MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017465	GTC	2	6	1474451	1474456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_017465	GTA	2	6	1474465	1474470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_017465	AAAT	2	8	1474471	1474478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_017465	GTG	3	9	1474585	1474593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_017465	GTT	2	6	1474626	1474631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_017465	CAG	2	6	1474633	1474638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_017465	TGCT	2	8	1474713	1474720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_017465	GTAA	2	8	1474782	1474789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_017465	GCCG	2	8	1474848	1474855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13010	NC_017465	GTC	2	6	1474912	1474917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_017465	CAA	2	6	1474923	1474928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_017465	CTC	2	6	1474929	1474934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_017465	C	6	6	1474975	1474980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13014	NC_017465	GCG	2	6	1474982	1474987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_017465	CTT	2	6	1475945	1475950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_017465	GAA	2	6	1476001	1476006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017465	CCT	2	6	1476048	1476053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_017465	CAC	2	6	1476069	1476074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_017465	AGCCA	2	10	1476114	1476123	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13020	NC_017465	TCG	2	6	1476182	1476187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_017465	GTG	3	9	1476193	1476201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_017465	TGA	3	9	1476224	1476232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_017465	CCA	2	6	1476248	1476253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_017465	GAA	2	6	1476331	1476336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_017465	GGC	2	6	1476339	1476344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_017465	ATG	2	6	1476358	1476363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_017465	ACA	2	6	1476377	1476382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_017465	GCT	2	6	1476407	1476412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_017465	T	6	6	1476493	1476498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_017465	CAT	2	6	1476534	1476539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_017465	TCG	2	6	1476545	1476550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_017465	CCTA	2	8	1476551	1476558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_017465	GGCT	2	8	1476565	1476572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13034	NC_017465	A	7	7	1476599	1476605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_017465	TGA	3	9	1476623	1476631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_017465	TGGT	2	8	1476724	1476731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_017465	GCAA	2	8	1476755	1476762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_017465	GAA	2	6	1476769	1476774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_017465	GAA	3	9	1476777	1476785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017465	CCA	2	6	1476787	1476792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_017465	ACC	2	6	1476814	1476819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_017465	CCA	2	6	1476848	1476853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_017465	GCAA	2	8	1476887	1476894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_017465	CAC	3	9	1476895	1476903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_017465	AAC	2	6	1476908	1476913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_017465	GTAA	2	8	1476915	1476922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017465	TTAC	2	8	1476965	1476972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13048	NC_017465	CAA	2	6	1477048	1477053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_017465	TCC	2	6	1477055	1477060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_017465	CCCG	2	8	1477066	1477073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13051	NC_017465	CCA	2	6	1477131	1477136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_017465	GGC	2	6	1477155	1477160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_017465	CAT	2	6	1477185	1477190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_017465	A	6	6	1477243	1477248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_017465	ACCAA	2	10	1477259	1477268	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13056	NC_017465	ACC	2	6	1477303	1477308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_017465	CAA	2	6	1477354	1477359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_017465	GCC	2	6	1477381	1477386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_017465	CCT	2	6	1477440	1477445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_017465	ACC	2	6	1477448	1477453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_017465	CTT	2	6	1477461	1477466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_017465	CA	3	6	1477516	1477521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_017465	CAT	2	6	1477608	1477613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_017465	ATC	2	6	1477678	1477683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_017465	GCC	2	6	1477705	1477710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_017465	TGG	2	6	1477791	1477796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017465	GGC	2	6	1477797	1477802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_017465	CTA	2	6	1477803	1477808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_017465	CACC	2	8	1477824	1477831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13070	NC_017465	CTA	2	6	1477936	1477941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_017465	CGC	2	6	1477950	1477955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_017465	GGC	2	6	1477998	1478003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_017465	ACG	2	6	1478048	1478053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_017465	GAT	2	6	1478070	1478075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_017465	ACC	2	6	1478092	1478097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_017465	TCG	2	6	1478108	1478113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_017465	GGC	2	6	1478154	1478159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_017465	CCG	2	6	1478210	1478215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13079	NC_017465	GCC	2	6	1478224	1478229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13080	NC_017465	CCG	2	6	1478275	1478280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_017465	TTG	2	6	1478352	1478357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_017465	CTGG	2	8	1478361	1478368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_017465	GGC	2	6	1478381	1478386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_017465	CGATTG	2	12	1478419	1478430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13085	NC_017465	ACC	2	6	1478482	1478487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13086	NC_017465	CCG	2	6	1478494	1478499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_017465	GAT	2	6	1479418	1479423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13089	NC_017465	ATC	2	6	1479512	1479517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_017465	GTG	2	6	1479560	1479565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_017465	GCCC	2	8	1479592	1479599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13092	NC_017465	GCT	2	6	1479656	1479661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_017465	TTC	2	6	1479670	1479675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_017465	AGC	2	6	1479710	1479715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_017465	ATG	2	6	1479731	1479736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_017465	TTGG	2	8	1479887	1479894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017465	AAG	2	6	1479959	1479964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017465	CAC	2	6	1479988	1479993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_017465	GTT	2	6	1480057	1480062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017465	TGG	2	6	1480088	1480093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_017465	GTT	2	6	1481435	1481440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017465	CAA	2	6	1481443	1481448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_017465	CTTG	2	8	1481449	1481456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_017465	GTA	2	6	1481462	1481467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13108	NC_017465	GGC	2	6	1483248	1483253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_017465	CCA	3	9	1483322	1483330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_017465	GGT	2	6	1483364	1483369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_017465	CAA	3	9	1483400	1483408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_017465	C	7	7	1483433	1483439	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13113	NC_017465	ACC	2	6	1483456	1483461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_017465	CGT	2	6	1483463	1483468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_017465	GGC	2	6	1483486	1483491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_017465	AGCC	2	8	1483522	1483529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_017465	TGAA	2	8	1483615	1483622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017465	TCG	2	6	1483660	1483665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_017465	GGCC	2	8	1483799	1483806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_017465	CCA	2	6	1483919	1483924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13121	NC_017465	C	6	6	1484047	1484052	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13122	NC_017465	GTC	2	6	1484124	1484129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_017465	CCA	2	6	1484197	1484202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_017465	TTC	2	6	1484249	1484254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_017465	CTTC	2	8	1484308	1484315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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