MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017474	TGG	2	6	1812787	1812792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017474	GACC	2	8	1816542	1816549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_017474	ATTG	2	8	1816595	1816602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017474	CCT	2	6	1819458	1819463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_017474	AATT	2	8	1819509	1819516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017474	TCTTTG	2	12	1819527	1819538	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5507	NC_017474	T	6	6	1819595	1819600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017474	A	6	6	1819609	1819614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017474	TCT	2	6	1819624	1819629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017474	TGA	2	6	1819633	1819638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017474	CTT	2	6	1820186	1820191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017474	CTC	2	6	1820885	1820890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_017474	AAC	2	6	1820913	1820918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017474	TTC	2	6	1825804	1825809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017474	A	7	7	1825865	1825871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017474	ACC	2	6	1825905	1825910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_017474	CAA	2	6	1825942	1825947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017474	TAA	2	6	1826164	1826169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017474	A	6	6	1826168	1826173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017474	TCA	2	6	1826181	1826186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017474	AAC	2	6	1826355	1826360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017474	TGT	2	6	1826384	1826389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017474	AAT	2	6	1826485	1826490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017474	TA	3	6	1826958	1826963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017474	GCT	2	6	1827094	1827099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_017474	TGA	2	6	1827640	1827645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017474	AC	3	6	1827646	1827651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_017474	TTTG	2	8	1828490	1828497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017474	TCT	2	6	1828520	1828525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017474	TGT	2	6	1828551	1828556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017474	CTA	2	6	1828562	1828567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017474	TGC	2	6	1828620	1828625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017474	TG	3	6	1830051	1830056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017474	TGTT	2	8	1830096	1830103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017474	TGA	2	6	1830127	1830132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017474	A	6	6	1830167	1830172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017474	T	6	6	1832537	1832542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017474	AATA	2	8	1832701	1832708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017474	CCT	2	6	1834178	1834183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_017474	CATT	2	8	1834184	1834191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_017474	TTC	2	6	1834268	1834273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017474	A	7	7	1834288	1834294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017474	CGC	2	6	1834300	1834305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_017474	ACAG	2	8	1834315	1834322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_017474	CAA	2	6	1834673	1834678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017474	CTA	2	6	1834704	1834709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_017474	TTACC	2	10	1834770	1834779	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5548	NC_017474	CCT	2	6	1835359	1835364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_017474	TCA	2	6	1835430	1835435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_017474	GC	3	6	1835467	1835472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_017474	GCC	2	6	1836625	1836630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_017474	ATC	2	6	1836645	1836650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017474	CTC	2	6	1839329	1839334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_017474	GGCA	2	8	1839345	1839352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_017474	CCG	2	6	1839405	1839410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_017474	T	6	6	1839454	1839459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017474	TTATA	2	10	1841133	1841142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017474	CT	3	6	1841247	1841252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_017474	AAG	2	6	1841270	1841275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017474	TTC	2	6	1841295	1841300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017474	TGAA	2	8	1841361	1841368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017474	ATC	2	6	1841392	1841397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017474	AGC	2	6	1841434	1841439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017474	AGG	3	9	1841492	1841500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017474	TA	3	6	1845693	1845698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017474	TCC	2	6	1846121	1846126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_017474	TCAAA	2	10	1846127	1846136	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5568	NC_017474	TCC	2	6	1846357	1846362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_017474	GTT	2	6	1846946	1846951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017474	A	6	6	1846974	1846979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017474	AAC	2	6	1848336	1848341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017474	ATGA	2	8	1848348	1848355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017474	AAT	2	6	1848956	1848961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017474	TTCC	2	8	1849032	1849039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_017474	TTGA	2	8	1849044	1849051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017474	T	6	6	1851053	1851058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017474	GAA	2	6	1851060	1851065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017474	A	6	6	1851069	1851074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017474	TCCG	2	8	1851482	1851489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_017474	CAT	2	6	1851517	1851522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017474	GAT	2	6	1853915	1853920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017474	TTA	2	6	1854422	1854427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017474	GCT	2	6	1858573	1858578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_017474	AGTT	2	8	1858593	1858600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017474	ATG	2	6	1859478	1859483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017474	GTCA	2	8	1859490	1859497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_017474	TAT	2	6	1859515	1859520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017474	CAA	2	6	1859560	1859565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_017474	AAT	2	6	1863412	1863417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017474	AAAAG	2	10	1863492	1863501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017474	T	6	6	1863527	1863532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017474	ATG	2	6	1864619	1864624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017474	CAA	2	6	1864672	1864677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017474	CA	3	6	1864687	1864692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_017474	AGA	2	6	1864717	1864722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017474	TCA	2	6	1864791	1864796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_017474	T	6	6	1865882	1865887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_017474	ATGA	2	8	1865889	1865896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017474	CTTG	2	8	1865898	1865905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_017474	GCA	2	6	1865909	1865914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017474	ACT	2	6	1866697	1866702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_017474	AGAGC	2	10	1866803	1866812	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5603	NC_017474	TGATA	2	10	1868933	1868942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017474	A	6	6	1868965	1868970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017474	GCA	2	6	1868988	1868993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5607	NC_017474	TG	3	6	1869848	1869853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017474	TAG	2	6	1869884	1869889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017474	TG	3	6	1869924	1869929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017474	AATT	2	8	1870872	1870879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017474	AATG	2	8	1870915	1870922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017474	TTGT	2	8	1870931	1870938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017474	A	7	7	1870946	1870952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017474	ACTG	2	8	1871018	1871025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_017474	GTC	2	6	1872003	1872008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_017474	ACT	2	6	1872030	1872035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017474	AAGG	2	8	1872066	1872073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017474	TGGT	2	8	1872187	1872194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017474	CAC	2	6	1872212	1872217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_017474	TCC	2	6	1874761	1874766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_017474	AGC	2	6	1875738	1875743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_017474	TG	3	6	1875755	1875760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017474	TTG	2	6	1875795	1875800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017474	CCA	2	6	1876300	1876305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_017474	TTG	2	6	1876309	1876314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017474	AGTC	2	8	1876321	1876328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_017474	TCC	2	6	1878147	1878152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_017474	ATG	3	9	1878157	1878165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_017474	A	6	6	1878171	1878176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017474	TC	3	6	1878184	1878189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_017474	GC	3	6	1878268	1878273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5633	NC_017474	TCA	2	6	1878480	1878485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_017474	GAC	2	6	1878488	1878493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5642	NC_017474	AAT	2	6	1879492	1879497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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