MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017465	CCTA	2	8	332003	332010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_017465	AG	3	6	332013	332018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017465	CCGGGC	2	12	332091	332102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_017465	A	6	6	332109	332114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017465	A	6	6	332198	332203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017465	GAG	2	6	332267	332272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017465	GGA	2	6	332343	332348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017465	GTG	2	6	332401	332406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017465	ACC	2	6	332437	332442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_017465	TCT	2	6	332474	332479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_017465	TGGC	2	8	332490	332497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_017465	TCT	2	6	332505	332510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_017465	TGT	2	6	332513	332518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017465	CTAG	2	8	332526	332533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_017465	T	7	7	332596	332602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017465	GA	3	6	332628	332633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017465	AAAC	2	8	332642	332649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_017465	TACT	2	8	332673	332680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_017465	CAAT	2	8	332725	332732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_017465	GTG	2	6	332758	332763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017465	GAA	2	6	332770	332775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017465	GAA	2	6	332815	332820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017465	TGA	2	6	332855	332860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017465	TCCT	2	8	332948	332955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_017465	GAA	2	6	332956	332961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017465	GGATC	2	10	332964	332973	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_017465	ATC	2	6	333040	333045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_017465	TTGAAA	2	12	333113	333124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017465	GAC	3	9	333138	333146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017465	CAT	2	6	333265	333270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_017465	AGG	2	6	333288	333293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017465	AAAG	2	8	333308	333315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017465	CGC	2	6	333517	333522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_017465	CTG	2	6	333523	333528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017465	AAG	2	6	333540	333545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017465	CGC	2	6	333653	333658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_017465	AGC	2	6	333668	333673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017465	CAG	2	6	333733	333738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017465	AGG	2	6	333806	333811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017465	AAG	2	6	333840	333845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017465	AAG	2	6	333861	333866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017465	AAG	2	6	333876	333881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017465	AAGC	2	8	333981	333988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_017465	CAA	2	6	333993	333998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017465	GGC	2	6	334079	334084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017465	AAG	2	6	334087	334092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017465	TGGC	2	8	334142	334149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_017465	ATG	2	6	334182	334187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017465	TTAC	2	8	334306	334313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_017465	GTTG	2	8	334376	334383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017465	GTT	3	9	334407	334415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017465	GAC	2	6	334502	334507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_017465	A	6	6	334529	334534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017465	T	7	7	334557	334563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017465	ATTG	2	8	334647	334654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017465	T	7	7	334682	334688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017465	ATAA	2	8	334729	334736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017465	C	6	6	334785	334790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3059	NC_017465	GAAC	2	8	334808	334815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_017465	TTG	2	6	334852	334857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017465	A	6	6	334878	334883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017465	AGA	2	6	334946	334951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017465	CAT	2	6	334953	334958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_017465	GAT	2	6	334974	334979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017465	CCA	2	6	334991	334996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_017465	TAGG	2	8	335019	335026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017465	CAT	2	6	335115	335120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_017465	TCCC	2	8	335150	335157	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3069	NC_017465	GGC	2	6	335169	335174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_017465	GCA	2	6	335237	335242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_017465	CGG	2	6	335276	335281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017465	GTA	2	6	335306	335311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3076	NC_017465	TGCT	2	8	336782	336789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_017465	CGA	2	6	336852	336857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017465	GCC	2	6	336862	336867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_017465	CGTTA	2	10	336878	336887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3080	NC_017465	GGA	2	6	336926	336931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017465	ATC	2	6	336960	336965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3083	NC_017465	CTG	3	9	337039	337047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3085	NC_017465	GCT	3	9	337083	337091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017465	ACTT	2	8	337112	337119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_017465	TAAGGT	2	12	337133	337144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_017465	TTG	2	6	337198	337203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_017465	CAT	2	6	337310	337315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_017465	TGA	2	6	337417	337422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017465	GTA	2	6	337447	337452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017465	GTT	2	6	337460	337465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017465	TAGC	2	8	337469	337476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_017465	TAAT	2	8	337611	337618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017465	TAT	2	6	337626	337631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017465	GAA	2	6	337680	337685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017465	ATT	3	9	337689	337697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017465	GGA	2	6	337735	337740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017465	GAC	2	6	337786	337791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017465	TTC	2	6	337805	337810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017465	GTT	2	6	337838	337843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017465	GGT	2	6	337942	337947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017465	CTT	2	6	338053	338058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017465	AAG	2	6	338108	338113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017465	CTT	2	6	338125	338130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_017465	GAC	2	6	338152	338157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017465	GGCCG	2	10	338228	338237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3111	NC_017465	GCT	2	6	338257	338262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017465	ATT	3	9	338275	338283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_017465	GAT	2	6	338431	338436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017465	TCT	2	6	338442	338447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_017465	GAA	2	6	344394	344399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017465	ACA	2	6	344446	344451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017465	CCAAC	2	10	344515	344524	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3121	NC_017465	ACG	2	6	344529	344534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017465	CAT	2	6	344546	344551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017465	ATC	2	6	344574	344579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017465	CCAC	2	8	344588	344595	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3125	NC_017465	CGC	2	6	344618	344623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_017465	GCC	2	6	344640	344645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_017465	CGC	2	6	344648	344653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_017465	CAA	2	6	344720	344725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017465	GCT	2	6	344775	344780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017465	AGCC	2	8	344794	344801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_017465	A	6	6	344839	344844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017465	TGGG	2	8	347644	347651	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3134	NC_017465	TAC	2	6	347689	347694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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