MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014334	GCTCT	2	10	883916	883925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_014334	GGT	2	6	883943	883948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014334	AATTT	2	10	883960	883969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014334	AGG	2	6	883999	884004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014334	GAAT	2	8	884825	884832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014334	AGG	2	6	884855	884860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014334	CAT	2	6	890063	890068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_014334	CGG	2	6	890072	890077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_014334	TAA	2	6	890079	890084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014334	TTA	2	6	890133	890138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014334	CAG	2	6	890192	890197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014334	TGT	2	6	890232	890237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014334	ATG	2	6	890361	890366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014334	TTTA	2	8	890945	890952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014334	T	6	6	890987	890992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014334	AAC	2	6	890996	891001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_014334	TGA	2	6	891005	891010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014334	AATA	2	8	891068	891075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014334	TCA	2	6	893985	893990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_014334	CAA	2	6	894009	894014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_014334	T	7	7	894071	894077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014334	CGA	2	6	894139	894144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014334	TGA	2	6	894162	894167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014334	AG	3	6	894179	894184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014334	T	6	6	894197	894202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_014334	TGG	2	6	894248	894253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014334	TAA	2	6	894255	894260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014334	CG	3	6	894311	894316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_014334	AGG	2	6	894333	894338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014334	AGC	2	6	894340	894345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_014334	TAA	2	6	894891	894896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014334	AGG	2	6	894905	894910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014334	AAAAG	2	10	895515	895524	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014334	TGTTT	2	10	895741	895750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014334	CAT	2	6	895791	895796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_014334	CGA	2	6	895839	895844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_014334	TGA	2	6	895871	895876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014334	GA	3	6	895875	895880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014334	TA	3	6	895932	895937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014334	AACC	2	8	895952	895959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_014334	ACT	2	6	895966	895971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014334	AAC	2	6	896023	896028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_014334	A	7	7	896044	896050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014334	GAT	2	6	896063	896068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014334	AAT	2	6	896085	896090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014334	A	7	7	896100	896106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014334	TTG	2	6	896198	896203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014334	TTG	2	6	896221	896226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014334	T	7	7	896236	896242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014334	AAG	2	6	896293	896298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014334	AGG	2	6	897367	897372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014334	GGAG	2	8	898443	898450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014334	CTCC	2	8	898455	898462	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3054	NC_014334	T	7	7	898465	898471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014334	CTG	2	6	898509	898514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014334	AGG	2	6	898581	898586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014334	CTA	2	6	900625	900630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_014334	GAA	2	6	900656	900661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014334	T	7	7	902022	902028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014334	GT	3	6	902062	902067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014334	AGCG	2	8	902102	902109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_014334	T	6	6	902213	902218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014334	TA	3	6	903975	903980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014334	TGT	2	6	903990	903995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014334	CTA	2	6	905612	905617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014334	ACT	2	6	905731	905736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_014334	CAA	2	6	905762	905767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014334	T	7	7	906032	906038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014334	T	7	7	906159	906165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014334	TCT	2	6	909914	909919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_014334	ATG	2	6	909941	909946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014334	TCAT	2	8	910038	910045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_014334	TA	3	6	910072	910077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014334	AAT	2	6	910078	910083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_014334	ATTG	2	8	910090	910097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014334	TAA	2	6	910100	910105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014334	TTAT	3	12	910126	910137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014334	TAAG	2	8	910172	910179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014334	CGA	2	6	910229	910234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_014334	GAG	2	6	910244	910249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014334	GGA	2	6	910250	910255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014334	AACA	2	8	911279	911286	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_014334	AAT	2	6	911301	911306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014334	ATT	2	6	911341	911346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014334	T	6	6	911365	911370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014334	ATTT	2	8	911385	911392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_014334	ACA	2	6	911457	911462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_014334	GTT	2	6	911487	911492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014334	TGCG	2	8	911656	911663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_014334	G	6	6	911687	911692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014334	CATT	2	8	915135	915142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_014334	TCAT	2	8	915162	915169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_014334	TAA	2	6	915173	915178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014334	GTT	2	6	915196	915201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_014334	GAGG	2	8	919345	919352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014334	GTTTA	2	10	920996	921005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_014334	AGA	2	6	922332	922337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014334	A	6	6	922337	922342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014334	CCT	2	6	922350	922355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_014334	GCA	2	6	922392	922397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_014334	TTC	2	6	922410	922415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_014334	CAT	2	6	922640	922645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_014334	GTC	2	6	922671	922676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_014334	TA	3	6	922678	922683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014334	CGGT	2	8	922695	922702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_014334	TGC	2	6	922717	922722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014334	CAA	2	6	922731	922736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_014334	CCA	2	6	922744	922749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_014334	GAA	2	6	922755	922760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014334	CA	3	6	922788	922793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_014334	ATG	2	6	922879	922884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014334	CTTT	2	8	922960	922967	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_014334	GAC	2	6	923012	923017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014334	T	6	6	923018	923023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014334	TGA	2	6	923134	923139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014334	TTGA	2	8	923196	923203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014334	GC	3	6	923247	923252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_014334	CG	3	6	923352	923357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_014334	TTTG	2	8	923412	923419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_014334	CAA	2	6	923440	923445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_014334	CAA	2	6	923460	923465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_014334	ACTG	2	8	923484	923491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3123	NC_014334	AAT	3	9	923506	923514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014334	TCA	3	9	923621	923629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014334	TCG	2	6	923655	923660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_014334	AGG	2	6	923675	923680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014334	T	8	8	924588	924595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014334	TAT	2	6	924636	924641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014334	ATT	2	6	925178	925183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014334	AGA	2	6	925197	925202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014334	GCG	2	6	925230	925235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_014334	CTT	2	6	925247	925252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_014334	ACA	2	6	925341	925346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_014334	TAGA	2	8	925525	925532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014334	GAA	2	6	925537	925542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_014334	ACT	2	6	925546	925551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_014334	CGC	2	6	926851	926856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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