MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014554	GCT	2	6	2682138	2682143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_014554	A	6	6	2682146	2682151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014554	ATT	2	6	2682161	2682166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014554	CAA	2	6	2682168	2682173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_014554	TAA	2	6	2682193	2682198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014554	ACC	2	6	2682210	2682215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_014554	TTA	2	6	2682231	2682236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014554	CAT	2	6	2682246	2682251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_014554	TCC	2	6	2682270	2682275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_014554	CAGC	2	8	2682347	2682354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_014554	CGG	2	6	2682356	2682361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_014554	CTT	2	6	2682379	2682384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_014554	TGT	2	6	2682668	2682673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_014554	TTA	2	6	2682714	2682719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_014554	C	6	6	2683662	2683667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10016	NC_014554	A	6	6	2683718	2683723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014554	TCAG	2	8	2683744	2683751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_014554	CGAA	2	8	2685327	2685334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_014554	T	6	6	2685373	2685378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_014554	ATT	2	6	2685397	2685402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014554	TGC	2	6	2685415	2685420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_014554	ACA	2	6	2685432	2685437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_014554	TAA	2	6	2685464	2685469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_014554	GAC	2	6	2685988	2685993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_014554	GTC	2	6	2686025	2686030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_014554	ACA	2	6	2686095	2686100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_014554	TAAT	2	8	2686149	2686156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_014554	ATT	2	6	2686182	2686187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_014554	TTA	2	6	2686245	2686250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_014554	AAT	2	6	2687461	2687466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_014554	ATT	2	6	2687500	2687505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_014554	CT	3	6	2687516	2687521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_014554	CAA	2	6	2687591	2687596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014554	AATT	2	8	2687646	2687653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_014554	CAGC	2	8	2687699	2687706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_014554	TAGT	2	8	2687749	2687756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_014554	GTG	2	6	2687801	2687806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014554	CCAAG	2	10	2687857	2687866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10039	NC_014554	CAC	2	6	2687888	2687893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_014554	TCAA	2	8	2688002	2688009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10041	NC_014554	GTA	2	6	2688059	2688064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_014554	AAC	2	6	2688134	2688139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_014554	TGCT	2	8	2688173	2688180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_014554	A	6	6	2688528	2688533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014554	TCA	2	6	2688580	2688585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014554	TTC	2	6	2689855	2689860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_014554	T	8	8	2689910	2689917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_014554	TTC	2	6	2689946	2689951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_014554	CAA	2	6	2689993	2689998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_014554	AC	3	6	2690039	2690044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_014554	CAC	2	6	2692031	2692036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_014554	TTG	2	6	2692220	2692225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014554	CTG	2	6	2692237	2692242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_014554	TGT	2	6	2692275	2692280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014554	TCC	2	6	2692299	2692304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_014554	T	6	6	2692792	2692797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_014554	CCCA	2	8	2692804	2692811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10058	NC_014554	CTA	2	6	2692816	2692821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_014554	TTA	2	6	2692880	2692885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_014554	ACG	2	6	2692928	2692933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_014554	TAA	2	6	2692961	2692966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014554	TATCA	2	10	2693072	2693081	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10063	NC_014554	AAT	2	6	2698127	2698132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014554	CTAA	2	8	2698196	2698203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_014554	CAATA	2	10	2698740	2698749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10066	NC_014554	AAC	2	6	2698753	2698758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_014554	TAC	2	6	2698785	2698790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_014554	ATTTG	2	10	2698874	2698883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014554	TG	3	6	2698900	2698905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014554	TGA	2	6	2698937	2698942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_014554	GCA	3	9	2698952	2698960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_014554	ACT	2	6	2698997	2699002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_014554	CAC	2	6	2699047	2699052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_014554	GGCA	2	8	2699170	2699177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_014554	CTT	2	6	2700241	2700246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_014554	TG	3	6	2700257	2700262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_014554	TGG	2	6	2700352	2700357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_014554	TAA	2	6	2700360	2700365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_014554	CAT	2	6	2700401	2700406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_014554	TTA	2	6	2700421	2700426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014554	TGAC	2	8	2700494	2700501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10082	NC_014554	AAT	2	6	2700525	2700530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014554	A	6	6	2700540	2700545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014554	TAA	2	6	2700555	2700560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014554	CGG	2	6	2700599	2700604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_014554	ATA	2	6	2700646	2700651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014554	GCA	2	6	2700659	2700664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_014554	TAA	2	6	2700726	2700731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_014554	CTA	2	6	2700785	2700790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_014554	ACA	2	6	2700848	2700853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_014554	GGT	2	6	2700870	2700875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_014554	CA	3	6	2700876	2700881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_014554	GAT	2	6	2700891	2700896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014554	ATG	2	6	2700982	2700987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_014554	ACA	2	6	2701031	2701036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_014554	CTG	2	6	2701076	2701081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_014554	ACC	2	6	2701090	2701095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_014554	TCA	2	6	2701096	2701101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_014554	TAA	2	6	2701197	2701202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014554	TTA	3	9	2701216	2701224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_014554	ATT	2	6	2701225	2701230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_014554	A	6	6	2701234	2701239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014554	GCA	2	6	2704973	2704978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_014554	CAA	2	6	2704983	2704988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_014554	TAC	2	6	2704995	2705000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_014554	TAA	3	9	2705005	2705013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_014554	TAA	2	6	2705026	2705031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_014554	TCA	2	6	2705096	2705101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_014554	GGT	2	6	2705111	2705116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_014554	CAA	2	6	2705123	2705128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_014554	GATT	2	8	2705200	2705207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_014554	AATT	2	8	2705208	2705215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_014554	TTGG	2	8	2705251	2705258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_014554	TAA	2	6	2705272	2705277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_014554	CAA	2	6	2705381	2705386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_014554	AATA	2	8	2705401	2705408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_014554	CAA	2	6	2705418	2705423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_014554	GTA	2	6	2705434	2705439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_014554	AATT	2	8	2705440	2705447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_014554	TGC	2	6	2705470	2705475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_014554	GGA	2	6	2705554	2705559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014554	ATA	2	6	2705632	2705637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014554	CG	3	6	2705655	2705660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_014554	TCC	2	6	2705677	2705682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_014554	TTG	2	6	2705723	2705728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_014554	ATTA	2	8	2705743	2705750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014554	CTT	2	6	2706754	2706759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10129	NC_014554	A	6	6	2708016	2708021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10139	NC_014554	ATAG	2	8	2713151	2713158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_014554	CTT	2	6	2731606	2731611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_014554	TG	3	6	2731622	2731627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_014554	A	6	6	2732448	2732453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_014554	TCC	2	6	2733162	2733167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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