MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 9608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015975	A	7	7	1205816	1205822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015975	TTC	2	6	1205833	1205838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015975	CCT	2	6	1206311	1206316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_015975	GTT	2	6	1206511	1206516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_015975	TCCC	2	8	1206517	1206524	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5506	NC_015975	AAC	2	6	1206630	1206635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015975	ATTT	2	8	1206660	1206667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_015975	TGA	2	6	1206668	1206673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_015975	AAAG	2	8	1206705	1206712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_015975	GA	3	6	1206726	1206731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015975	CTT	2	6	1207636	1207641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_015975	AGG	2	6	1207658	1207663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015975	GAAC	2	8	1207713	1207720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_015975	ACA	2	6	1207743	1207748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_015975	CAT	2	6	1207802	1207807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_015975	TAA	2	6	1207829	1207834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015975	TA	3	6	1207883	1207888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015975	A	6	6	1207940	1207945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015975	AAGA	2	8	1207987	1207994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015975	GA	3	6	1207993	1207998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_015975	AG	3	6	1209466	1209471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015975	CAAT	2	8	1209517	1209524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_015975	T	6	6	1209541	1209546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_015975	CGAC	2	8	1209677	1209684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_015975	TTCG	2	8	1209685	1209692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_015975	T	7	7	1209724	1209730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015975	T	6	6	1209740	1209745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015975	AAAAT	2	10	1209778	1209787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015975	GAT	2	6	1209789	1209794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_015975	AC	3	6	1209862	1209867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_015975	A	7	7	1210811	1210817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_015975	CTT	2	6	1210828	1210833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_015975	ATTC	2	8	1210839	1210846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_015975	TTA	2	6	1211681	1211686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015975	TAT	2	6	1211768	1211773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_015975	GCT	2	6	1211803	1211808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_015975	GCT	2	6	1211816	1211821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_015975	CTG	2	6	1211856	1211861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_015975	A	6	6	1211873	1211878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015975	CAC	2	6	1217816	1217821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_015975	CCTCA	2	10	1218271	1218280	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5542	NC_015975	AAC	2	6	1220501	1220506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015975	A	6	6	1220534	1220539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015975	AAC	2	6	1220545	1220550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_015975	GTC	2	6	1220554	1220559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015975	CTT	2	6	1220583	1220588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015975	CT	3	6	1220932	1220937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_015975	AATT	2	8	1220945	1220952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015975	CTA	2	6	1220963	1220968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_015975	T	6	6	1221070	1221075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015975	CAG	2	6	1221079	1221084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_015975	CTT	2	6	1221090	1221095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015975	TCC	2	6	1221106	1221111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_015975	TCT	2	6	1221138	1221143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015975	TTC	2	6	1221208	1221213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_015975	TCG	2	6	1221288	1221293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015975	GCC	2	6	1221311	1221316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_015975	T	6	6	1221327	1221332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015975	T	6	6	1221346	1221351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015975	GC	3	6	1221373	1221378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_015975	A	6	6	1221397	1221402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_015975	ATCG	2	8	1221559	1221566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_015975	TCC	2	6	1222627	1222632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_015975	ATAG	2	8	1223148	1223155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015975	AAT	2	6	1223204	1223209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_015975	AAT	2	6	1223219	1223224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015975	ATT	2	6	1223237	1223242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015975	AGA	2	6	1223255	1223260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015975	T	6	6	1223263	1223268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015975	AGC	2	6	1223319	1223324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5572	NC_015975	ATC	2	6	1223376	1223381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5575	NC_015975	ATTAT	2	10	1223538	1223547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_015975	GTC	2	6	1223571	1223576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5579	NC_015975	TC	3	6	1227037	1227042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_015975	TCC	2	6	1228349	1228354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_015975	CAAGA	2	10	1228403	1228412	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5582	NC_015975	ACAA	2	8	1228422	1228429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_015975	CGT	2	6	1228435	1228440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5587	NC_015975	CTT	2	6	1228549	1228554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_015975	TTCT	2	8	1228787	1228794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_015975	TCA	2	6	1228905	1228910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5591	NC_015975	AAG	2	6	1229004	1229009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_015975	CGT	2	6	1229325	1229330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_015975	CTT	2	6	1229483	1229488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_015975	ACG	2	6	1229520	1229525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015975	CGG	2	6	1229526	1229531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015975	CTT	2	6	1229600	1229605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015975	TTG	2	6	1229632	1229637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_015975	T	6	6	1229676	1229681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015975	AAC	2	6	1229706	1229711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5611	NC_015975	TTG	2	6	1229776	1229781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5613	NC_015975	TGT	2	6	1229846	1229851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015975	TCG	3	9	1229882	1229890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5620	NC_015975	AATG	2	8	1230076	1230083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_015975	CGTCA	2	10	1230117	1230126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5622	NC_015975	GTT	2	6	1230132	1230137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_015975	CGC	2	6	1230560	1230565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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