MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 10166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	AAT	2	6	80	85	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017467	TA	3	6	135	140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017467	CAA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017467	CTA	4	12	1663	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017467	AT	3	6	1680	1685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017467	AGG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017467	A	6	6	2872	2877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017467	T	7	7	2897	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017467	T	6	6	2945	2950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017467	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017467	TA	3	6	3049	3054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017467	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017467	GGC	2	6	4516	4521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017467	A	6	6	8891	8896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017467	A	6	6	8899	8904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017467	A	7	7	8916	8922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017467	T	6	6	8932	8937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017467	TAA	2	6	8941	8946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017467	A	8	8	8959	8966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017467	T	6	6	8999	9004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017467	AGG	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017467	AGGAA	2	10	9426	9435	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017467	AAAG	2	8	9974	9981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017467	ATT	2	6	10265	10270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017467	T	6	6	10279	10284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	TGA	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	T	6	6	10339	10344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017467	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017467	GGA	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017467	TAA	2	6	10376	10381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017467	A	6	6	10380	10385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017467	CTA	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017467	TAAA	2	8	10407	10414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017467	GT	3	6	10416	10421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017467	TAA	2	6	10437	10442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017467	A	7	7	10472	10478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017467	GCCT	2	8	10554	10561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017467	GCCA	2	8	10636	10643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017467	AGC	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017467	GCAA	2	8	10723	10730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017467	CAT	2	6	10800	10805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017467	GCT	2	6	10856	10861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017467	TCA	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017467	AAG	2	6	11002	11007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017467	ACG	2	6	11068	11073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017467	ATCG	2	8	11134	11141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017467	GCT	2	6	11232	11237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017467	CAAGCA	2	12	11310	11321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017467	AAAC	2	8	11398	11405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017467	GCT	2	6	11471	11476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017467	GCG	2	6	11514	11519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017467	CGAA	2	8	11573	11580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017467	AAAGAA	2	12	11646	11657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017467	CT	3	6	11697	11702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017467	A	6	6	11727	11732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017467	TAA	2	6	11754	11759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017467	CTT	2	6	11833	11838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017467	TAT	2	6	11920	11925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017467	GAT	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017467	ATGA	2	8	12010	12017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017467	AATT	2	8	12025	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017467	A	7	7	12083	12089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017467	AGAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017467	A	6	6	13304	13309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017467	A	6	6	13338	13343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017467	AGG	2	6	13639	13644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017467	T	8	8	13645	13652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017467	T	6	6	13706	13711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017467	TGA	2	6	13723	13728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017467	T	6	6	15796	15801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017467	ATA	2	6	15834	15839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017467	A	6	6	15845	15850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017467	AT	3	6	15862	15867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017467	T	6	6	15867	15872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017467	T	6	6	15875	15880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017467	TCA	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017467	TA	3	6	15921	15926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017467	TCA	2	6	16348	16353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017467	ATA	2	6	16380	16385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017467	T	6	6	16392	16397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017467	AAT	2	6	16488	16493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017467	CTT	2	6	16516	16521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017467	TCT	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017467	TAC	2	6	16835	16840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017467	TTTA	2	8	16871	16878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017467	TAAC	2	8	16891	16898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017467	ACT	2	6	16909	16914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017467	ATT	2	6	17003	17008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017467	TTG	2	6	17074	17079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017467	ATT	3	9	17130	17138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017467	AGC	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017467	ATC	2	6	17250	17255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017467	TCA	2	6	17268	17273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017467	TAA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017467	T	6	6	17280	17285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017467	TAG	2	6	17308	17313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017467	AAATT	2	10	17316	17325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017467	TCT	2	6	17394	17399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017467	TTC	2	6	17481	17486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017467	TGT	2	6	17532	17537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017467	TCA	2	6	17538	17543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017467	ATC	2	6	17549	17554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017467	T	8	8	17561	17568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017467	ACT	2	6	17649	17654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017467	TAA	2	6	17681	17686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017467	TTTG	2	8	17736	17743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017467	TAAATC	2	12	17759	17770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017467	TCA	2	6	17787	17792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017467	TGA	2	6	17847	17852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017467	AT	3	6	17869	17874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017467	TAC	2	6	17880	17885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017467	A	6	6	17899	17904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017467	ACA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017467	A	6	6	17957	17962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017467	TA	3	6	18095	18100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017467	ATA	2	6	18191	18196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017467	TCC	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017467	AT	3	6	18851	18856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017467	TCAT	2	8	18920	18927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017467	TAA	2	6	18934	18939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017467	AT	3	6	18956	18961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017467	AGGA	2	8	18975	18982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017467	TTTTAT	2	12	22933	22944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017467	T	6	6	23051	23056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017467	T	6	6	23074	23079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017467	TTA	2	6	23087	23092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017467	TCAT	2	8	23103	23110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017467	GGA	2	6	23120	23125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017467	CATTG	2	10	24069	24078	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017467	AT	3	6	24121	24126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017467	A	6	6	24151	24156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017467	T	7	7	25154	25160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017467	A	7	7	26081	26087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017467	AAGA	2	8	26118	26125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017467	T	6	6	26139	26144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017467	AAGG	2	8	26252	26259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017467	ATC	2	6	26303	26308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017467	AAC	2	6	26321	26326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017467	CCT	2	6	26363	26368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017467	TGA	2	6	26635	26640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017467	AAAC	2	8	26757	26764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017467	CAT	2	6	26767	26772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017467	TGG	2	6	26778	26783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017467	AATT	2	8	26812	26819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017467	AGC	2	6	26821	26826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017467	AAG	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017467	CTC	2	6	26854	26859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017467	T	6	6	27333	27338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017467	AAT	2	6	27350	27355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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