MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 9608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	CTT	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015975	T	7	7	38	44	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015975	TAA	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015975	CAA	2	6	76	81	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015975	TTG	2	6	126	131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015975	TCT	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015975	A	7	7	198	204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015975	A	6	6	206	211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015975	AAT	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015975	CCTG	2	8	322	329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015975	T	7	7	338	344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015975	AAAT	2	8	355	362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015975	AGG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015975	T	6	6	1811	1816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015975	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015975	CTA	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015975	TAC	3	9	1897	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015975	TTATT	2	10	1907	1916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015975	TA	3	6	1918	1923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015975	CAGA	2	8	1935	1942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015975	TAAAA	2	10	3250	3259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015975	A	6	6	3256	3261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015975	A	7	7	3300	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015975	TTGAA	2	10	9353	9362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015975	A	6	6	9380	9385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015975	A	7	7	9387	9393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015975	TAT	2	6	9411	9416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015975	AGT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015975	TAA	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015975	AGG	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015975	AGG	2	6	9882	9887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015975	AGG	2	6	10447	10452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015975	TAAA	2	8	10714	10721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015975	ATA	2	6	10722	10727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015975	TAT	2	6	10744	10749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015975	TAT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015975	GAAA	2	8	10811	10818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015975	A	7	7	10823	10829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015975	TACT	2	8	10830	10837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015975	T	6	6	10851	10856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015975	TGA	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015975	ATCA	3	12	10900	10911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015975	AT	4	8	10958	10965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015975	T	6	6	10983	10988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015975	GAAAAA	2	12	11045	11056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015975	CAA	2	6	11067	11072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015975	TG	3	6	11122	11127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015975	T	7	7	11162	11168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015975	CTT	2	6	11227	11232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015975	A	6	6	11250	11255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015975	AAT	2	6	11267	11272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015975	TAA	2	6	11281	11286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015975	A	8	8	11292	11299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015975	TGA	2	6	11346	11351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015975	GTAA	2	8	11378	11385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015975	T	6	6	11461	11466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015975	GTT	2	6	11467	11472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015975	A	6	6	11500	11505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015975	A	6	6	11617	11622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015975	CGAC	2	8	11664	11671	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015975	CATT	2	8	11680	11687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015975	ATT	2	6	11717	11722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015975	TGAT	2	8	12873	12880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015975	AT	3	6	12879	12884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015975	AT	3	6	12892	12897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015975	ATT	2	6	12909	12914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015975	TAA	2	6	12966	12971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015975	GGA	2	6	12988	12993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015975	A	6	6	13788	13793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015975	A	6	6	13845	13850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015975	ATC	2	6	13878	13883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015975	T	6	6	13887	13892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015975	T	6	6	13907	13912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015975	T	7	7	13925	13931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015975	GGA	2	6	16031	16036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015975	A	6	6	17928	17933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015975	GAT	2	6	17967	17972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015975	ATC	2	6	17990	17995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015975	AAT	2	6	18016	18021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015975	TTTCC	2	10	18035	18044	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015975	TGA	2	6	18095	18100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015975	TGC	2	6	18110	18115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015975	GCA	2	6	18116	18121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015975	A	6	6	18133	18138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015975	AAGA	2	8	18147	18154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015975	T	6	6	18801	18806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015975	TCTT	2	8	18811	18818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015975	T	7	7	18858	18864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015975	TTGA	2	8	19093	19100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015975	TGA	2	6	20675	20680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015975	T	6	6	20693	20698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015975	AAG	2	6	20742	20747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015975	T	6	6	20751	20756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015975	GAC	2	6	20782	20787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015975	CAG	2	6	21258	21263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015975	AGC	2	6	21291	21296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015975	GAA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015975	CAGCA	2	10	21312	21321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015975	GATC	2	8	21510	21517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015975	T	7	7	21536	21542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015975	T	6	6	21735	21740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015975	A	6	6	21781	21786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015975	A	6	6	23327	23332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015975	TGC	2	6	23375	23380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015975	A	7	7	23460	23466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015975	T	6	6	23506	23511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015975	CAAA	2	8	25372	25379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015975	TCA	2	6	25437	25442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015975	GTT	2	6	25459	25464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015975	AAT	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015975	ATT	2	6	25517	25522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015975	AGCG	2	8	28132	28139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015975	GAC	2	6	28165	28170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015975	AGCG	2	8	28255	28262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015975	GAC	2	6	28288	28293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015975	AGCG	2	8	28378	28385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015975	GAC	2	6	28411	28416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015975	ATG	2	6	28551	28556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015975	T	6	6	28564	28569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015975	GGC	2	6	28579	28584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015975	TGC	2	6	28855	28860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015975	ATT	2	6	28908	28913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015975	C	6	6	28937	28942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_015975	TCA	2	6	28943	28948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015975	T	7	7	28963	28969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015975	AGT	2	6	28980	28985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015975	TTG	2	6	28988	28993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015975	AG	3	6	29065	29070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015975	A	6	6	29925	29930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015975	A	6	6	30863	30868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015975	GTT	2	6	30897	30902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015975	T	7	7	30901	30907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015975	A	6	6	30924	30929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015975	ATT	2	6	31073	31078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015975	ACGA	2	8	31085	31092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015975	ATA	2	6	31482	31487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015975	TGC	2	6	31546	31551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015975	ATT	2	6	31609	31614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015975	TTC	3	9	31647	31655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015975	A	6	6	32985	32990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015975	TC	3	6	32998	33003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015975	T	7	7	33026	33032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015975	A	6	6	33054	33059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015975	ATT	2	6	33102	33107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015975	AGAA	2	8	33169	33176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015975	A	6	6	33501	33506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015975	TGC	2	6	33507	33512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015975	GCA	2	6	33665	33670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015975	T	8	8	35011	35018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015975	TAA	2	6	35133	35138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015975	A	6	6	35319	35324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015975	T	6	6	35432	35437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015975	GAA	2	6	39151	39156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015975	TTG	2	6	39166	39171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_015975	A	6	6	60955	60960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015975	T	6	6	60961	60966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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