	6	2316675	2316680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017474	TC	3	6	2316699	2316704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_017474	AGGA	2	8	2316708	2316715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017474	CAC	2	6	2317011	2317016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_017474	TTA	2	6	2317899	2317904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017474	TGA	2	6	2317913	2317918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017474	CAA	2	6	2317992	2317997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_017474	TGAT	2	8	2318022	2318029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017474	GATG	2	8	2318057	2318064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017474	ATA	2	6	2318072	2318077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017474	TGAT	2	8	2318088	2318095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017474	ACA	2	6	2318112	2318117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_017474	TGAT	2	8	2318154	2318161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017474	CCT	2	6	2318193	2318198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_017474	TTC	2	6	2318527	2318532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_017474	TGAT	2	8	2318550	2318557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017474	TGAT	2	8	2318616	2318623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017474	TGAT	2	8	2318682	2318689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017474	GAGACC	2	12	2318703	2318714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_017474	TGAT	2	8	2318748	2318755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017474	CG	3	6	2318773	2318778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_017474	TGAT	2	8	2318814	2318821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017474	GTT	2	6	2318844	2318849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017474	TGAT	2	8	2318880	2318887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_017474	TGAT	2	8	2318946	2318953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_017474	TTC	2	6	2318975	2318980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_017474	TGAT	2	8	2319012	2319019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_017474	TGT	2	6	2319046	2319051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017474	TCA	2	6	2319058	2319063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_017474	TGAT	2	8	2319078	2319085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_017474	TGAT	2	8	2319144	2319151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017474	GTC	2	6	2319179	2319184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_017474	TGAT	2	8	2319210	2319217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_017474	TGAT	2	8	2319276	2319283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017474	TTG	2	6	2319310	2319315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017474	TGAT	2	8	2319342	2319349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017474	TGT	2	6	2319379	2319384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017474	TGAT	2	8	2319408	2319415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_017474	CA	3	6	2319443	2319448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_017474	GAC	2	6	2321374	2321379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_017474	TGAT	2	8	2321398	2321405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017474	CAAA	2	8	2321427	2321434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7059	NC_017474	CATA	2	8	2321473	2321480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7060	NC_017474	T	7	7	2321509	2321515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017474	TTG	2	6	2325648	2325653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017474	TAA	2	6	2325678	2325683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017474	A	7	7	2325710	2325716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017474	TCA	2	6	2325720	2325725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_017474	T	6	6	2327728	2327733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_017474	TCA	2	6	2327793	2327798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_017474	TAA	2	6	2327844	2327849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_017474	GAAT	2	8	2327887	2327894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_017474	ATT	2	6	2327898	2327903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017474	A	6	6	2328328	2328333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017474	A	6	6	2328862	2328867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017474	TCC	2	6	2334803	2334808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_017474	GATT	2	8	2334816	2334823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017474	GAA	2	6	2335017	2335022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_017474	ATTC	2	8	2336362	2336369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7076	NC_017474	CGC	2	6	2336387	2336392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_017474	TGA	2	6	2336592	2336597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7079	NC_017474	T	6	6	2337806	2337811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017474	CAA	2	6	2337952	2337957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_017474	GAT	2	6	2337968	2337973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_017474	TA	3	6	2338807	2338812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017474	TAG	2	6	2338814	2338819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_017474	TGC	2	6	2339012	2339017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_017474	TGA	2	6	2339027	2339032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_017474	GT	3	6	2339056	2339061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_017474	T	6	6	2339077	2339082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_017474	CGC	2	6	2340726	2340731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_017474	A	7	7	2340910	2340916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_017474	TTA	2	6	2341572	2341577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_017474	TTA	2	6	2341579	2341584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_017474	TGAT	2	8	2341611	2341618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_017474	A	8	8	2341685	2341692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_017474	GAAA	2	8	2341695	2341702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_017474	TGG	2	6	2341705	2341710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_017474	TTC	2	6	2342110	2342115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_017474	T	7	7	2342139	2342145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_017474	CTCA	2	8	2342213	2342220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_017474	CAA	2	6	2342278	2342283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_017474	GGA	2	6	2342319	2342324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_017474	ACA	2	6	2343140	2343145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017474	T	7	7	2343264	2343270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017474	AAT	2	6	2343308	2343313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017474	A	6	6	2344892	2344897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_017474	GTT	2	6	2344906	2344911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_017474	T	7	7	2344935	2344941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017474	ACG	2	6	2344944	2344949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_017474	GAT	2	6	2345972	2345977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_017474	TATTTT	2	12	2346019	2346030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_017474	TTG	2	6	2346036	2346041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_017474	CAG	2	6	2347194	2347199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_017474	ATG	2	6	2347301	2347306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_017474	CAAT	2	8	2347324	2347331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7115	NC_017474	CCT	2	6	2348920	2348925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_017474	AC	3	6	2349018	2349023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_017474	TGC	2	6	2349028	2349033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_017474	CTTG	2	8	2349752	2349759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_017474	TCA	2	6	2349787	2349792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_017474	CTT	2	6	2349915	2349920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_017474	ACA	2	6	2350202	2350207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_017474	A	7	7	2350229	2350235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_017474	ACT	2	6	2350331	2350336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_017474	GTAT	2	8	2350346	2350353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_017474	TCTT	2	8	2350395	2350402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_017474	T	6	6	2350401	2350406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_017474	TAA	2	6	2350546	2350551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017474	A	7	7	2351182	2351188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_017474	T	6	6	2351209	2351214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_017474	CATT	2	8	2351219	2351226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7131	NC_017474	TCC	2	6	2352273	2352278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7132	NC_017474	TG	3	6	2352285	2352290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_017474	TAAC	2	8	2352297	2352304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7134	NC_017474	TG	3	6	2352346	2352351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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