MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017474	GTT	3	9	2163974	2163982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_017474	AGA	2	6	2163989	2163994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017474	TTA	2	6	2163999	2164004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017474	CAT	2	6	2164851	2164856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_017474	A	6	6	2164880	2164885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_017474	A	7	7	2164910	2164916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_017474	T	6	6	2164941	2164946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_017474	AGT	2	6	2165647	2165652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017474	ACG	2	6	2165654	2165659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_017474	AGTA	2	8	2165670	2165677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017474	TCG	2	6	2165678	2165683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_017474	A	6	6	2166906	2166911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017474	GGT	2	6	2166944	2166949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017474	GCG	2	6	2167285	2167290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_017474	ATT	2	6	2167341	2167346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017474	TAA	2	6	2167347	2167352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017474	TTAA	3	12	2167469	2167480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017474	A	6	6	2167479	2167484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_017474	A	7	7	2167493	2167499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017474	TCA	2	6	2168188	2168193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_017474	CGA	2	6	2168209	2168214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_017474	AAT	2	6	2168264	2168269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017474	GAC	2	6	2168332	2168337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_017474	TG	3	6	2168372	2168377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_017474	CCG	2	6	2172484	2172489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_017474	ACT	2	6	2172519	2172524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_017474	GCAG	2	8	2172537	2172544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_017474	GTT	2	6	2172582	2172587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017474	CCT	2	6	2174239	2174244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_017474	CTTAC	2	10	2174257	2174266	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6531	NC_017474	A	7	7	2174312	2174318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017474	TTAT	2	8	2174409	2174416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_017474	AAG	2	6	2174424	2174429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_017474	TAA	2	6	2174441	2174446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_017474	TGAT	2	8	2174472	2174479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_017474	TTTA	2	8	2174629	2174636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017474	ATT	2	6	2176140	2176145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_017474	TTGA	2	8	2176166	2176173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_017474	CTG	2	6	2176195	2176200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017474	TTG	2	6	2176239	2176244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_017474	AAC	2	6	2176392	2176397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_017474	GTT	2	6	2176423	2176428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_017474	ATG	2	6	2176518	2176523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_017474	ATG	2	6	2176545	2176550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_017474	AAG	2	6	2176555	2176560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_017474	CAA	2	6	2176596	2176601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_017474	CAC	2	6	2176651	2176656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_017474	A	7	7	2177697	2177703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_017474	CA	3	6	2177705	2177710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_017474	ATT	2	6	2177712	2177717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_017474	TG	3	6	2177721	2177726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017474	CGC	2	6	2178336	2178341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_017474	GGC	2	6	2178460	2178465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_017474	GTG	2	6	2178491	2178496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_017474	A	6	6	2178634	2178639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_017474	A	6	6	2178685	2178690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_017474	CTT	2	6	2178696	2178701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_017474	TCA	2	6	2178713	2178718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_017474	CAA	2	6	2178719	2178724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_017474	CCA	2	6	2178770	2178775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_017474	AC	3	6	2178807	2178812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_017474	A	6	6	2178841	2178846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017474	GTC	2	6	2178872	2178877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_017474	CAA	2	6	2178926	2178931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_017474	AACT	2	8	2178933	2178940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_017474	ATGA	2	8	2178985	2178992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_017474	CA	3	6	2179008	2179013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_017474	A	6	6	2179021	2179026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_017474	TGT	2	6	2179040	2179045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_017474	ACGA	2	8	2179170	2179177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_017474	TCGT	2	8	2179197	2179204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_017474	ATT	2	6	2179221	2179226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6575	NC_017474	TGT	2	6	2179325	2179330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_017474	ATT	2	6	2179465	2179470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_017474	TGAATC	2	12	2179481	2179492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6579	NC_017474	A	7	7	2182574	2182580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_017474	CTT	2	6	2182588	2182593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_017474	ACTA	2	8	2182608	2182615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6582	NC_017474	ATA	2	6	2182947	2182952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_017474	T	6	6	2185307	2185312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6592	NC_017474	ATA	2	6	2187492	2187497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_017474	TTA	2	6	2187502	2187507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6595	NC_017474	TTG	2	6	2187559	2187564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_017474	CT	3	6	2187729	2187734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_017474	ACT	2	6	2187788	2187793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_017474	CTT	2	6	2187826	2187831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_017474	AT	3	6	2187836	2187841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_017474	A	7	7	2187849	2187855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_017474	CAG	2	6	2187865	2187870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6609	NC_017474	TCGCAG	2	12	2188151	2188162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6613	NC_017474	TGA	2	6	2191260	2191265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6615	NC_017474	ATG	2	6	2191303	2191308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6617	NC_017474	CAT	2	6	2191321	2191326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_017474	T	7	7	2191343	2191349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6622	NC_017474	AT	3	6	2191472	2191477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_017474	GTTT	2	8	2191495	2191502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_017474	A	6	6	2192284	2192289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_017474	CCAG	2	8	2192334	2192341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_017474	ACA	2	6	2192412	2192417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_017474	TGT	2	6	2192441	2192446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_017474	T	6	6	2192498	2192503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_017474	ATGA	2	8	2192581	2192588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_017474	CTC	2	6	2195186	2195191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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