MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014554	TAA	2	6	2905407	2905412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_014554	CACC	2	8	2905444	2905451	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11003	NC_014554	CA	3	6	2905463	2905468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_014554	A	7	7	2905504	2905510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_014554	ATC	2	6	2906848	2906853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_014554	CTT	2	6	2906856	2906861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_014554	A	6	6	2906894	2906899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_014554	CAT	2	6	2906900	2906905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_014554	GT	3	6	2906973	2906978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_014554	GCT	3	9	2907077	2907085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_014554	TTG	3	9	2907117	2907125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_014554	CCA	2	6	2910833	2910838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_014554	GTCA	2	8	2911429	2911436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11014	NC_014554	GAC	3	9	2911479	2911487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_014554	TTTC	2	8	2911490	2911497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_014554	A	6	6	2912517	2912522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_014554	GCC	2	6	2912525	2912530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_014554	GGC	2	6	2912549	2912554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_014554	ACCG	2	8	2912577	2912584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11020	NC_014554	AGTC	2	8	2912659	2912666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_014554	CTC	2	6	2914099	2914104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_014554	ACT	2	6	2914126	2914131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_014554	ATG	2	6	2914157	2914162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_014554	CAA	2	6	2914185	2914190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_014554	A	6	6	2914189	2914194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_014554	AAC	2	6	2914236	2914241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_014554	ATC	2	6	2914318	2914323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_014554	GTT	2	6	2914389	2914394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_014554	AAC	2	6	2914412	2914417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_014554	ATA	2	6	2914739	2914744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_014554	ATT	2	6	2914772	2914777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_014554	AACC	2	8	2914952	2914959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_014554	TC	3	6	2915006	2915011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_014554	CAA	2	6	2915263	2915268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_014554	A	6	6	2915267	2915272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_014554	ACT	2	6	2915339	2915344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_014554	AAG	2	6	2915354	2915359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_014554	CAC	2	6	2915410	2915415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11039	NC_014554	ATTAGT	2	12	2915507	2915518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_014554	ATC	2	6	2915564	2915569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_014554	ATCTC	2	10	2915604	2915613	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11042	NC_014554	GT	3	6	2915617	2915622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_014554	GGC	2	6	2915684	2915689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_014554	ACG	2	6	2915792	2915797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_014554	ACC	2	6	2915987	2915992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_014554	CTGT	2	8	2916027	2916034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_014554	AGG	2	6	2916123	2916128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_014554	CAC	2	6	2916168	2916173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11049	NC_014554	GTG	2	6	2916179	2916184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_014554	GTA	2	6	2916211	2916216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_014554	CCA	2	6	2916219	2916224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_014554	CCTA	2	8	2916263	2916270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_014554	TC	3	6	2916383	2916388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_014554	GCC	2	6	2916480	2916485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_014554	TC	3	6	2916727	2916732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11056	NC_014554	CTA	2	6	2916817	2916822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_014554	CCT	2	6	2916925	2916930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_014554	GGA	2	6	2917033	2917038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_014554	GTA	2	6	2917211	2917216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_014554	TGG	2	6	2917283	2917288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_014554	GA	3	6	2917546	2917551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_014554	TCC	2	6	2917632	2917637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_014554	CTCCC	2	10	2917867	2917876	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11064	NC_014554	GTA	2	6	2917928	2917933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_014554	TCC	2	6	2917952	2917957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_014554	CCG	2	6	2917984	2917989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_014554	GA	3	6	2918008	2918013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_014554	TTTGG	2	10	2918129	2918138	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_014554	TCGC	2	8	2918151	2918158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_014554	CTG	2	6	2918192	2918197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_014554	CTG	2	6	2918275	2918280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_014554	TTAAC	2	10	2918398	2918407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11073	NC_014554	A	6	6	2918464	2918469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_014554	A	6	6	2918473	2918478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_014554	A	6	6	2918503	2918508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_014554	TC	3	6	2918557	2918562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_014554	GT	3	6	2918586	2918591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_014554	AGG	2	6	2918616	2918621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_014554	ATC	2	6	2918672	2918677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11080	NC_014554	GGC	2	6	2918690	2918695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_014554	GT	3	6	2918758	2918763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_014554	CCAT	2	8	2918911	2918918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_014554	GT	3	6	2918927	2918932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_014554	ATG	2	6	2918952	2918957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_014554	TCC	2	6	2918978	2918983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_014554	ATA	2	6	2919035	2919040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_014554	CACGA	2	10	2919077	2919086	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11088	NC_014554	GAC	2	6	2919090	2919095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_014554	CAC	2	6	2919103	2919108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_014554	TTC	2	6	2919178	2919183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_014554	GCA	2	6	2919297	2919302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_014554	CAGAC	2	10	2919411	2919420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11093	NC_014554	GCC	2	6	2919422	2919427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_014554	TTC	2	6	2919441	2919446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_014554	AT	3	6	2919448	2919453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_014554	CTT	2	6	2919526	2919531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_014554	A	6	6	2919563	2919568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_014554	GCT	2	6	2919632	2919637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_014554	TTC	2	6	2919705	2919710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_014554	AAC	2	6	2919714	2919719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_014554	CTT	2	6	2919741	2919746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_014554	CTG	2	6	2919800	2919805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_014554	CCA	2	6	2919899	2919904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_014554	CGC	2	6	2919916	2919921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_014554	GTT	2	6	2919980	2919985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_014554	CACT	2	8	2920063	2920070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11107	NC_014554	ATG	2	6	2920083	2920088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_014554	CAAT	2	8	2920096	2920103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11109	NC_014554	GTTC	2	8	2920110	2920117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11110	NC_014554	CGC	2	6	2920137	2920142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_014554	ATG	2	6	2920181	2920186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_014554	TGT	2	6	2920208	2920213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_014554	TCG	2	6	2920294	2920299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_014554	GT	3	6	2920332	2920337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_014554	ATC	2	6	2920358	2920363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_014554	CAA	2	6	2920388	2920393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_014554	T	7	7	2920395	2920401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_014554	AAG	2	6	2920402	2920407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_014554	ACA	2	6	2920441	2920446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_014554	GAA	2	6	2920468	2920473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_014554	CAA	2	6	2920479	2920484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_014554	AAT	2	6	2920493	2920498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_014554	TGG	2	6	2920503	2920508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_014554	AGC	2	6	2920526	2920531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_014554	TTA	2	6	2920591	2920596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_014554	CTTT	2	8	2920610	2920617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11127	NC_014554	TTAA	2	8	2920629	2920636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11129	NC_014554	GTTT	2	8	2921198	2921205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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