MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014554	TTG	2	6	1269472	1269477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014554	GTG	2	6	1269492	1269497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014554	TCT	2	6	1269532	1269537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014554	TTA	2	6	1269580	1269585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014554	ATG	2	6	1269632	1269637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014554	TGT	2	6	1269662	1269667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014554	AAC	2	6	1269676	1269681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_014554	TAT	2	6	1269730	1269735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014554	TAA	2	6	1272810	1272815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014554	ATA	2	6	1272861	1272866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014554	AGGTG	2	10	1272891	1272900	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014554	ACA	2	6	1273342	1273347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014554	TTGA	2	8	1273388	1273395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014554	A	6	6	1276037	1276042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014554	CAG	2	6	1276099	1276104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_014554	TTC	2	6	1276184	1276189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_014554	CGAC	2	8	1276208	1276215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_014554	AAC	2	6	1276219	1276224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014554	GAA	2	6	1276301	1276306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014554	ATT	2	6	1276308	1276313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014554	AGT	2	6	1276332	1276337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014554	TTTA	2	8	1276362	1276369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014554	GAT	2	6	1276422	1276427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014554	T	7	7	1276442	1276448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014554	TTG	2	6	1276452	1276457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014554	ATA	2	6	1279854	1279859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014554	TTTGCT	2	12	1280497	1280508	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5028	NC_014554	A	6	6	1280517	1280522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_014554	ACT	2	6	1280538	1280543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_014554	TAA	2	6	1280589	1280594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014554	AAT	2	6	1281164	1281169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014554	TCC	2	6	1281170	1281175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_014554	TTC	2	6	1281178	1281183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014554	G	6	6	1281902	1281907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014554	TAA	2	6	1282705	1282710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014554	TTG	2	6	1282734	1282739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014554	GTT	2	6	1282770	1282775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014554	AAT	2	6	1282779	1282784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014554	ATT	2	6	1284129	1284134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014554	TGA	2	6	1284218	1284223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014554	A	6	6	1284247	1284252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014554	TCA	2	6	1284261	1284266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_014554	ATG	2	6	1284270	1284275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014554	TGA	2	6	1284303	1284308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014554	ATT	2	6	1284317	1284322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014554	GTG	2	6	1284323	1284328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014554	GAG	2	6	1284397	1284402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014554	CCT	2	6	1288099	1288104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_014554	AGA	2	6	1288122	1288127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014554	CCT	2	6	1289894	1289899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_014554	CAA	2	6	1290650	1290655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014554	AGA	2	6	1290686	1290691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014554	AT	3	6	1290756	1290761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014554	TTA	2	6	1290787	1290792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014554	ATA	2	6	1290859	1290864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014554	TGA	2	6	1290882	1290887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014554	AAT	2	6	1290893	1290898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014554	GACT	2	8	1290901	1290908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_014554	TGAT	2	8	1290953	1290960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014554	AAT	3	9	1290991	1290999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014554	ACG	2	6	1291025	1291030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_014554	A	7	7	1291032	1291038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014554	TTAA	2	8	1291070	1291077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014554	ACT	2	6	1292032	1292037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_014554	TGCA	2	8	1292060	1292067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_014554	CAAA	2	8	1292167	1292174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_014554	CTT	2	6	1293025	1293030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_014554	TATT	2	8	1293031	1293038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014554	TTGA	2	8	1293090	1293097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014554	CCAA	2	8	1293140	1293147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_014554	GCTAT	2	10	1293166	1293175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5072	NC_014554	ATA	2	6	1295227	1295232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_014554	TAAA	2	8	1295242	1295249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014554	GAG	2	6	1295256	1295261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014554	CAA	2	6	1296063	1296068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_014554	CGC	2	6	1296072	1296077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_014554	TTG	2	6	1296105	1296110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014554	GAA	2	6	1296122	1296127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014554	TCAA	2	8	1296132	1296139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_014554	T	6	6	1296823	1296828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014554	TTTA	2	8	1297293	1297300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014554	TAAT	2	8	1297344	1297351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014554	TGAT	2	8	1301113	1301120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_014554	ATT	2	6	1301139	1301144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014554	A	6	6	1302467	1302472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014554	CAG	2	6	1302480	1302485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_014554	T	6	6	1302492	1302497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014554	GA	3	6	1302557	1302562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014554	ATT	2	6	1302569	1302574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_014554	ACA	2	6	1302580	1302585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_014554	ATAA	2	8	1302637	1302644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014554	GT	3	6	1302695	1302700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014554	AGT	2	6	1302743	1302748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014554	AAT	2	6	1305179	1305184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014554	TCA	2	6	1305185	1305190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_014554	CAT	2	6	1305206	1305211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_014554	TTA	2	6	1305227	1305232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014554	TGAAA	2	10	1305259	1305268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014554	TTG	2	6	1305319	1305324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014554	TA	3	6	1305343	1305348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014554	GGAA	2	8	1305350	1305357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_014554	TAA	2	6	1305370	1305375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014554	TTG	2	6	1305382	1305387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014554	GAT	2	6	1305391	1305396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014554	TAAAA	2	10	1310617	1310626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014554	T	6	6	1310657	1310662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_014554	TTG	2	6	1310673	1310678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014554	GTA	2	6	1310726	1310731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014554	TAT	2	6	1310804	1310809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_014554	ATT	2	6	1310818	1310823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014554	ACAG	2	8	1310865	1310872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_014554	GGT	2	6	1311236	1311241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014554	ATA	2	6	1312209	1312214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014554	CTT	2	6	1312252	1312257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_014554	TATG	2	8	1312269	1312276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014554	CGC	2	6	1312278	1312283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_014554	A	6	6	1312292	1312297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014554	TAT	2	6	1312341	1312346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014554	TTA	2	6	1312442	1312447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014554	CTT	2	6	1312473	1312478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_014554	TTAAG	2	10	1312496	1312505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014554	GTG	2	6	1312563	1312568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014554	AGT	2	6	1312642	1312647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014554	ATT	2	6	1313402	1313407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014554	AAT	2	6	1313525	1313530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014554	ATG	2	6	1313618	1313623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014554	ACC	2	6	1316307	1316312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_014554	GTT	2	6	1317758	1317763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014554	AAC	2	6	1318313	1318318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014554	TTA	2	6	1320831	1320836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014554	TGA	2	6	1320858	1320863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014554	T	6	6	1320931	1320936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_014554	GTC	2	6	1320937	1320942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_014554	ATTG	2	8	1322980	1322987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_014554	AT	3	6	1323018	1323023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_014554	A	7	7	1323034	1323040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5138	NC_014554	ATT	2	6	1323713	1323718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_014554	AGG	2	6	1323941	1323946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_014554	GGC	2	6	1324368	1324373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_014554	T	7	7	1324376	1324382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_014554	GT	3	6	1324426	1324431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_014554	GATT	2	8	1324454	1324461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_014554	ATT	2	6	1324468	1324473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_014554	CTTA	2	8	1324497	1324504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5146	NC_014554	ATTA	2	8	1324512	1324519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_014554	GAT	2	6	1324874	1324879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_014554	T	6	6	1324918	1324923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5151	NC_014554	TGAG	2	8	1326414	1326421	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_014554	TTG	2	6	1326490	1326495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_014554	ATGA	2	8	1326496	1326503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_014554	C	6	6	1326568	1326573	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5158	NC_014554	GTA	2	6	1326896	1326901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_014554	T	6	6	1326953	1326958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_014554	ATG	3	9	1327115	1327123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5164	NC_014554	ACC	2	6	1327241	1327246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5165	NC_014554	TGA	3	9	1327255	1327263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_014554	GTT	2	6	1327321	1327326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5168	NC_014554	AAGT	2	8	1327354	1327361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_014554	GTT	2	6	1327383	1327388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5172	NC_014554	AAGT	2	8	1327638	1327645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_014554	TGCA	2	8	1327731	1327738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5174	NC_014554	TTA	2	6	1327739	1327744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5176	NC_014554	TTAA	2	8	1327881	1327888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_014554	TTG	2	6	1328288	1328293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5219	NC_014554	ATA	2	6	1340651	1340656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_014554	TTG	2	6	1340780	1340785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_014554	T	6	6	1347812	1347817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_014554	T	6	6	1347827	1347832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_014554	GTT	2	6	1347857	1347862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_014554	CGG	2	6	1347865	1347870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5246	NC_014554	GTC	2	6	1352314	1352319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_014554	ATT	2	6	1352451	1352456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_014554	GTGA	2	8	1352472	1352479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_014554	AAT	2	6	1352555	1352560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_014554	TGC	2	6	1352566	1352571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_014554	TG	3	6	1353254	1353259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_014554	TAA	2	6	1354265	1354270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_014554	ATG	3	9	1354293	1354301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_014554	CTTA	2	8	1354608	1354615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5256	NC_014554	ATTGT	2	10	1354653	1354662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_014554	TA	3	6	1354693	1354698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_014554	ATTA	2	8	1354807	1354814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_014554	TAG	2	6	1355657	1355662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_014554	AAT	2	6	1356209	1356214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_014554	TAG	2	6	1356654	1356659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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