MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014554	GGAC	2	8	290774	290781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_014554	TAA	2	6	290854	290859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014554	A	6	6	290858	290863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014554	GTT	2	6	290893	290898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014554	ATT	2	6	291393	291398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014554	TACG	2	8	291527	291534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_014554	TGA	2	6	292631	292636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014554	TAA	2	6	292638	292643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014554	TA	4	8	292903	292910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014554	T	6	6	292946	292951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014554	CTA	2	6	292973	292978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_014554	GACT	2	8	295423	295430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_014554	TAT	2	6	295466	295471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014554	TGAT	2	8	295474	295481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014554	TCC	2	6	296863	296868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_014554	TAT	2	6	296905	296910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014554	ATT	2	6	296976	296981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014554	TA	3	6	296994	296999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014554	TAAA	2	8	297004	297011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014554	AATT	2	8	297059	297066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014554	TA	3	6	297113	297118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014554	TAA	2	6	297181	297186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014554	AATG	2	8	297228	297235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014554	TTAA	2	8	297256	297263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014554	AGG	2	6	297267	297272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014554	CTC	2	6	298172	298177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_014554	T	6	6	298187	298192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014554	T	6	6	298200	298205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014554	ACA	2	6	298261	298266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014554	TCA	2	6	299614	299619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014554	T	6	6	299641	299646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014554	GACT	2	8	299658	299665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_014554	ACC	2	6	299667	299672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_014554	TAT	2	6	299710	299715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014554	AAT	2	6	299761	299766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014554	TGAA	2	8	299799	299806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014554	A	6	6	299809	299814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014554	A	6	6	301301	301306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014554	TTGT	2	8	301344	301351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014554	TTG	2	6	302051	302056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014554	TGA	2	6	302092	302097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014554	TAA	2	6	302116	302121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014554	GAC	2	6	302168	302173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014554	TGA	2	6	302191	302196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014554	AAT	2	6	302240	302245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014554	GAT	2	6	302252	302257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014554	ATA	2	6	302265	302270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014554	ATA	2	6	302501	302506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014554	TTG	2	6	302573	302578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014554	TGC	2	6	302608	302613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014554	A	7	7	302704	302710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014554	TGA	2	6	302781	302786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014554	G	6	6	302805	302810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014554	TCA	2	6	302826	302831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014554	GTT	2	6	302842	302847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014554	GGA	2	6	302873	302878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014554	ATT	2	6	302898	302903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014554	TAG	2	6	302905	302910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014554	AAC	2	6	302952	302957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014554	GAA	2	6	302965	302970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014554	GAT	2	6	302979	302984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014554	ATT	2	6	303000	303005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014554	GATTA	2	10	303006	303015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014554	TGG	2	6	303092	303097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014554	TAA	2	6	303123	303128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014554	TTA	2	6	304611	304616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014554	ATC	2	6	304890	304895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014554	T	6	6	304923	304928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014554	TGATAT	2	12	304949	304960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014554	TGT	2	6	304969	304974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014554	AGG	2	6	305604	305609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014554	A	6	6	306956	306961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014554	ATG	2	6	308252	308257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014554	TAA	2	6	308335	308340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014554	TCA	2	6	309605	309610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014554	ATT	2	6	309646	309651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014554	GT	3	6	309667	309672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014554	GTAA	2	8	309682	309689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014554	CTCAT	2	10	309717	309726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_014554	TG	3	6	309811	309816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014554	CAACA	2	10	309817	309826	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1082	NC_014554	CTTT	2	8	309968	309975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_014554	ATA	2	6	310015	310020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014554	TAA	2	6	310031	310036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014554	A	6	6	310035	310040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014554	ACAT	2	8	310148	310155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_014554	CGG	2	6	312090	312095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_014554	ATTAA	2	10	312111	312120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014554	TAC	2	6	312276	312281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014554	T	6	6	312353	312358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014554	ATT	2	6	312401	312406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014554	TGG	2	6	312426	312431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014554	GAT	2	6	312767	312772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014554	GTC	2	6	312773	312778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014554	T	7	7	312792	312798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014554	A	6	6	312892	312897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014554	AT	3	6	312916	312921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014554	AT	4	8	312929	312936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014554	A	6	6	314965	314970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014554	GAT	2	6	314990	314995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014554	A	7	7	315096	315102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014554	TCG	2	6	315132	315137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014554	TCT	2	6	315167	315172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_014554	ATT	2	6	316646	316651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014554	T	7	7	316665	316671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014554	AAT	2	6	316870	316875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014554	G	6	6	316884	316889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014554	ATTA	2	8	316896	316903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014554	GTGC	2	8	316936	316943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_014554	ATG	2	6	316958	316963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014554	ACTA	2	8	317000	317007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_014554	CAC	2	6	317023	317028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_014554	ATT	2	6	317049	317054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014554	TAA	2	6	317066	317071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014554	GTT	2	6	318061	318066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014554	TGG	2	6	318141	318146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014554	GCA	2	6	318426	318431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014554	GAT	2	6	318514	318519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014554	A	6	6	318539	318544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014554	TCA	2	6	318554	318559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014554	ATTG	2	8	318582	318589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014554	AAT	2	6	319258	319263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014554	GTT	2	6	319277	319282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014554	AGTT	2	8	319346	319353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014554	ATG	2	6	319373	319378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014554	ATG	3	9	319389	319397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014554	TCA	2	6	320083	320088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014554	GAC	2	6	320091	320096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_014554	T	6	6	320145	320150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014554	AAT	2	6	320153	320158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014554	CCA	2	6	320187	320192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_014554	T	6	6	320193	320198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014554	TGA	2	6	321764	321769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014554	AAGT	2	8	321928	321935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014554	A	6	6	321988	321993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014554	TAA	2	6	322410	322415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014554	A	6	6	322414	322419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_014554	TAGC	2	8	367295	367302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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