MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017473	TGC	2	6	1398296	1398301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_017473	TTG	2	6	1398329	1398334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017473	CAA	2	6	1398351	1398356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017473	ATC	2	6	1398379	1398384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_017473	ACC	3	9	1398475	1398483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_017473	CTG	2	6	1398620	1398625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017473	GGC	2	6	1398661	1398666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_017473	CGA	2	6	1398684	1398689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017473	ACA	2	6	1398831	1398836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_017473	TTA	2	6	1398864	1398869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017473	GGT	2	6	1398924	1398929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017473	TGA	2	6	1399005	1399010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017473	GTGG	2	8	1399045	1399052	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017473	TGA	3	9	1399065	1399073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017473	TTG	2	6	1399082	1399087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_017473	T	6	6	1399091	1399096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017473	CAA	2	6	1399183	1399188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017473	TTG	2	6	1399199	1399204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017473	TGC	2	6	1399207	1399212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_017473	AAT	2	6	1399256	1399261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017473	AATG	2	8	1399285	1399292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017473	TGG	2	6	1399360	1399365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017473	T	6	6	1399398	1399403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017473	CAG	2	6	1399471	1399476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_017473	GATT	2	8	1399486	1399493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017473	TGT	2	6	1399704	1399709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017473	T	6	6	1399715	1399720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017473	TTC	2	6	1399739	1399744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_017473	TGA	2	6	1399812	1399817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017473	GTT	2	6	1399903	1399908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017473	TTG	2	6	1399914	1399919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017473	TTC	2	6	1399940	1399945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_017473	TGTT	2	8	1399965	1399972	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017473	TGA	2	6	1399977	1399982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017473	ATA	2	6	1400025	1400030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017473	GTC	2	6	1400111	1400116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_017473	CCA	2	6	1400130	1400135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_017473	TTC	2	6	1400146	1400151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_017473	CTG	2	6	1400163	1400168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_017473	A	6	6	1400171	1400176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017473	A	7	7	1400332	1400338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017473	T	6	6	1400349	1400354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017473	T	7	7	1400374	1400380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017473	ATT	2	6	1402368	1402373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017473	TTA	2	6	1402374	1402379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017473	GTT	2	6	1402424	1402429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017473	TGA	2	6	1402504	1402509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017473	T	6	6	1402513	1402518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017473	ATG	2	6	1402523	1402528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017473	AGG	2	6	1402574	1402579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017473	TA	3	6	1403136	1403141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017473	T	6	6	1403165	1403170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017473	ATG	2	6	1403181	1403186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017473	AGG	2	6	1403226	1403231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017473	AGCGCA	2	12	1403536	1403547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_017473	GAA	2	6	1403551	1403556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017473	TTATA	2	10	1403568	1403577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017473	GAA	2	6	1403578	1403583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017473	CAC	2	6	1405553	1405558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_017473	TAA	2	6	1405560	1405565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017473	CAC	2	6	1405657	1405662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_017473	AGC	2	6	1406104	1406109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_017473	T	6	6	1406110	1406115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017473	CTTT	2	8	1406117	1406124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_017473	GATTA	2	10	1406126	1406135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017473	GAAGA	2	10	1406235	1406244	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017473	ATTT	2	8	1408553	1408560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017473	TTG	2	6	1408612	1408617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017473	ATC	2	6	1408627	1408632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_017473	ATG	2	6	1408664	1408669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017473	AGC	2	6	1408687	1408692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_017473	AAAG	2	8	1410176	1410183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017473	T	6	6	1410201	1410206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017473	GCG	2	6	1410212	1410217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_017473	CAA	2	6	1411390	1411395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_017473	AGA	2	6	1415799	1415804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_017473	TTTG	2	8	1415861	1415868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017473	CCAT	2	8	1415914	1415921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_017473	T	6	6	1415997	1416002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_017473	ATC	2	6	1416019	1416024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_017473	CAA	2	6	1416056	1416061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_017473	GCC	3	9	1416114	1416122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_017473	TGG	3	9	1416137	1416145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017473	A	6	6	1416165	1416170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017473	TCA	2	6	1416217	1416222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_017473	ACA	2	6	1416231	1416236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_017473	AGC	2	6	1416302	1416307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_017473	AAC	2	6	1416311	1416316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_017473	ATT	2	6	1416341	1416346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017473	CGC	2	6	1416364	1416369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_017473	GCAT	2	8	1416438	1416445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_017473	ATACCG	2	12	1416459	1416470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_017473	CCGG	2	8	1416492	1416499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_017473	CGA	2	6	1416728	1416733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_017473	ACC	2	6	1416734	1416739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_017473	GCC	2	6	1416744	1416749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_017473	ATA	2	6	1416759	1416764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017473	TAA	2	6	1416765	1416770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017473	A	6	6	1416769	1416774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017473	TCA	2	6	1416781	1416786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017473	TCC	2	6	1416791	1416796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_017473	GAC	2	6	1416851	1416856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017473	TCA	2	6	1416864	1416869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017473	T	6	6	1416878	1416883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017473	A	6	6	1416981	1416986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017473	AAAG	2	8	1418997	1419004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017473	CAA	2	6	1419011	1419016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017473	A	8	8	1419028	1419035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017473	TCG	2	6	1419102	1419107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_017473	TCG	2	6	1419141	1419146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_017473	CGAT	2	8	1419183	1419190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_017473	TTG	2	6	1419191	1419196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017473	ACA	2	6	1419202	1419207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017473	CTC	2	6	1419292	1419297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_017473	GTT	2	6	1419333	1419338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017473	CT	3	6	1419431	1419436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_017473	GAT	2	6	1419451	1419456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017473	TAT	2	6	1419478	1419483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017473	GTT	2	6	1419530	1419535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017473	TAA	2	6	1419543	1419548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017473	GTT	2	6	1419609	1419614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017473	GGC	2	6	1419661	1419666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_017473	TAA	2	6	1419668	1419673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017473	TCA	2	6	1419692	1419697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_017473	A	7	7	1420388	1420394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017473	CTT	2	6	1420408	1420413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_017473	TCT	2	6	1421006	1421011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_017473	TGC	2	6	1421072	1421077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_017473	AAGA	2	8	1421114	1421121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_017473	T	6	6	1421229	1421234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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