MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015978	ATTA	2	8	204827	204834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015978	GAT	2	6	204891	204896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015978	A	7	7	204923	204929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015978	A	6	6	204979	204984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015978	AATT	2	8	205043	205050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015978	ATT	2	6	205097	205102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015978	CAA	2	6	205116	205121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015978	AT	3	6	205133	205138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015978	TTG	2	6	205150	205155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015978	GAT	2	6	205236	205241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015978	AAT	2	6	205242	205247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015978	CCT	2	6	205327	205332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015978	GTG	2	6	205393	205398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015978	AGTA	2	8	207057	207064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015978	AGT	2	6	207123	207128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015978	ATG	2	6	207154	207159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015978	AAT	2	6	207162	207167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015978	A	6	6	207179	207184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015978	CTT	2	6	207190	207195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015978	GAA	2	6	207207	207212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015978	TAAT	2	8	207235	207242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015978	CAAA	2	8	207273	207280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_015978	ATAA	2	8	207309	207316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015978	TTA	2	6	207360	207365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015978	TTA	2	6	207376	207381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015978	ATT	2	6	207392	207397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015978	CAAAA	2	10	207469	207478	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_015978	GTTT	2	8	211104	211111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015978	TA	3	6	211120	211125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015978	ATT	2	6	211133	211138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015978	TTA	2	6	211166	211171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015978	TAA	2	6	211175	211180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015978	TAC	2	6	211181	211186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015978	TTCG	2	8	212865	212872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_015978	TAC	2	6	212877	212882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015978	GTTTTT	2	12	212887	212898	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015978	T	7	7	212894	212900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015978	AAAAT	2	10	213924	213933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015978	A	7	7	213937	213943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015978	GTA	2	6	213949	213954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015978	T	7	7	214037	214043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015978	T	6	6	214070	214075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015978	AC	3	6	214085	214090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_015978	T	6	6	214117	214122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015978	T	7	7	214139	214145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015978	ATT	2	6	214305	214310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015978	TA	3	6	214313	214318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015978	TTCA	2	8	214320	214327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_015978	ATT	2	6	214378	214383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015978	AAAT	2	8	214453	214460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015978	TAA	2	6	214474	214479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015978	TAA	2	6	214513	214518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015978	ATT	2	6	215124	215129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015978	ATTCA	2	10	215217	215226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_015978	TGG	2	6	215227	215232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015978	GCT	2	6	215252	215257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015978	GTT	2	6	215285	215290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015978	CGATAA	2	12	215335	215346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1059	NC_015978	TGG	2	6	215392	215397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015978	TTCC	2	8	215694	215701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015978	GA	3	6	215706	215711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015978	CT	3	6	215730	215735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015978	TTA	2	6	215770	215775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015978	CTG	2	6	215784	215789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015978	TAA	2	6	215792	215797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015978	AATT	2	8	215804	215811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015978	TAAA	2	8	218334	218341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015978	ATT	2	6	218362	218367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015978	GAA	2	6	218381	218386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015978	TAT	3	9	218387	218395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015978	AAG	2	6	218451	218456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015978	CAT	2	6	218499	218504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015978	TTTTG	2	10	218527	218536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015978	ACAA	2	8	218553	218560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_015978	TGAT	2	8	218583	218590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015978	AACT	2	8	218761	218768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_015978	GCC	2	6	218802	218807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015978	TGC	2	6	218812	218817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015978	TA	3	6	218895	218900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015978	TTGTC	2	10	218926	218935	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_015978	AT	6	12	218946	218957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015978	GCA	2	6	218971	218976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015978	T	7	7	218982	218988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015978	AGT	2	6	219014	219019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015978	TAT	2	6	219061	219066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015978	TTC	2	6	219540	219545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015978	ATA	3	9	219561	219569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015978	AAT	2	6	219590	219595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015978	AG	3	6	219628	219633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015978	CTT	2	6	219677	219682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015978	TTC	2	6	219713	219718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015978	CAAAT	2	10	219769	219778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_015978	TAT	2	6	219813	219818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015978	TAG	2	6	219853	219858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015978	TTTAAG	2	12	219903	219914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015978	T	6	6	219984	219989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015978	CAT	2	6	220010	220015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015978	AATTTA	2	12	220042	220053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015978	ATA	2	6	220069	220074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015978	T	7	7	220136	220142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015978	GAT	2	6	220856	220861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015978	TAA	2	6	220955	220960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015978	A	6	6	220966	220971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015978	ATG	2	6	221026	221031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015978	TGA	2	6	221036	221041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015978	TGGC	2	8	221059	221066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_015978	T	6	6	221131	221136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015978	CAT	2	6	221138	221143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015978	GC	3	6	221253	221258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015978	GAA	2	6	221370	221375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015978	GGC	2	6	221447	221452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015978	ATTC	2	8	221456	221463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_015978	TTTA	2	8	223590	223597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015978	GAG	2	6	223635	223640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015978	GAT	2	6	224208	224213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015978	T	6	6	224578	224583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015978	T	9	9	225148	225156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015978	AAT	2	6	226795	226800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015978	GAT	2	6	226825	226830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015978	ATT	2	6	226853	226858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015978	T	7	7	227779	227785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015978	TGT	2	6	228646	228651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015978	ATCA	2	8	228703	228710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_015978	TGA	2	6	228717	228722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015978	TTA	2	6	228723	228728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015978	GTT	2	6	231147	231152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015978	T	7	7	231184	231190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015978	GAT	2	6	232105	232110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015978	TAA	2	6	232120	232125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015978	A	7	7	232690	232696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015978	T	6	6	232710	232715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015978	AAC	2	6	232749	232754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015978	GAA	2	6	232762	232767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015978	TG	3	6	232828	232833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015978	ATT	2	6	232883	232888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015978	TAATT	2	10	232900	232909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015978	TAA	2	6	234115	234120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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