MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017474	GAG	2	6	1996599	1996604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017474	ATG	2	6	1996685	1996690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017474	CATGGT	2	12	1996694	1996705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6004	NC_017474	AGG	2	6	1996753	1996758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017474	TCA	2	6	1997567	1997572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_017474	CCT	2	6	1997583	1997588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_017474	TGG	2	6	1997604	1997609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017474	T	7	7	1997619	1997625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017474	CTG	2	6	1997638	1997643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_017474	CCA	2	6	1997649	1997654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_017474	ACA	2	6	1997660	1997665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017474	TTA	2	6	1997686	1997691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017474	TTC	2	6	1997701	1997706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017474	GT	3	6	1997732	1997737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017474	T	7	7	1998448	1998454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017474	TTG	2	6	1998497	1998502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017474	CGAA	2	8	1999420	1999427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_017474	AGG	2	6	1999497	1999502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017474	AAC	2	6	2000328	2000333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_017474	A	6	6	2000414	2000419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017474	GTC	2	6	2001083	2001088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017474	T	6	6	2001098	2001103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017474	TTA	2	6	2001105	2001110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017474	TGC	2	6	2001125	2001130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_017474	TAA	2	6	2001172	2001177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017474	GGT	2	6	2001221	2001226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017474	ATC	2	6	2001274	2001279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_017474	TAT	2	6	2003216	2003221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017474	A	6	6	2003225	2003230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017474	AAC	2	6	2003275	2003280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_017474	CA	3	6	2003302	2003307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_017474	ACG	2	6	2003308	2003313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_017474	TCC	2	6	2004736	2004741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_017474	TG	3	6	2004772	2004777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017474	GGCT	2	8	2009349	2009356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_017474	CTC	2	6	2010496	2010501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_017474	CCT	2	6	2011241	2011246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_017474	TTG	2	6	2011259	2011264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017474	TA	3	6	2011271	2011276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017474	ATC	2	6	2012884	2012889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_017474	AT	3	6	2012921	2012926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017474	TAC	2	6	2012932	2012937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017474	CCT	2	6	2013231	2013236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_017474	T	6	6	2013236	2013241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017474	A	7	7	2013263	2013269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017474	GA	3	6	2013901	2013906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017474	TTA	2	6	2015058	2015063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017474	T	7	7	2015109	2015115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_017474	TAC	2	6	2015259	2015264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_017474	TAG	2	6	2015265	2015270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017474	CTT	2	6	2016476	2016481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017474	TTA	2	6	2016490	2016495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017474	TCAA	2	8	2016513	2016520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_017474	T	6	6	2017406	2017411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017474	CAA	2	6	2017417	2017422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_017474	GTC	2	6	2017448	2017453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_017474	ATC	2	6	2017465	2017470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_017474	ATT	2	6	2017479	2017484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017474	CAA	2	6	2017496	2017501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_017474	AGG	2	6	2017594	2017599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017474	A	7	7	2020781	2020787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017474	CTGAT	2	10	2020797	2020806	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_017474	T	6	6	2020820	2020825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017474	AAC	2	6	2022307	2022312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_017474	AGC	2	6	2022351	2022356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_017474	TCCA	2	8	2022372	2022379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_017474	CGATA	2	10	2022386	2022395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_017474	GGA	2	6	2022411	2022416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017474	AACT	2	8	2023170	2023177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_017474	AAGG	2	8	2023262	2023269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017474	CAT	2	6	2024324	2024329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_017474	TAC	2	6	2025334	2025339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_017474	AGG	2	6	2025421	2025426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017474	TC	3	6	2026605	2026610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_017474	TAG	2	6	2026612	2026617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_017474	A	6	6	2030221	2030226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_017474	CCT	2	6	2030227	2030232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_017474	TTC	2	6	2030234	2030239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017474	GTC	2	6	2030285	2030290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_017474	CCT	2	6	2031314	2031319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_017474	T	6	6	2031455	2031460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017474	TGC	2	6	2032556	2032561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_017474	ACCA	2	8	2032595	2032602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_017474	TCAAG	2	10	2034380	2034389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6086	NC_017474	CAAAC	2	10	2034403	2034412	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6087	NC_017474	CTG	2	6	2034432	2034437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_017474	TG	3	6	2034436	2034441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017474	CAG	3	9	2034447	2034455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_017474	GACATG	2	12	2034462	2034473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6091	NC_017474	TCA	2	6	2034490	2034495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_017474	GAA	2	6	2034510	2034515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017474	A	7	7	2034536	2034542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_017474	A	6	6	2034565	2034570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017474	CAT	2	6	2034588	2034593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_017474	TCA	2	6	2034596	2034601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_017474	CAA	2	6	2034607	2034612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_017474	A	6	6	2034657	2034662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017474	TTC	2	6	2035673	2035678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017474	ATT	2	6	2035692	2035697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017474	TGT	2	6	2035718	2035723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017474	TTCC	2	8	2035773	2035780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_017474	CAA	2	6	2035811	2035816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017474	A	6	6	2035815	2035820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017474	GT	3	6	2036196	2036201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017474	TCA	2	6	2039851	2039856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_017474	CATTT	2	10	2039876	2039885	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6108	NC_017474	ATC	2	6	2039901	2039906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017474	TTAC	2	8	2040340	2040347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6110	NC_017474	CATT	2	8	2040401	2040408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_017474	T	6	6	2040724	2040729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017474	ACC	2	6	2040777	2040782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_017474	GCA	2	6	2040816	2040821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_017474	CTC	2	6	2044462	2044467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_017474	TAT	2	6	2044495	2044500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017474	TTA	2	6	2044507	2044512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017474	TATT	2	8	2044523	2044530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017474	T	6	6	2044563	2044568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017474	TAACCT	2	12	2044665	2044676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017474	TTTA	2	8	2045577	2045584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017474	T	6	6	2045611	2045616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_017474	A	6	6	2045675	2045680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_017474	CAC	2	6	2047611	2047616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_017474	CTTTCA	2	12	2047727	2047738	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_017474	A	6	6	2047738	2047743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017474	A	6	6	2047746	2047751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017474	GA	4	8	2049482	2049489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017474	TTA	2	6	2049505	2049510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017474	AAC	2	6	2049525	2049530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_017474	GTT	2	6	2049550	2049555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_017474	CTA	2	6	2049599	2049604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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