MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014334	A	6	6	2443601	2443606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_014334	ATTG	2	8	2443632	2443639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_014334	CTT	2	6	2444624	2444629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_014334	T	6	6	2444634	2444639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_014334	A	6	6	2444656	2444661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_014334	CAA	2	6	2444662	2444667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_014334	TA	4	8	2444675	2444682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_014334	AT	3	6	2444699	2444704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_014334	GAT	2	6	2444748	2444753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_014334	TATT	2	8	2444754	2444761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_014334	TA	3	6	2444802	2444807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_014334	ATT	2	6	2444837	2444842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_014334	GATC	2	8	2444853	2444860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7514	NC_014334	T	7	7	2444866	2444872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_014334	AC	3	6	2444884	2444889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_014334	CTG	2	6	2444918	2444923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_014334	CAT	2	6	2444930	2444935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_014334	A	6	6	2444964	2444969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_014334	AAG	2	6	2444991	2444996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_014334	TA	3	6	2447199	2447204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_014334	ACA	2	6	2447216	2447221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_014334	TCC	2	6	2449086	2449091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_014334	A	7	7	2449644	2449650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_014334	TCC	2	6	2449655	2449660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_014334	AGCC	2	8	2449714	2449721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7526	NC_014334	TGA	2	6	2449756	2449761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_014334	AGCCT	2	10	2449970	2449979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7528	NC_014334	TTAC	2	8	2450431	2450438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7529	NC_014334	AATA	2	8	2450488	2450495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_014334	CCT	2	6	2452351	2452356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7531	NC_014334	TGAT	2	8	2452393	2452400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_014334	TCA	2	6	2452411	2452416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_014334	AATG	2	8	2452438	2452445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_014334	CTT	2	6	2456001	2456006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_014334	TCT	2	6	2456007	2456012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_014334	TCC	2	6	2456631	2456636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7537	NC_014334	T	7	7	2456668	2456674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_014334	TCT	2	6	2456717	2456722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_014334	GCTT	2	8	2457119	2457126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_014334	GTA	2	6	2457151	2457156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_014334	T	6	6	2457170	2457175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_014334	TGCA	2	8	2457258	2457265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7543	NC_014334	GAT	2	6	2457276	2457281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_014334	TAAG	2	8	2458285	2458292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_014334	T	7	7	2458316	2458322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_014334	CTGCGA	2	12	2458423	2458434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_014334	T	6	6	2458490	2458495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_014334	AAT	2	6	2458496	2458501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_014334	GAA	2	6	2458652	2458657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_014334	AGG	2	6	2458659	2458664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_014334	T	6	6	2460123	2460128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_014334	CAA	2	6	2460316	2460321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_014334	A	8	8	2460320	2460327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_014334	ATT	2	6	2460335	2460340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_014334	TAA	2	6	2460509	2460514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_014334	GGA	2	6	2460532	2460537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_014334	AAG	2	6	2461236	2461241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_014334	TAA	2	6	2461252	2461257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_014334	T	7	7	2461269	2461275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_014334	TGG	2	6	2461318	2461323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_014334	TTG	2	6	2461446	2461451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_014334	GGA	2	6	2461474	2461479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_014334	GACT	2	8	2462229	2462236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_014334	CTC	2	6	2463760	2463765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7565	NC_014334	TTA	2	6	2468357	2468362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_014334	TAA	2	6	2468410	2468415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_014334	T	6	6	2468433	2468438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_014334	T	7	7	2468583	2468589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_014334	GTT	2	6	2468597	2468602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_014334	TCC	2	6	2469144	2469149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_014334	ATT	2	6	2469162	2469167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_014334	TCA	2	6	2469237	2469242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_014334	CAA	2	6	2469290	2469295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_014334	A	6	6	2469294	2469299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_014334	TCC	2	6	2469981	2469986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_014334	TGT	2	6	2470002	2470007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_014334	CCA	2	6	2470035	2470040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7578	NC_014334	CCT	2	6	2471545	2471550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7579	NC_014334	A	6	6	2471653	2471658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_014334	TTAA	2	8	2471696	2471703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_014334	TCC	2	6	2473222	2473227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7582	NC_014334	A	7	7	2473307	2473313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_014334	TTC	2	6	2474921	2474926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_014334	GGCAT	2	10	2475775	2475784	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7585	NC_014334	CTC	2	6	2476078	2476083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7586	NC_014334	TCTA	2	8	2476086	2476093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7587	NC_014334	TAC	2	6	2477476	2477481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_014334	AGG	2	6	2477515	2477520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_014334	CAA	2	6	2478108	2478113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_014334	A	7	7	2478112	2478118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_014334	CCA	2	6	2478119	2478124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7592	NC_014334	T	6	6	2478150	2478155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_014334	GGT	2	6	2478237	2478242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_014334	CAA	3	9	2478251	2478259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7595	NC_014334	TA	3	6	2478284	2478289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_014334	A	7	7	2478308	2478314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_014334	ACA	2	6	2478640	2478645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_014334	CAA	2	6	2480044	2480049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_014334	TCA	2	6	2480052	2480057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7600	NC_014334	A	6	6	2480093	2480098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_014334	AGCG	2	8	2480221	2480228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7602	NC_014334	AGCG	2	8	2480345	2480352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7603	NC_014334	A	6	6	2480517	2480522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_014334	T	6	6	2482196	2482201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_014334	AAT	2	6	2482202	2482207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_014334	A	6	6	2482212	2482217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_014334	ATAA	2	8	2482361	2482368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_014334	ATC	2	6	2483452	2483457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_014334	CTA	2	6	2483487	2483492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_014334	GCA	2	6	2483574	2483579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_014334	TA	3	6	2483583	2483588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_014334	CA	3	6	2483674	2483679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7613	NC_014334	A	7	7	2483679	2483685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_014334	TCA	2	6	2484434	2484439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_014334	TATAA	2	10	2485034	2485043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_014334	AGAA	2	8	2485058	2485065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_014334	T	6	6	2487766	2487771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_014334	GCA	2	6	2488867	2488872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_014334	ATC	2	6	2489302	2489307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_014334	AAT	2	6	2489382	2489387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_014334	GCTT	2	8	2489399	2489406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7622	NC_014334	TAG	2	6	2489433	2489438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_014334	TTGC	2	8	2490689	2490696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7624	NC_014334	AAT	2	6	2490748	2490753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_014334	CAA	2	6	2490859	2490864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_014334	CCT	2	6	2490882	2490887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7627	NC_014334	CAT	2	6	2490890	2490895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_014334	CTT	2	6	2490928	2490933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_014334	TGTAA	2	10	2491003	2491012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_014334	AAT	2	6	2491127	2491132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_014334	CCTTCG	2	12	2491143	2491154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7632	NC_014334	TGC	2	6	2491289	2491294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7633	NC_014334	ATC	2	6	2491322	2491327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7634	NC_014334	CGTC	2	8	2491360	2491367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7635	NC_014334	GCT	2	6	2491416	2491421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7637	NC_014334	TCA	2	6	2491560	2491565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7638	NC_014334	TCA	2	6	2491707	2491712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7662	NC_014334	A	6	6	2494242	2494247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7663	NC_014334	T	6	6	2494272	2494277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7664	NC_014334	TCC	2	6	2495261	2495266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7673	NC_014334	AACG	2	8	2499030	2499037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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