MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017465	GTG	2	6	400665	400670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017465	GCGG	2	8	400840	400847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_017465	GAA	2	6	400991	400996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017465	GAA	2	6	401063	401068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017465	TTC	2	6	401073	401078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017465	CTT	2	6	401101	401106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017465	T	6	6	401223	401228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017465	A	7	7	401299	401305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017465	AAAGG	2	10	401344	401353	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017465	CGG	2	6	401398	401403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017465	CGA	3	9	401472	401480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017465	G	7	7	401622	401628	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017465	TTC	2	6	401633	401638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017465	GGGAA	2	10	401669	401678	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017465	GAA	2	6	401776	401781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017465	GTT	2	6	401807	401812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017465	GCC	2	6	401857	401862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_017465	CAT	2	6	401874	401879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_017465	ACA	2	6	401921	401926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_017465	AGG	2	6	401939	401944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017465	CGA	2	6	401979	401984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_017465	TTGA	2	8	401998	402005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017465	CGGGAA	2	12	402038	402049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3524	NC_017465	CGG	2	6	404562	404567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017465	AGG	2	6	405643	405648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017465	ACA	2	6	405653	405658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_017465	GCT	2	6	405825	405830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3529	NC_017465	GCC	2	6	405967	405972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017465	GGTC	2	8	406047	406054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_017465	GGGGTG	2	12	406102	406113	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017465	GCG	2	6	406240	406245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017465	TCC	2	6	406252	406257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_017465	ATC	2	6	406287	406292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_017465	CAT	2	6	406481	406486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017465	CGG	2	6	406495	406500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017465	GTG	2	6	406705	406710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017465	AGGG	2	8	406732	406739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017465	ACT	2	6	406775	406780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_017465	ATT	2	6	406804	406809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017465	TAT	2	6	406846	406851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017465	CAT	2	6	406911	406916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_017465	ATC	2	6	407107	407112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017465	CAA	2	6	407113	407118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017465	TGG	2	6	407127	407132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3548	NC_017465	TCT	2	6	407240	407245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_017465	TGG	2	6	407279	407284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017465	GGGTAA	2	12	409204	409215	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017465	ACTG	2	8	409225	409232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_017465	ACA	2	6	410239	410244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_017465	TTGG	2	8	410274	410281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017465	TGA	2	6	410311	410316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017465	GCC	2	6	410379	410384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_017465	TGA	2	6	410564	410569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017465	CGC	2	6	410570	410575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_017465	TGG	2	6	410585	410590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017465	ACG	2	6	412676	412681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3561	NC_017465	CGG	2	6	413682	413687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017465	G	6	6	413744	413749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017465	AAC	2	6	413756	413761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017465	ACG	2	6	413829	413834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017465	GAA	3	9	414199	414207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017465	CAA	2	6	414289	414294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_017465	ACG	2	6	416125	416130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_017465	AGGTGT	2	12	417101	417112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017465	TGGGT	2	10	417134	417143	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017465	CCCGT	2	10	417178	417187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3573	NC_017465	CGA	2	6	417236	417241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3575	NC_017465	TTA	2	6	419283	419288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017465	CCGGG	2	10	419291	419300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3579	NC_017465	TCT	2	6	419406	419411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_017465	TGCT	2	8	419472	419479	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_017465	TACC	2	8	419494	419501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_017465	AAC	2	6	419544	419549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3587	NC_017465	GGT	2	6	419960	419965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017465	ATG	2	6	419990	419995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017465	GAA	3	9	420047	420055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017465	GAA	2	6	420089	420094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_017465	TG	3	6	420192	420197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017465	AGA	2	6	421966	421971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_017465	CAT	2	6	422024	422029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_017465	A	6	6	422063	422068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017465	TGG	2	6	422144	422149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017465	TCA	2	6	422157	422162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017465	GTG	2	6	422177	422182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017465	GCTA	2	8	422186	422193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_017465	GCA	2	6	422227	422232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_017465	GAA	2	6	422240	422245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017465	CAA	2	6	422266	422271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017465	ACTTA	2	10	422314	422323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3606	NC_017465	GTG	2	6	422335	422340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017465	CAA	2	6	422371	422376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017465	GAT	2	6	422389	422394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017465	ACCA	2	8	422436	422443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_017465	GACCGG	2	12	422524	422535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_017465	TC	3	6	422590	422595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_017465	CAA	2	6	422599	422604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017465	GAA	2	6	422635	422640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017465	TAA	2	6	422650	422655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3617	NC_017465	TGGGT	2	10	422842	422851	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017465	CGT	2	6	422875	422880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_017465	GGTC	2	8	422890	422897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_017465	AGTT	2	8	422928	422935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017465	TCCGGG	2	12	422982	422993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_017465	GTG	2	6	422999	423004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017465	GGA	2	6	423025	423030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017465	TTC	2	6	423050	423055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_017465	TCC	2	6	424531	424536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_017465	GC	3	6	424600	424605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_017465	A	6	6	424679	424684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017465	CTT	2	6	424737	424742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_017465	CCT	2	6	424746	424751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_017465	CGC	2	6	424769	424774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_017465	CCCA	2	8	424780	424787	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3632	NC_017465	GCCA	2	8	424801	424808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3634	NC_017465	ACG	2	6	424970	424975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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