MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017473	CCA	2	6	2600524	2600529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_017473	CCTA	2	8	2600568	2600575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_017473	TC	3	6	2600688	2600693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_017473	GCC	2	6	2600785	2600790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_017473	CAT	2	6	2600876	2600881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_017473	GTT	2	6	2600919	2600924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017473	CTT	2	6	2600964	2600969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_017473	TCGC	2	8	2601012	2601019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8009	NC_017473	CTC	2	6	2601035	2601040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_017473	CTA	2	6	2601122	2601127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_017473	TGC	2	6	2601190	2601195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_017473	CCT	2	6	2601231	2601236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_017473	GGA	2	6	2601339	2601344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017473	TAT	2	6	2601518	2601523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017473	TGG	2	6	2601589	2601594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017473	TCC	2	6	2602256	2602261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_017473	CCG	2	6	2602288	2602293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_017473	AAGC	2	8	2602424	2602431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_017473	TCGC	2	8	2602456	2602463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_017473	CTA	2	6	2602466	2602471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_017473	TTTC	2	8	2602484	2602491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_017473	GCC	2	6	2602532	2602537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_017473	CTTA	2	8	2602615	2602622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8024	NC_017473	ATGCG	2	10	2602734	2602743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8025	NC_017473	TCG	2	6	2602845	2602850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_017473	GGA	2	6	2602872	2602877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017473	CCT	2	6	2602898	2602903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_017473	GTT	2	6	2602950	2602955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017473	GT	3	6	2603096	2603101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017473	AGG	2	6	2603140	2603145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017473	GCTC	2	8	2603218	2603225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_017473	GT	3	6	2603284	2603289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017473	CCAT	2	8	2603437	2603444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_017473	GT	3	6	2603453	2603458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017473	ATG	2	6	2603478	2603483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017473	TCC	2	6	2603504	2603509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_017473	CACGA	2	10	2603603	2603612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8039	NC_017473	CAC	2	6	2603629	2603634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_017473	TC	3	6	2603666	2603671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_017473	TTC	2	6	2603704	2603709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017473	CAGAC	2	10	2603937	2603946	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8043	NC_017473	GCC	2	6	2603948	2603953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_017473	TTC	2	6	2603967	2603972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_017473	AT	3	6	2603974	2603979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8047	NC_017473	CTT	2	6	2604267	2604272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017473	CTG	2	6	2604326	2604331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8051	NC_017473	TCCA	2	8	2604451	2604458	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_017473	ATC	2	6	2604624	2604629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_017473	CGC	2	6	2604664	2604669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_017473	TGT	2	6	2604734	2604739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017473	CTT	2	6	2604767	2604772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017473	GAC	2	6	2604836	2604841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_017473	AT	3	6	2604862	2604867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017473	AAT	2	6	2605017	2605022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017473	TGG	2	6	2605060	2605065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8061	NC_017473	GCC	2	6	2605094	2605099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_017473	TCC	2	6	2606628	2606633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8064	NC_017473	CAA	2	6	2606718	2606723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017473	GT	3	6	2606736	2606741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017473	CTTG	2	8	2607777	2607784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8070	NC_017473	TTTC	2	8	2608843	2608850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_017473	A	6	6	2608854	2608859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_017473	ATTG	2	8	2608885	2608892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8075	NC_017473	ATT	2	6	2614679	2614684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_017473	CAA	2	6	2614742	2614747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8083	NC_017473	ATT	2	6	2614919	2614924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017473	GATC	2	8	2614935	2614942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_017473	T	7	7	2614948	2614954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_017473	AAG	2	6	2615073	2615078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017473	TA	3	6	2617281	2617286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017473	ACA	2	6	2617298	2617303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_017473	TCC	2	6	2619737	2619742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_017473	AGCC	2	8	2619796	2619803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_017473	AGCCT	2	10	2620052	2620061	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8099	NC_017473	TTAC	2	8	2620513	2620520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_017473	AATA	2	8	2620570	2620577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8102	NC_017473	TGAT	2	8	2622475	2622482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017473	TCA	2	6	2622493	2622498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8114	NC_017473	TGCA	2	8	2627335	2627342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8122	NC_017473	TAA	2	6	2633072	2633077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017473	GGA	2	6	2633095	2633100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017473	TTAA	2	8	2633110	2633117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017473	A	6	6	2633130	2633135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017473	TG	3	6	2633212	2633217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017473	GAA	2	6	2633328	2633333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017473	CCA	2	6	2633336	2633341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_017473	TCT	2	6	2633375	2633380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_017473	TGA	2	6	2633415	2633420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_017473	CGC	2	6	2633626	2633631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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