MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014554	AAT	2	6	2788931	2788936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_014554	TGT	2	6	2788945	2788950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_014554	T	6	6	2788953	2788958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_014554	GGA	2	6	2788978	2788983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_014554	ATC	2	6	2789175	2789180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_014554	CTA	2	6	2789207	2789212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014554	ACT	3	9	2789248	2789256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_014554	CAG	2	6	2789260	2789265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_014554	AGCA	2	8	2789301	2789308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10510	NC_014554	ACT	2	6	2789326	2789331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_014554	CAG	2	6	2789354	2789359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_014554	AT	3	6	2789402	2789407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_014554	AGC	2	6	2789408	2789413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_014554	TGA	2	6	2789447	2789452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_014554	A	6	6	2789621	2789626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_014554	GGT	2	6	2789662	2789667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_014554	CCAT	2	8	2789685	2789692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_014554	TACT	2	8	2789746	2789753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10519	NC_014554	TTAC	2	8	2789769	2789776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_014554	AT	3	6	2789800	2789805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_014554	GAG	2	6	2790058	2790063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_014554	ATCA	2	8	2790835	2790842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10523	NC_014554	CTC	2	6	2790864	2790869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_014554	CAA	2	6	2790903	2790908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_014554	ATT	2	6	2791780	2791785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_014554	T	6	6	2791798	2791803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10529	NC_014554	A	6	6	2794891	2794896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_014554	AT	3	6	2794956	2794961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_014554	ATT	2	6	2794969	2794974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_014554	T	6	6	2794973	2794978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_014554	TAA	2	6	2795002	2795007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_014554	TAG	2	6	2795034	2795039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_014554	TACTCA	2	12	2795116	2795127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_014554	TTA	2	6	2795817	2795822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_014554	T	6	6	2795911	2795916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_014554	TA	3	6	2795926	2795931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_014554	A	6	6	2795931	2795936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_014554	GCT	2	6	2795978	2795983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_014554	CGT	2	6	2796168	2796173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_014554	TGA	2	6	2796199	2796204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_014554	CGTT	2	8	2796285	2796292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10544	NC_014554	T	6	6	2796337	2796342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_014554	ACG	2	6	2796365	2796370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_014554	TTCG	2	8	2796426	2796433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10547	NC_014554	ATT	2	6	2796458	2796463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_014554	ATA	2	6	2796471	2796476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_014554	TGA	2	6	2796502	2796507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_014554	CTGA	2	8	2796510	2796517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_014554	GTA	2	6	2796538	2796543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_014554	ACT	2	6	2796544	2796549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_014554	CAT	2	6	2796824	2796829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_014554	ATG	2	6	2796875	2796880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_014554	C	6	6	2797104	2797109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10556	NC_014554	TA	3	6	2797145	2797150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_014554	ATC	2	6	2797169	2797174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_014554	AGA	2	6	2797201	2797206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_014554	A	6	6	2797212	2797217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_014554	ATTT	2	8	2797240	2797247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_014554	AAC	2	6	2797265	2797270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_014554	AAATTT	2	12	2797380	2797391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_014554	A	7	7	2797393	2797399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_014554	TCCTG	2	10	2797445	2797454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10565	NC_014554	AT	3	6	2797489	2797494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_014554	A	7	7	2797599	2797605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_014554	CTGG	2	8	2797623	2797630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_014554	T	6	6	2797786	2797791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_014554	ATT	2	6	2797866	2797871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10573	NC_014554	A	6	6	2798380	2798385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_014554	CTA	2	6	2800260	2800265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_014554	TAAA	2	8	2800383	2800390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10579	NC_014554	ACT	2	6	2801589	2801594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10582	NC_014554	A	7	7	2801739	2801745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_014554	A	7	7	2801842	2801848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10587	NC_014554	TTA	2	6	2803000	2803005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10591	NC_014554	T	7	7	2804350	2804356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_014554	TGAC	2	8	2804373	2804380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10593	NC_014554	AT	3	6	2805332	2805337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10595	NC_014554	ATT	2	6	2805427	2805432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_014554	GTC	2	6	2805498	2805503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10599	NC_014554	AAG	2	6	2807710	2807715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10601	NC_014554	T	6	6	2808728	2808733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_014554	ATT	2	6	2808940	2808945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_014554	TAA	2	6	2808950	2808955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_014554	TCA	2	6	2809873	2809878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_014554	TAA	2	6	2809879	2809884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_014554	A	6	6	2809883	2809888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_014554	CAA	2	6	2809908	2809913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_014554	TAC	2	6	2810240	2810245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_014554	CTGA	2	8	2810254	2810261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10610	NC_014554	CAA	2	6	2811092	2811097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_014554	AGCG	2	8	2811099	2811106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_014554	T	6	6	2811144	2811149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_014554	ACT	2	6	2811734	2811739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10617	NC_014554	ATT	2	6	2812084	2812089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10619	NC_014554	A	7	7	2812157	2812163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_014554	AT	3	6	2812215	2812220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_014554	TAGTTT	2	12	2813660	2813671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_014554	AAT	2	6	2813673	2813678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_014554	AAT	2	6	2815580	2815585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_014554	A	6	6	2815603	2815608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_014554	GATT	2	8	2815631	2815638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_014554	TAA	2	6	2816402	2816407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_014554	CAT	2	6	2816411	2816416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10628	NC_014554	ATC	2	6	2816427	2816432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10629	NC_014554	ATC	2	6	2816489	2816494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10630	NC_014554	CAT	2	6	2816496	2816501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10631	NC_014554	TGA	2	6	2816505	2816510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10632	NC_014554	CTTT	2	8	2817461	2817468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10633	NC_014554	TAA	2	6	2817510	2817515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10634	NC_014554	AAGA	2	8	2817556	2817563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10635	NC_014554	A	7	7	2817628	2817634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10636	NC_014554	GACT	2	8	2817692	2817699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10637	NC_014554	TTTTTA	2	12	2818888	2818899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10638	NC_014554	CA	4	8	2819017	2819024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10639	NC_014554	TTCA	2	8	2819028	2819035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10640	NC_014554	T	6	6	2821021	2821026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10641	NC_014554	AAC	2	6	2824535	2824540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10642	NC_014554	CAT	2	6	2824648	2824653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10644	NC_014554	TAA	2	6	2824759	2824764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10645	NC_014554	A	6	6	2824763	2824768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10646	NC_014554	AAT	2	6	2826115	2826120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10647	NC_014554	ACT	2	6	2826155	2826160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10648	NC_014554	AATT	2	8	2826390	2826397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10649	NC_014554	ATCT	2	8	2826411	2826418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10650	NC_014554	AAT	2	6	2826456	2826461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10651	NC_014554	CA	3	6	2826468	2826473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10652	NC_014554	ATCA	2	8	2826555	2826562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10653	NC_014554	TAA	2	6	2826573	2826578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10654	NC_014554	TAA	2	6	2826591	2826596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10655	NC_014554	ATA	2	6	2826646	2826651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10656	NC_014554	TGT	2	6	2826658	2826663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10657	NC_014554	GTTG	2	8	2826702	2826709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10658	NC_014554	ATT	2	6	2826716	2826721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10659	NC_014554	TAT	2	6	2826821	2826826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10661	NC_014554	GGAC	2	8	2826860	2826867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10662	NC_014554	A	6	6	2826928	2826933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10663	NC_014554	CA	3	6	2826950	2826955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10664	NC_014554	ATT	2	6	2826959	2826964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10665	NC_014554	GAC	2	6	2827004	2827009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10667	NC_014554	ACT	2	6	2827065	2827070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10668	NC_014554	T	6	6	2827130	2827135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10669	NC_014554	A	6	6	2829780	2829785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10670	NC_014554	AAT	2	6	2829833	2829838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10673	NC_014554	TAT	2	6	2829925	2829930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10674	NC_014554	TGACC	2	10	2829963	2829972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10681	NC_014554	CCTG	2	8	2831269	2831276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10682	NC_014554	TGA	2	6	2831348	2831353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10688	NC_014554	ATTT	2	8	2832545	2832552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10742	NC_014554	TCAT	2	8	2852720	2852727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10743	NC_014554	AGTAA	2	10	2852728	2852737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10744	NC_014554	ACTC	2	8	2857457	2857464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10755	NC_014554	GCC	2	6	2862081	2862086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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