MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014724	T	6	6	444191	444196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014724	TGCT	2	8	449645	449652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_014724	TAT	2	6	449673	449678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014724	ATT	2	6	449705	449710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014724	A	6	6	449714	449719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014724	TAT	2	6	449742	449747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014724	AT	3	6	449746	449751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014724	TAA	2	6	449752	449757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014724	GA	3	6	449767	449772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014724	AAG	2	6	449790	449795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014724	A	6	6	449824	449829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014724	GAA	2	6	449846	449851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014724	GTC	2	6	449871	449876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_014724	A	6	6	449921	449926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014724	CGGA	2	8	449981	449988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_014724	GTA	2	6	449990	449995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014724	CAAA	2	8	450045	450052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_014724	GCAA	2	8	450068	450075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_014724	AAT	2	6	450098	450103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014724	GGC	2	6	450166	450171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014724	CGAG	2	8	450191	450198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_014724	AGCG	2	8	450237	450244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_014724	ATA	2	6	450320	450325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014724	GGC	2	6	450354	450359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014724	GGTAA	2	10	450404	450413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014724	CGA	2	6	450427	450432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_014724	GA	3	6	450447	450452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014724	GCA	2	6	450501	450506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014724	CGC	2	6	450548	450553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_014724	GTGA	2	8	450554	450561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014724	TGT	2	6	450587	450592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014724	GAA	2	6	450597	450602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014724	GTA	2	6	450611	450616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014724	CAG	2	6	450669	450674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_014724	AGCG	2	8	450724	450731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_014724	AGA	2	6	450810	450815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014724	AT	3	6	450854	450859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014724	GAA	2	6	450861	450866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014724	GGC	2	6	450880	450885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_014724	TGC	2	6	451005	451010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014724	GAA	2	6	451124	451129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014724	GGT	2	6	451198	451203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014724	GTC	2	6	451212	451217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_014724	TCGTG	2	10	451221	451230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_014724	TTA	2	6	451269	451274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014724	GGA	2	6	451324	451329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014724	TCA	2	6	451349	451354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014724	AC	3	6	451375	451380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_014724	AAGC	2	8	451406	451413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_014724	CGC	2	6	451514	451519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_014724	AC	3	6	451544	451549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_014724	GGCAG	2	10	451620	451629	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1553	NC_014724	CCT	2	6	451685	451690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_014724	GTA	2	6	451785	451790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014724	A	7	7	451797	451803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014724	AGG	2	6	451993	451998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014724	AAG	2	6	452036	452041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014724	A	6	6	452081	452086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014724	GAGAA	2	10	452123	452132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014724	ATT	2	6	452286	452291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014724	ATG	2	6	452294	452299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014724	ATAG	2	8	452301	452308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014724	AGAA	2	8	452360	452367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014724	TAG	2	6	452381	452386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014724	GCGA	2	8	452389	452396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_014724	GTGA	2	8	452459	452466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014724	AG	3	6	452494	452499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014724	GC	3	6	452528	452533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_014724	GT	3	6	452694	452699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014724	AGT	2	6	452705	452710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014724	CGGAGC	2	12	452795	452806	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_014724	AGTT	2	8	452832	452839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014724	TC	3	6	452988	452993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_014724	AT	3	6	453100	453105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014724	AGC	2	6	453246	453251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_014724	CAT	2	6	453252	453257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_014724	AAGGC	2	10	453525	453534	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1581	NC_014724	AGC	2	6	453647	453652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014724	TGA	2	6	453698	453703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014724	AG	3	6	453763	453768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014724	GA	3	6	453826	453831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014724	GAA	2	6	453873	453878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_014724	CGG	2	6	454056	454061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_014724	GA	3	6	454154	454159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014724	TAGG	2	8	454272	454279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014724	AGG	2	6	454309	454314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014724	TAC	2	6	454326	454331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_014724	GCCAG	2	10	454367	454376	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_014724	CCT	2	6	454414	454419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_014724	GA	4	8	454505	454512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_014724	CGT	2	6	454745	454750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_014724	CGT	2	6	454771	454776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014724	GAG	2	6	454794	454799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014724	GTT	2	6	454848	454853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014724	C	6	6	454921	454926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1603	NC_014724	GAA	2	6	455007	455012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014724	AGCGA	2	10	455052	455061	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_014724	T	6	6	455072	455077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014724	GTA	2	6	455104	455109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014724	AAG	2	6	455136	455141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014724	CTT	2	6	455178	455183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_014724	AGT	2	6	455193	455198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014724	TGG	2	6	455199	455204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014724	CTGC	2	8	455209	455216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_014724	AGGAA	2	10	455218	455227	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014724	GGA	2	6	455242	455247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_014724	AGG	2	6	455282	455287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014724	TCC	2	6	455308	455313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_014724	CAC	2	6	455474	455479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_014724	AGT	2	6	455597	455602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014724	TGG	2	6	455628	455633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014724	TCA	2	6	455665	455670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_014724	TGA	2	6	455762	455767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014724	C	7	7	456013	456019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1623	NC_014724	ATTA	2	8	456112	456119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014724	TAA	2	6	456129	456134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014724	TCG	2	6	456163	456168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_014724	GGA	2	6	456255	456260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014724	CGG	2	6	456343	456348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_014724	T	6	6	456373	456378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014724	TC	3	6	456617	456622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_014724	ATT	2	6	456635	456640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014724	T	6	6	456660	456665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014724	TAG	2	6	456681	456686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014724	T	6	6	456721	456726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014724	ATT	2	6	456742	456747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_014724	ATT	2	6	457284	457289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_014724	TTC	2	6	509511	509516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1913	NC_014724	AT	3	6	509530	509535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_014724	ATCA	2	8	510688	510695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1933	NC_014724	T	6	6	510782	510787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_014724	TTA	2	6	510793	510798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_014724	CTTTTT	2	12	510868	510879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1944	NC_014724	CAG	2	6	515374	515379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1945	NC_014724	TTAAG	2	10	515391	515400	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_014724	ATT	2	6	515432	515437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_014724	TAT	2	6	515500	515505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1953	NC_014724	A	6	6	515763	515768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_014724	CAT	2	6	515792	515797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1956	NC_014724	CAGT	2	8	516111	516118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1958	NC_014724	TAC	2	6	516232	516237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_014724	TGT	2	6	516377	516382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1962	NC_014724	TCG	2	6	517070	517075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1964	NC_014724	A	7	7	517120	517126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_014724	CTT	2	6	517373	517378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1967	NC_014724	TAT	2	6	517389	517394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1968	NC_014724	AT	3	6	517758	517763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_014724	GAA	2	6	517767	517772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1970	NC_014724	AGA	2	6	518715	518720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_014724	ATA	2	6	519677	519682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1973	NC_014724	A	6	6	521050	521055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1974	NC_014724	T	6	6	521144	521149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_014724	A	6	6	521163	521168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_014724	TGC	2	6	521349	521354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1978	NC_014724	TA	3	6	521436	521441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1984	NC_014724	AAGCA	2	10	521774	521783	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1986	NC_014724	AGA	2	6	522100	522105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_014724	T	7	7	522652	522658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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