MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017474	GAA	2	6	1434466	1434471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017474	CAC	2	6	1436441	1436446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_017474	TAA	2	6	1436448	1436453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_017474	CAC	2	6	1436545	1436550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_017474	AGC	2	6	1436992	1436997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017474	T	6	6	1436998	1437003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017474	CTTT	2	8	1437005	1437012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_017474	GATTA	2	10	1437014	1437023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017474	GAAGA	2	10	1437123	1437132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017474	ATTT	2	8	1439441	1439448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017474	TTG	2	6	1439500	1439505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017474	ATC	2	6	1439515	1439520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_017474	ATG	2	6	1439552	1439557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017474	AGC	2	6	1439575	1439580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017474	AAAG	2	8	1441064	1441071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017474	T	6	6	1441089	1441094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017474	GCG	2	6	1441100	1441105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017474	CAA	2	6	1442278	1442283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017474	AGA	2	6	1446687	1446692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017474	TTTG	2	8	1446749	1446756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017474	CCAT	2	8	1446802	1446809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_017474	T	6	6	1446885	1446890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017474	ATC	2	6	1446907	1446912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_017474	CAA	2	6	1446944	1446949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_017474	TCC	2	6	1447679	1447684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_017474	GAC	2	6	1447739	1447744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017474	TCA	2	6	1447752	1447757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_017474	T	6	6	1447766	1447771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017474	A	6	6	1447869	1447874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017474	AAAG	2	8	1449885	1449892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017474	CAA	2	6	1449899	1449904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_017474	A	8	8	1449916	1449923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_017474	TCG	2	6	1449990	1449995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017474	TCG	2	6	1450029	1450034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_017474	CGAT	2	8	1450071	1450078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_017474	TTG	2	6	1450079	1450084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017474	ACA	2	6	1450090	1450095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017474	CTC	2	6	1450180	1450185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_017474	GTT	2	6	1450221	1450226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017474	CT	3	6	1450319	1450324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_017474	GAT	2	6	1450339	1450344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017474	TAT	2	6	1450366	1450371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017474	GTT	2	6	1450418	1450423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017474	TAA	2	6	1450431	1450436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017474	GTT	2	6	1450497	1450502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017474	A	7	7	1451276	1451282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017474	CTT	2	6	1451296	1451301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_017474	TCT	2	6	1451894	1451899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_017474	TGC	2	6	1451960	1451965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_017474	AAGA	2	8	1452002	1452009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017474	A	7	7	1452074	1452080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017474	T	6	6	1452117	1452122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017474	TGA	2	6	1452130	1452135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017474	AACA	2	8	1452155	1452162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_017474	T	8	8	1452225	1452232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017474	CTA	2	6	1452236	1452241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_017474	TA	3	6	1452240	1452245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017474	TGC	3	9	1452299	1452307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_017474	GA	3	6	1452319	1452324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017474	T	7	7	1452454	1452460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017474	GGT	2	6	1452484	1452489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017474	GTA	3	9	1452522	1452530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017474	TGC	2	6	1452561	1452566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_017474	GCA	2	6	1452601	1452606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4566	NC_017474	T	6	6	1453527	1453532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017474	A	6	6	1453561	1453566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017474	CAA	2	6	1453574	1453579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_017474	ACA	2	6	1453692	1453697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_017474	AAG	2	6	1459013	1459018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017474	AGTT	2	8	1459040	1459047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017474	TGGAG	2	10	1459114	1459123	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017474	T	7	7	1461144	1461150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017474	TAA	2	6	1461153	1461158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017474	CACTT	2	10	1461216	1461225	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4576	NC_017474	CAGA	2	8	1461237	1461244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_017474	TG	3	6	1461253	1461258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4583	NC_017474	GGC	2	6	1463225	1463230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_017474	T	6	6	1463231	1463236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017474	AAT	2	6	1463251	1463256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_017474	TAT	2	6	1474943	1474948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017474	GCAAT	2	10	1474964	1474973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4594	NC_017474	AGTA	3	12	1475040	1475051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4597	NC_017474	AC	3	6	1475126	1475131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_017474	GGC	2	6	1475425	1475430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_017474	T	7	7	1475432	1475438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017474	GCG	2	6	1475467	1475472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017474	TTCC	2	8	1476361	1476368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_017474	CGG	2	6	1476400	1476405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017474	ATC	2	6	1476421	1476426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4605	NC_017474	TGA	2	6	1478196	1478201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4608	NC_017474	GTA	2	6	1479273	1479278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017474	AGG	2	6	1479339	1479344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017474	T	6	6	1479349	1479354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017474	GCTT	2	8	1480574	1480581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_017474	T	6	6	1480587	1480592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017474	AGG	2	6	1480986	1480991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017474	A	7	7	1482808	1482814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017474	T	6	6	1482832	1482837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017474	TGT	2	6	1484309	1484314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_017474	T	7	7	1485751	1485757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017474	GTGTT	2	10	1485875	1485884	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017474	AGG	2	6	1485912	1485917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4623	NC_017474	A	7	7	1487093	1487099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017474	AGG	2	6	1487166	1487171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4627	NC_017474	AACA	2	8	1491402	1491409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_017474	CAC	2	6	1491635	1491640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_017474	A	6	6	1491679	1491684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017474	TTC	2	6	1495376	1495381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_017474	TGA	2	6	1495389	1495394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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