MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014554	TAT	2	6	907370	907375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014554	CAT	2	6	907415	907420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014554	AGT	2	6	907423	907428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014554	AGG	2	6	907531	907536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014554	ACTAA	2	10	907857	907866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3506	NC_014554	AATT	2	8	907871	907878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014554	ATA	2	6	908532	908537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_014554	AGG	2	6	909465	909470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014554	GAG	2	6	910347	910352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014554	AGG	2	6	910642	910647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014554	AGG	2	6	912299	912304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014554	ATT	2	6	912584	912589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014554	GGA	2	6	912612	912617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014554	CA	3	6	912996	913001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_014554	AGG	2	6	913011	913016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014554	GACT	2	8	913340	913347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_014554	AGG	2	6	913351	913356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014554	AAAC	2	8	914117	914124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_014554	AGG	2	6	914134	914139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014554	ATTA	2	8	914548	914555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014554	AT	3	6	915136	915141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014554	AGG	2	6	915515	915520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014554	AAT	2	6	915521	915526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014554	ACAA	2	8	916038	916045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_014554	AGG	2	6	916245	916250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014554	CTA	2	6	916254	916259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_014554	AGG	2	6	918031	918036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_014554	A	6	6	918037	918042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014554	CAG	2	6	918716	918721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_014554	ATT	2	6	918755	918760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014554	T	7	7	918788	918794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014554	ATA	2	6	918858	918863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_014554	AGG	2	6	918864	918869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014554	AGG	2	6	919117	919122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014554	A	6	6	919124	919129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014554	TCG	2	6	919183	919188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014554	TGA	2	6	919200	919205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014554	TCTGC	2	10	919209	919218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_014554	TAATT	2	10	919250	919259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014554	AGG	2	6	919652	919657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014554	ACT	2	6	920104	920109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014554	GGA	2	6	921097	921102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014554	TGA	2	6	921524	921529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014554	ATG	2	6	921542	921547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014554	TAG	2	6	921564	921569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014554	TTAT	2	8	921588	921595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014554	T	8	8	921632	921639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014554	GATT	2	8	921671	921678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014554	T	6	6	921693	921698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014554	TGA	2	6	921729	921734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014554	ACTG	2	8	921800	921807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_014554	A	6	6	921849	921854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014554	GATT	2	8	921886	921893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014554	A	6	6	923987	923992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014554	AAC	2	6	924009	924014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_014554	TAAT	2	8	924038	924045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014554	AAC	2	6	925972	925977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_014554	AAT	2	6	925985	925990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014554	TAA	2	6	926012	926017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014554	TAT	2	6	926139	926144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014554	T	7	7	926160	926166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014554	AATGG	2	10	926167	926176	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014554	ATT	2	6	927184	927189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014554	GTA	2	6	927358	927363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014554	TAC	2	6	928648	928653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_014554	ATA	2	6	928676	928681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014554	CAAA	2	8	932139	932146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_014554	GGA	2	6	932157	932162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014554	GTT	2	6	933034	933039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014554	T	7	7	933091	933097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014554	GTT	2	6	933098	933103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014554	A	6	6	933111	933116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014554	CTGG	2	8	933177	933184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_014554	TACT	2	8	934205	934212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_014554	GGC	2	6	934234	934239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_014554	GTTG	2	8	934299	934306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_014554	GTA	2	6	934414	934419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3585	NC_014554	GAAA	2	8	935656	935663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_014554	AGCT	2	8	937082	937089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3594	NC_014554	TAAGT	2	10	937266	937275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014554	TATT	2	8	937374	937381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3599	NC_014554	TCA	2	6	937504	937509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3602	NC_014554	TG	3	6	937705	937710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014554	GAA	2	6	937753	937758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014554	T	6	6	937792	937797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014554	AGTT	2	8	939846	939853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3607	NC_014554	TAT	2	6	940789	940794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014554	ATT	2	6	940796	940801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014554	GCAT	2	8	943121	943128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3611	NC_014554	ACC	2	6	944739	944744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_014554	CTG	2	6	944779	944784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3615	NC_014554	GTAA	2	8	946799	946806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014554	TG	3	6	946808	946813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014554	A	7	7	946903	946909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014554	CGT	2	6	946936	946941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3621	NC_014554	AGA	2	6	948097	948102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014554	CAG	2	6	948111	948116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014554	ATG	2	6	948166	948171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014554	GTTG	2	8	948197	948204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_014554	A	6	6	949352	949357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_014554	ATT	2	6	949375	949380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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