MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014554	TGGT	2	8	2193203	2193210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_014554	GT	3	6	2193225	2193230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_014554	TCC	2	6	2193289	2193294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_014554	ATA	2	6	2193307	2193312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_014554	ATTA	2	8	2193320	2193327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_014554	AT	3	6	2193328	2193333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_014554	TAAT	2	8	2193334	2193341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_014554	TCC	2	6	2193490	2193495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_014554	ACC	2	6	2193570	2193575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_014554	ATG	2	6	2193605	2193610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_014554	TCC	2	6	2193665	2193670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_014554	GCA	2	6	2193702	2193707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_014554	ACC	2	6	2193734	2193739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_014554	ATG	2	6	2193769	2193774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_014554	TCC	2	6	2193829	2193834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_014554	CCA	2	6	2193899	2193904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_014554	ATG	2	6	2193933	2193938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_014554	TCC	2	6	2193993	2193998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_014554	AAATT	2	10	2194407	2194416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_014554	TAAT	2	8	2194452	2194459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_014554	TCC	2	6	2194633	2194638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_014554	AGC	2	6	2194668	2194673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_014554	AAT	2	6	2194676	2194681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_014554	TTAAT	2	10	2194684	2194693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014554	AATA	2	8	2194812	2194819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_014554	CAATAT	2	12	2194900	2194911	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8027	NC_014554	TATTTA	2	12	2194912	2194923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_014554	ATA	2	6	2194965	2194970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_014554	T	7	7	2195010	2195016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_014554	ACCAT	2	10	2195028	2195037	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8031	NC_014554	A	6	6	2195055	2195060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_014554	T	6	6	2195077	2195082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_014554	TTA	3	9	2195087	2195095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_014554	ATT	2	6	2195098	2195103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_014554	T	6	6	2195117	2195122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_014554	CGG	2	6	2195124	2195129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_014554	A	6	6	2195183	2195188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_014554	TAA	2	6	2195230	2195235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_014554	TTA	2	6	2200605	2200610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_014554	TAA	2	6	2200640	2200645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_014554	ATG	2	6	2200664	2200669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_014554	TCA	2	6	2200694	2200699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_014554	ATC	2	6	2200718	2200723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_014554	TAA	2	6	2200732	2200737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_014554	T	6	6	2200801	2200806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_014554	CAG	2	6	2200850	2200855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_014554	CA	3	6	2200874	2200879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_014554	ACTG	2	8	2200918	2200925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8049	NC_014554	CAG	2	6	2200980	2200985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_014554	CTC	2	6	2201189	2201194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_014554	CA	3	6	2201203	2201208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_014554	CATG	2	8	2201226	2201233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_014554	TAT	2	6	2201261	2201266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_014554	CTG	2	6	2201274	2201279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_014554	CAA	2	6	2201434	2201439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_014554	CGA	2	6	2201467	2201472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_014554	AGC	2	6	2201531	2201536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_014554	CAGC	2	8	2201541	2201548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_014554	GTT	2	6	2201554	2201559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_014554	TAA	2	6	2203010	2203015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_014554	TCC	2	6	2203027	2203032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_014554	T	6	6	2203034	2203039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_014554	A	6	6	2203062	2203067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_014554	ATT	2	6	2203076	2203081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_014554	A	6	6	2203085	2203090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_014554	TTACCG	2	12	2203103	2203114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_014554	T	7	7	2203128	2203134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_014554	TAAT	2	8	2203150	2203157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_014554	T	6	6	2203157	2203162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_014554	TAA	2	6	2204036	2204041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_014554	TC	3	6	2204059	2204064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_014554	ATT	2	6	2204082	2204087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_014554	ATT	2	6	2204144	2204149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_014554	T	7	7	2204232	2204238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_014554	CA	3	6	2204261	2204266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_014554	GTT	3	9	2205450	2205458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_014554	CTA	2	6	2205621	2205626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_014554	ATG	2	6	2205630	2205635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_014554	TCC	2	6	2208002	2208007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_014554	TTG	2	6	2208030	2208035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_014554	ATC	2	6	2208040	2208045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_014554	CTAT	2	8	2208056	2208063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8083	NC_014554	AAC	2	6	2208103	2208108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_014554	TAA	2	6	2208113	2208118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_014554	CAT	2	6	2208156	2208161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_014554	TAA	2	6	2208173	2208178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_014554	CA	3	6	2208194	2208199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_014554	CAT	2	6	2208271	2208276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_014554	CAT	2	6	2210009	2210014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_014554	TCATA	2	10	2210032	2210041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8091	NC_014554	TTC	2	6	2210049	2210054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_014554	TGA	2	6	2210075	2210080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_014554	AAT	2	6	2210094	2210099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_014554	TTA	2	6	2210157	2210162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_014554	CTG	2	6	2211124	2211129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_014554	TTG	2	6	2211194	2211199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_014554	A	6	6	2211299	2211304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_014554	TAA	2	6	2211305	2211310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_014554	TAA	2	6	2211595	2211600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_014554	T	7	7	2211655	2211661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014554	T	7	7	2211721	2211727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_014554	ATA	2	6	2211732	2211737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_014554	AAT	2	6	2211773	2211778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_014554	ATA	2	6	2211831	2211836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_014554	CTC	2	6	2212842	2212847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_014554	TCA	2	6	2212906	2212911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_014554	A	6	6	2212933	2212938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_014554	TAT	2	6	2212939	2212944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_014554	AATTCA	2	12	2212956	2212967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8110	NC_014554	TCCAT	2	10	2212990	2212999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8111	NC_014554	ATTTA	2	10	2213020	2213029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_014554	T	6	6	2214282	2214287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_014554	TCC	2	6	2215091	2215096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_014554	GTT	2	6	2215129	2215134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_014554	AAT	2	6	2215343	2215348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_014554	AATT	2	8	2215387	2215394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_014554	CTTT	2	8	2215493	2215500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_014554	AATTTA	2	12	2215506	2215517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_014554	TAA	2	6	2215522	2215527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_014554	GTT	2	6	2215639	2215644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_014554	ACC	2	6	2215670	2215675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_014554	TATTC	2	10	2215692	2215701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8123	NC_014554	ATC	2	6	2215742	2215747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_014554	CTGAC	2	10	2215760	2215769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8125	NC_014554	TTTGAT	2	12	2215788	2215799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_014554	TGAC	2	8	2215815	2215822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_014554	TTAA	2	8	2216767	2216774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_014554	T	6	6	2217704	2217709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_014554	ATCG	2	8	2217776	2217783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_014554	C	6	6	2217784	2217789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8131	NC_014554	CCG	2	6	2217791	2217796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8132	NC_014554	AAG	2	6	2217814	2217819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_014554	TAA	2	6	2217884	2217889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8134	NC_014554	AGG	2	6	2217896	2217901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8135	NC_014554	TCAAA	2	10	2218490	2218499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8136	NC_014554	ATC	3	9	2219070	2219078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8137	NC_014554	TGA	2	6	2219121	2219126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8138	NC_014554	ATT	2	6	2219134	2219139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8139	NC_014554	CTG	2	6	2219145	2219150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8140	NC_014554	ATTA	2	8	2219191	2219198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8141	NC_014554	CAA	2	6	2219203	2219208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8142	NC_014554	GC	3	6	2220509	2220514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8143	NC_014554	AAT	2	6	2220524	2220529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8145	NC_014554	AAT	2	6	2220576	2220581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8146	NC_014554	CTT	2	6	2222912	2222917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8147	NC_014554	AGCA	2	8	2222944	2222951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8148	NC_014554	GTT	2	6	2222986	2222991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8149	NC_014554	T	6	6	2222993	2222998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8150	NC_014554	ATT	3	9	2223073	2223081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8153	NC_014554	AGCA	2	8	2223397	2223404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8154	NC_014554	AAACG	2	10	2223512	2223521	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8157	NC_014554	GCTG	2	8	2223920	2223927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8165	NC_014554	A	7	7	2228611	2228617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8166	NC_014554	TAA	2	6	2228646	2228651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8174	NC_014554	CG	3	6	2229888	2229893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8217	NC_014554	CTAAA	2	10	2239119	2239128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8220	NC_014554	GAA	2	6	2240564	2240569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8244	NC_014554	TCA	2	6	2245693	2245698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8246	NC_014554	ACT	2	6	2248747	2248752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8248	NC_014554	CGT	2	6	2251867	2251872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8249	NC_014554	A	6	6	2251997	2252002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8250	NC_014554	GGCTAA	2	12	2252119	2252130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8251	NC_014554	TG	3	6	2252161	2252166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8252	NC_014554	CTGT	2	8	2252177	2252184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8253	NC_014554	CT	3	6	2252205	2252210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8254	NC_014554	TTA	2	6	2252251	2252256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8255	NC_014554	TCA	2	6	2253153	2253158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8256	NC_014554	T	8	8	2253190	2253197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_014554	TTAT	3	12	2253272	2253283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_014554	A	6	6	2253350	2253355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_014554	G	6	6	2253356	2253361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8260	NC_014554	CGT	2	6	2255964	2255969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8261	NC_014554	ACG	2	6	2255977	2255982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8262	NC_014554	AT	3	6	2256010	2256015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_014554	CGA	2	6	2256109	2256114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8264	NC_014554	A	7	7	2256433	2256439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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