MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017473	A	6	6	2804588	2804593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_017473	TCC	2	6	2805658	2805663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_017473	T	6	6	2806327	2806332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_017473	AAG	2	6	2806348	2806353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_017473	AAT	2	6	2807146	2807151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_017473	GAG	2	6	2807171	2807176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_017473	ATT	2	6	2808796	2808801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_017473	TTC	2	6	2808844	2808849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_017473	A	6	6	2809603	2809608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_017473	GC	3	6	2809634	2809639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8511	NC_017473	TAA	2	6	2809683	2809688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_017473	CAA	2	6	2809699	2809704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_017473	A	6	6	2810495	2810500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_017473	GCC	2	6	2810501	2810506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_017473	CA	3	6	2811171	2811176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8516	NC_017473	TGC	2	6	2811351	2811356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_017473	CATT	2	8	2811475	2811482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8518	NC_017473	ATC	2	6	2811667	2811672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_017473	T	6	6	2811790	2811795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_017473	TAT	2	6	2813039	2813044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_017473	CAT	2	6	2813064	2813069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_017473	ATT	2	6	2813094	2813099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_017473	T	7	7	2813117	2813123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_017473	AAT	2	6	2813158	2813163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_017473	CTG	2	6	2813212	2813217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_017473	AATT	2	8	2813271	2813278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_017473	CAA	2	6	2813283	2813288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_017473	GCTT	2	8	2813324	2813331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_017473	TG	3	6	2816406	2816411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_017473	CTT	2	6	2818590	2818595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_017473	CTT	2	6	2818651	2818656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_017473	GAACG	2	10	2818657	2818666	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8533	NC_017473	GCCA	2	8	2818684	2818691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8534	NC_017473	CAA	2	6	2818810	2818815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_017473	ACC	2	6	2818823	2818828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_017473	AAC	2	6	2818883	2818888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_017473	TCC	2	6	2818905	2818910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8538	NC_017473	TAT	2	6	2818911	2818916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_017473	GTTT	2	8	2819037	2819044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_017473	AAGT	2	8	2819050	2819057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_017473	ACA	2	6	2819066	2819071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_017473	C	6	6	2821289	2821294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8543	NC_017473	ACA	2	6	2821339	2821344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_017473	CAA	2	6	2821421	2821426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_017473	GC	3	6	2821474	2821479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8546	NC_017473	TTAT	2	8	2821480	2821487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_017473	A	7	7	2821530	2821536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_017473	A	6	6	2821579	2821584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_017473	T	6	6	2821614	2821619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_017473	CTG	2	6	2821630	2821635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_017473	TGAA	2	8	2821652	2821659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_017473	TGC	2	6	2821668	2821673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8553	NC_017473	T	6	6	2821744	2821749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_017473	AAATT	2	10	2821751	2821760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_017473	CAT	2	6	2821772	2821777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_017473	ATT	2	6	2822475	2822480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_017473	CCT	2	6	2824138	2824143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8558	NC_017473	TC	3	6	2827955	2827960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8559	NC_017473	GA	3	6	2827994	2827999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_017473	A	6	6	2828033	2828038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_017473	AAC	2	6	2828059	2828064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_017473	GCTT	2	8	2828186	2828193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8563	NC_017473	ACTG	3	12	2828975	2828986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8564	NC_017473	GTT	2	6	2828988	2828993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_017473	CGC	2	6	2829069	2829074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8566	NC_017473	TCC	2	6	2829968	2829973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8567	NC_017473	T	6	6	2829981	2829986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017473	GGTCAG	2	12	2829990	2830001	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8569	NC_017473	T	6	6	2830004	2830009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_017473	TGT	2	6	2830920	2830925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_017473	CCT	2	6	2830927	2830932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_017473	TGC	2	6	2830943	2830948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_017473	T	6	6	2831043	2831048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_017473	GCTAA	2	10	2831063	2831072	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8575	NC_017473	GCTT	2	8	2831085	2831092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8576	NC_017473	TCA	2	6	2831886	2831891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_017473	TAT	2	6	2832574	2832579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_017473	TCC	2	6	2832979	2832984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8579	NC_017473	CT	3	6	2835010	2835015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8580	NC_017473	TCGCAG	2	12	2835025	2835036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_017473	TCC	2	6	2836213	2836218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8582	NC_017473	TAT	2	6	2836299	2836304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_017473	TTAA	2	8	2836416	2836423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_017473	TTC	2	6	2836450	2836455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_017473	AGA	2	6	2836522	2836527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_017473	TACA	2	8	2836528	2836535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8587	NC_017473	AGC	2	6	2836540	2836545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8588	NC_017473	TC	3	6	2836568	2836573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8589	NC_017473	T	7	7	2837347	2837353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_017473	AGA	2	6	2837368	2837373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_017473	CTT	2	6	2837387	2837392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_017473	CCT	2	6	2838520	2838525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8593	NC_017473	TGT	2	6	2838538	2838543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_017473	CCA	2	6	2838612	2838617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8595	NC_017473	AAGT	2	8	2838704	2838711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_017473	CAT	2	6	2838777	2838782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_017473	GCGGCA	2	12	2838842	2838853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_017473	ATC	2	6	2838865	2838870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_017473	CCG	2	6	2838936	2838941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8600	NC_017473	TGA	2	6	2838968	2838973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_017473	TGCC	2	8	2839020	2839027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_017473	A	6	6	2839057	2839062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_017473	TGT	2	6	2839122	2839127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_017473	TGC	2	6	2839170	2839175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_017473	TAAC	2	8	2839190	2839197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8606	NC_017473	CTT	2	6	2839340	2839345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_017473	A	6	6	2839350	2839355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_017473	TTG	2	6	2839442	2839447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_017473	GAC	2	6	2839464	2839469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8611	NC_017473	TCC	2	6	2841847	2841852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8612	NC_017473	CTT	2	6	2842787	2842792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_017473	TCA	2	6	2842805	2842810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_017473	T	6	6	2843943	2843948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_017473	ATA	2	6	2843970	2843975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_017473	ATT	2	6	2843982	2843987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_017473	TTAA	2	8	2844044	2844051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_017473	AT	3	6	2844061	2844066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_017473	GTTT	2	8	2844101	2844108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_017473	ACGA	2	8	2844924	2844931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8621	NC_017473	CTATT	2	10	2844971	2844980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8622	NC_017473	A	6	6	2845076	2845081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_017473	TTA	2	6	2845118	2845123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_017473	CAAA	2	8	2845132	2845139	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8625	NC_017473	GCGA	2	8	2847616	2847623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8626	NC_017473	T	6	6	2847624	2847629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_017473	GC	3	6	2848631	2848636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_017473	CCT	2	6	2849610	2849615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8629	NC_017473	TA	3	6	2853493	2853498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_017473	TGTT	2	8	2853615	2853622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_017473	ACG	2	6	2853629	2853634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8633	NC_017473	TGTA	2	8	2853648	2853655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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