MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014554	CAT	2	6	2313876	2313881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_014554	TCA	2	6	2313962	2313967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_014554	A	7	7	2314020	2314026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_014554	GT	3	6	2314033	2314038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_014554	GACG	2	8	2314567	2314574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8506	NC_014554	CCGT	2	8	2314602	2314609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_014554	ACC	2	6	2314633	2314638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_014554	A	8	8	2314690	2314697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_014554	CG	3	6	2314848	2314853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8510	NC_014554	AC	3	6	2315036	2315041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8511	NC_014554	ATTTTG	2	12	2315056	2315067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_014554	CTTAC	2	10	2315088	2315097	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8513	NC_014554	TCAT	2	8	2315605	2315612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8514	NC_014554	A	6	6	2317083	2317088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_014554	T	6	6	2317109	2317114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_014554	GAA	2	6	2317116	2317121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_014554	TTC	2	6	2317146	2317151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_014554	GGC	2	6	2317200	2317205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_014554	CAGT	2	8	2317256	2317263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8520	NC_014554	GCT	2	6	2317284	2317289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_014554	ACA	2	6	2317323	2317328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_014554	A	7	7	2317411	2317417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_014554	AAC	2	6	2317520	2317525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_014554	AAT	2	6	2319970	2319975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_014554	ATT	2	6	2320018	2320023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_014554	TTA	2	6	2320024	2320029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_014554	ATTG	2	8	2320036	2320043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_014554	ATT	2	6	2320062	2320067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_014554	AGTT	2	8	2320079	2320086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_014554	ATT	2	6	2320090	2320095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_014554	ATA	2	6	2320123	2320128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_014554	TCAC	2	8	2320202	2320209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_014554	A	7	7	2320223	2320229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_014554	A	6	6	2320242	2320247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_014554	TCA	2	6	2320265	2320270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_014554	CAAA	2	8	2320315	2320322	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8537	NC_014554	A	6	6	2320320	2320325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_014554	TGT	2	6	2323663	2323668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_014554	AAC	2	6	2323672	2323677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_014554	ACC	2	6	2323693	2323698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8541	NC_014554	AAC	2	6	2323771	2323776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_014554	TTTCT	2	10	2323784	2323793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8543	NC_014554	GTTATA	2	12	2323796	2323807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_014554	TAAAA	2	10	2323888	2323897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_014554	TAAA	2	8	2323917	2323924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014554	AAC	2	6	2324042	2324047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_014554	AT	3	6	2324057	2324062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014554	TTTG	2	8	2324102	2324109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_014554	TAA	2	6	2324122	2324127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_014554	ATC	2	6	2324164	2324169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_014554	CTC	2	6	2324183	2324188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8552	NC_014554	CTAC	2	8	2324223	2324230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_014554	TTA	2	6	2324311	2324316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_014554	A	6	6	2324809	2324814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014554	T	6	6	2324834	2324839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014554	TCT	2	6	2324862	2324867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_014554	AGG	2	6	2325861	2325866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_014554	AGTT	2	8	2326218	2326225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_014554	A	6	6	2326256	2326261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_014554	AAG	2	6	2326281	2326286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_014554	CTC	2	6	2326561	2326566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_014554	TTGA	2	8	2326593	2326600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_014554	CGA	2	6	2327983	2327988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_014554	GCTGA	2	10	2327995	2328004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8565	NC_014554	TTA	2	6	2328064	2328069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_014554	AAT	2	6	2328077	2328082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_014554	CTT	2	6	2328138	2328143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_014554	TTG	2	6	2328211	2328216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_014554	AAC	2	6	2330820	2330825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_014554	A	6	6	2330833	2330838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_014554	A	7	7	2330885	2330891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_014554	AT	3	6	2330929	2330934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_014554	T	6	6	2330934	2330939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_014554	AAT	2	6	2330940	2330945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_014554	AGC	2	6	2330965	2330970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_014554	CCT	2	6	2332570	2332575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8577	NC_014554	TAA	2	6	2332664	2332669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_014554	CAT	2	6	2334084	2334089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_014554	ATCA	2	8	2335563	2335570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8580	NC_014554	AACA	2	8	2335594	2335601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8581	NC_014554	A	7	7	2335685	2335691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_014554	TCC	2	6	2336270	2336275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8583	NC_014554	ATTA	2	8	2336293	2336300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_014554	CAT	2	6	2336794	2336799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_014554	TAA	2	6	2336806	2336811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_014554	GCT	2	6	2336812	2336817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_014554	GGT	2	6	2336820	2336825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_014554	AAC	2	6	2336950	2336955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_014554	A	7	7	2336970	2336976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_014554	TCA	2	6	2336984	2336989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_014554	TGTA	2	8	2336993	2337000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_014554	ATCAA	2	10	2337478	2337487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8593	NC_014554	CATT	2	8	2337873	2337880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8594	NC_014554	ATT	2	6	2337911	2337916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014554	AATT	2	8	2337961	2337968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014554	ACT	2	6	2339450	2339455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_014554	T	7	7	2339494	2339500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_014554	TGT	2	6	2339571	2339576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_014554	AGTT	2	8	2340258	2340265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_014554	ACG	2	6	2340324	2340329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_014554	ATTA	2	8	2341947	2341954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_014554	CAT	2	6	2342004	2342009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014554	A	6	6	2342025	2342030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_014554	CAC	2	6	2343257	2343262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8605	NC_014554	CGC	2	6	2343313	2343318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8606	NC_014554	TACC	2	8	2343330	2343337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_014554	AGT	2	6	2343360	2343365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_014554	TGT	2	6	2343418	2343423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_014554	T	7	7	2343966	2343972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_014554	AAG	2	6	2344030	2344035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_014554	AATA	2	8	2345007	2345014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_014554	TAG	2	6	2345032	2345037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_014554	TTTTA	2	10	2345093	2345102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_014554	ACCA	2	8	2345137	2345144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8615	NC_014554	ATTTA	2	10	2345145	2345154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_014554	AAC	2	6	2345185	2345190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_014554	ATG	2	6	2345211	2345216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_014554	ACC	2	6	2345324	2345329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8619	NC_014554	TGA	2	6	2345332	2345337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_014554	TATAA	2	10	2345342	2345351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_014554	CAA	2	6	2345380	2345385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_014554	CAC	2	6	2345765	2345770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8623	NC_014554	TTAATA	2	12	2345778	2345789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_014554	AAG	2	6	2345850	2345855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8627	NC_014554	TGC	2	6	2347462	2347467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8629	NC_014554	ACC	2	6	2347548	2347553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8630	NC_014554	CA	3	6	2348937	2348942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8631	NC_014554	TTG	2	6	2348989	2348994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8633	NC_014554	AAT	2	6	2350990	2350995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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