MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014554	GTAA	2	8	2453352	2453359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_014554	TTCAC	2	10	2453386	2453395	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9003	NC_014554	CCGTCA	2	12	2453396	2453407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_014554	CCA	2	6	2453479	2453484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_014554	GTCC	2	8	2453706	2453713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9006	NC_014554	ATC	2	6	2453721	2453726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_014554	T	6	6	2453803	2453808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_014554	TCA	2	6	2453822	2453827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_014554	TGGC	2	8	2453930	2453937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9010	NC_014554	T	6	6	2453966	2453971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_014554	AGAT	2	8	2454033	2454040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_014554	AGC	2	6	2454156	2454161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_014554	AAAC	2	8	2454225	2454232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9014	NC_014554	CTT	2	6	2454239	2454244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_014554	AAT	2	6	2454276	2454281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_014554	CGA	2	6	2454331	2454336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_014554	ATTG	2	8	2454354	2454361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_014554	GCT	2	6	2454432	2454437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_014554	T	6	6	2454509	2454514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_014554	AAG	2	6	2454553	2454558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_014554	GTC	3	9	2454762	2454770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_014554	ATC	2	6	2454777	2454782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_014554	CCAT	2	8	2454793	2454800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9024	NC_014554	GCCA	2	8	2454831	2454838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9025	NC_014554	TGC	2	6	2454877	2454882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_014554	GAC	2	6	2454883	2454888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_014554	TCG	2	6	2454931	2454936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_014554	ATC	2	6	2454957	2454962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_014554	TCA	3	9	2455081	2455089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_014554	GATT	2	8	2455090	2455097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_014554	TCA	2	6	2455105	2455110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_014554	TTC	2	6	2455119	2455124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_014554	TGC	2	6	2455207	2455212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_014554	GT	3	6	2455266	2455271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_014554	CAC	2	6	2455293	2455298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9036	NC_014554	AAC	2	6	2455333	2455338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_014554	TTC	2	6	2455372	2455377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_014554	TTC	2	6	2458406	2458411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_014554	AAC	2	6	2458415	2458420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_014554	TAAA	2	8	2458447	2458454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_014554	CAT	2	6	2458493	2458498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_014554	GTG	2	6	2458644	2458649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_014554	ACC	2	6	2458680	2458685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9044	NC_014554	CAT	2	6	2458713	2458718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_014554	A	6	6	2458778	2458783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_014554	C	6	6	2458861	2458866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9047	NC_014554	TAG	2	6	2458881	2458886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_014554	TTTCAT	2	12	2459903	2459914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9049	NC_014554	T	6	6	2459998	2460003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_014554	TCG	2	6	2461569	2461574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_014554	T	6	6	2461599	2461604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_014554	A	6	6	2461646	2461651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_014554	GGT	2	6	2461660	2461665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_014554	TAG	2	6	2461687	2461692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_014554	ATG	2	6	2461767	2461772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_014554	AGG	2	6	2461819	2461824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_014554	TCA	2	6	2462309	2462314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_014554	TCG	2	6	2462361	2462366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_014554	CGT	2	6	2462443	2462448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_014554	AGC	2	6	2462469	2462474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_014554	TAA	2	6	2463385	2463390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_014554	TAC	2	6	2464333	2464338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_014554	TA	3	6	2465355	2465360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_014554	CGCT	2	8	2465409	2465416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9065	NC_014554	CTAAT	2	10	2465420	2465429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9066	NC_014554	GTTC	2	8	2465464	2465471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9067	NC_014554	TCTTAA	2	12	2465475	2465486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9068	NC_014554	TGA	2	6	2465502	2465507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_014554	A	6	6	2465518	2465523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_014554	ATC	2	6	2465548	2465553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_014554	CTG	2	6	2465620	2465625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_014554	A	8	8	2465707	2465714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_014554	ACT	2	6	2465781	2465786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_014554	AAG	2	6	2465796	2465801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_014554	CAC	2	6	2465852	2465857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9076	NC_014554	ATTAGT	2	12	2465949	2465960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_014554	ATC	2	6	2466006	2466011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9078	NC_014554	ATCTC	2	10	2466046	2466055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9079	NC_014554	GT	3	6	2466059	2466064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_014554	GGC	2	6	2466126	2466131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_014554	ACG	2	6	2466234	2466239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_014554	ACC	2	6	2466429	2466434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_014554	CTGT	2	8	2466469	2466476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9084	NC_014554	AGG	2	6	2466565	2466570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_014554	CAC	2	6	2466610	2466615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9086	NC_014554	GTG	2	6	2466621	2466626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_014554	GTA	2	6	2466653	2466658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_014554	CCA	2	6	2466661	2466666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_014554	CCTA	2	8	2466705	2466712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9090	NC_014554	TC	3	6	2466825	2466830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9091	NC_014554	GCC	2	6	2466922	2466927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9092	NC_014554	TC	3	6	2467169	2467174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9093	NC_014554	CTA	2	6	2467259	2467264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_014554	CCT	2	6	2467367	2467372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9095	NC_014554	GGA	2	6	2467475	2467480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_014554	GTA	2	6	2467653	2467658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_014554	TGG	2	6	2467725	2467730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_014554	GA	3	6	2467988	2467993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_014554	TCC	2	6	2468074	2468079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9100	NC_014554	CTCCC	2	10	2468309	2468318	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9101	NC_014554	GTA	2	6	2468370	2468375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_014554	TCC	2	6	2468394	2468399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_014554	CCG	2	6	2468426	2468431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_014554	GA	3	6	2468450	2468455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_014554	TTTGG	2	10	2468571	2468580	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_014554	TCGC	2	8	2468593	2468600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9107	NC_014554	CTG	2	6	2468634	2468639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_014554	CTG	2	6	2468717	2468722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_014554	TTAAC	2	10	2468840	2468849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9110	NC_014554	A	6	6	2468906	2468911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_014554	A	6	6	2468915	2468920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_014554	A	6	6	2468945	2468950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_014554	TC	3	6	2468999	2469004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_014554	GAA	2	6	2469023	2469028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_014554	AGG	2	6	2469058	2469063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_014554	ATC	2	6	2469114	2469119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_014554	GGC	2	6	2469132	2469137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_014554	GT	3	6	2469200	2469205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_014554	CCAT	2	8	2469353	2469360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_014554	GT	3	6	2469369	2469374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_014554	ATG	2	6	2469394	2469399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_014554	TCC	2	6	2469420	2469425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9123	NC_014554	ATA	2	6	2469477	2469482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_014554	CACGA	2	10	2469519	2469528	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9125	NC_014554	GAC	2	6	2469532	2469537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_014554	CAC	2	6	2469545	2469550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9127	NC_014554	TTC	2	6	2469620	2469625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_014554	GCA	2	6	2469739	2469744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_014554	CAGAC	2	10	2469853	2469862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9130	NC_014554	GCC	2	6	2469864	2469869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9257	NC_014554	A	6	6	2488736	2488741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9258	NC_014554	ACCCA	2	10	2488762	2488771	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9259	NC_014554	AGT	2	6	2488774	2488779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9395	NC_014554	CTAA	2	8	2528427	2528434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9396	NC_014554	TAC	2	6	2529206	2529211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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