MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_014334	CTT	3	9	2322419	2322427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_014334	TCA	2	6	2322429	2322434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_014334	CA	3	6	2322439	2322444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_014334	TAA	2	6	2322479	2322484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_014334	AATG	2	8	2323518	2323525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_014334	CGT	2	6	2323549	2323554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_014334	TAAA	2	8	2323920	2323927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_014334	CAA	2	6	2323997	2324002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_014334	AAC	2	6	2324433	2324438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_014334	C	6	6	2324790	2324795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7011	NC_014334	CA	3	6	2324833	2324838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_014334	T	7	7	2324871	2324877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_014334	T	6	6	2324908	2324913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_014334	CAA	2	6	2324975	2324980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_014334	A	7	7	2324991	2324997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_014334	T	6	6	2325023	2325028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_014334	TGAT	2	8	2325042	2325049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_014334	GAT	2	6	2325446	2325451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_014334	GTTA	2	8	2326810	2326817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_014334	CTC	2	6	2327012	2327017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_014334	CTT	2	6	2327060	2327065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_014334	ATT	2	6	2327380	2327385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_014334	T	6	6	2327403	2327408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_014334	CGT	2	6	2327433	2327438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_014334	CTTG	2	8	2327500	2327507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_014334	T	6	6	2327521	2327526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_014334	A	8	8	2327529	2327536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_014334	T	6	6	2327559	2327564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_014334	ATC	2	6	2327568	2327573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_014334	GAC	2	6	2328575	2328580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_014334	T	6	6	2328694	2328699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_014334	AGG	2	6	2328721	2328726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_014334	ATC	2	6	2330672	2330677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_014334	T	6	6	2330706	2330711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_014334	ATC	2	6	2330782	2330787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_014334	GAA	2	6	2330965	2330970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_014334	TCA	2	6	2332434	2332439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_014334	CAAC	2	8	2332454	2332461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_014334	AAC	2	6	2332508	2332513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_014334	CAAA	2	8	2333597	2333604	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_014334	A	6	6	2335235	2335240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_014334	TA	3	6	2335551	2335556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_014334	CAA	2	6	2335562	2335567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_014334	A	6	6	2335566	2335571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_014334	TAT	2	6	2335576	2335581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_014334	T	6	6	2338334	2338339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_014334	TAAG	2	8	2338372	2338379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_014334	T	6	6	2338464	2338469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_014334	ATT	2	6	2338532	2338537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_014334	ATC	2	6	2338568	2338573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_014334	AGA	2	6	2338598	2338603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_014334	CCT	2	6	2338996	2339001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_014334	TC	3	6	2339019	2339024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_014334	ATC	2	6	2340515	2340520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_014334	AGT	2	6	2342270	2342275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_014334	GAG	2	6	2342310	2342315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_014334	AAG	2	6	2342521	2342526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_014334	TGC	2	6	2342528	2342533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_014334	AT	5	10	2342575	2342584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_014334	AT	3	6	2342590	2342595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_014334	CAA	2	6	2343637	2343642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_014334	A	7	7	2343679	2343685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_014334	T	8	8	2343718	2343725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_014334	T	6	6	2346406	2346411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_014334	A	6	6	2346423	2346428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_014334	CATT	2	8	2346518	2346525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_014334	CAT	2	6	2346539	2346544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_014334	A	6	6	2346546	2346551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_014334	GCTC	2	8	2346574	2346581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_014334	TCC	2	6	2348080	2348085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_014334	CGA	2	6	2348106	2348111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_014334	A	6	6	2348232	2348237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_014334	ACC	2	6	2348611	2348616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_014334	ATT	2	6	2348618	2348623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_014334	T	7	7	2348862	2348868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_014334	ATT	2	6	2348919	2348924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_014334	GGAA	2	8	2348932	2348939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_014334	TGA	2	6	2349950	2349955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_014334	CAA	2	6	2349979	2349984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_014334	GAAG	2	8	2350005	2350012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_014334	GAA	2	6	2350018	2350023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_014334	TCA	2	6	2350793	2350798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_014334	TAT	2	6	2350850	2350855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_014334	TCAA	2	8	2350866	2350873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7085	NC_014334	CGGC	2	8	2350925	2350932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_014334	CCT	2	6	2351506	2351511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_014334	GC	3	6	2351533	2351538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_014334	A	7	7	2351607	2351613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_014334	TCA	2	6	2351618	2351623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_014334	AATT	2	8	2352223	2352230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_014334	TAT	2	6	2352326	2352331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_014334	AATA	2	8	2352386	2352393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_014334	ATT	2	6	2352407	2352412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_014334	CGC	2	6	2353955	2353960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7095	NC_014334	CCG	2	6	2353996	2354001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_014334	CGT	2	6	2354009	2354014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_014334	GCT	2	6	2354041	2354046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_014334	GTGAT	2	10	2354093	2354102	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_014334	TTC	2	6	2354127	2354132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_014334	CAA	2	6	2354163	2354168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_014334	CAT	2	6	2354173	2354178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_014334	GGCT	2	8	2354206	2354213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7103	NC_014334	ATTA	2	8	2354259	2354266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_014334	TC	3	6	2355334	2355339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_014334	A	7	7	2355351	2355357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_014334	CT	3	6	2355399	2355404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_014334	A	6	6	2355415	2355420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_014334	CTG	2	6	2355429	2355434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_014334	AAC	2	6	2355551	2355556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_014334	T	6	6	2355775	2355780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_014334	ACC	2	6	2355814	2355819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7112	NC_014334	GAG	2	6	2355822	2355827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_014334	CTC	2	6	2355834	2355839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_014334	GGT	2	6	2355842	2355847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_014334	A	7	7	2355849	2355855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_014334	TGT	2	6	2355867	2355872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_014334	T	7	7	2355929	2355935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_014334	ACC	2	6	2355946	2355951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_014334	TGC	2	6	2355974	2355979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_014334	TGA	2	6	2356209	2356214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_014334	GAA	2	6	2356239	2356244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_014334	CT	3	6	2356247	2356252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_014334	AGC	2	6	2356266	2356271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_014334	CAT	2	6	2356289	2356294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_014334	GCT	2	6	2356311	2356316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_014334	TCC	2	6	2358762	2358767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_014334	TA	4	8	2358813	2358820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_014334	TTA	2	6	2358822	2358827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_014334	TAT	2	6	2358832	2358837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_014334	A	6	6	2360194	2360199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_014334	A	6	6	2360210	2360215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_014334	CTG	2	6	2360221	2360226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_014334	ATT	2	6	2360343	2360348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7135	NC_014334	CTGGA	2	10	2360731	2360740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7390	NC_014334	TC	3	6	2434621	2434626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7391	NC_014334	ATCTC	2	10	2434657	2434666	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7392	NC_014334	G	6	6	2434669	2434674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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7396	NC_014334	ACC	2	6	2435040	2435045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7397	NC_014334	AGG	2	6	2435176	2435181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7398	NC_014334	GTA	2	6	2435264	2435269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_014334	CCA	2	6	2435272	2435277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7400	NC_014334	CCTA	2	8	2435316	2435323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7401	NC_014334	TC	3	6	2435436	2435441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7402	NC_014334	GCC	2	6	2435533	2435538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7403	NC_014334	CAT	2	6	2435624	2435629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7406	NC_014334	TCGC	2	8	2435760	2435767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7407	NC_014334	CTC	2	6	2435783	2435788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7410	NC_014334	CCT	2	6	2435979	2435984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7412	NC_014334	TAT	2	6	2436266	2436271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7413	NC_014334	TGG	2	6	2436337	2436342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7414	NC_014334	ATCC	2	8	2436565	2436572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7422	NC_014334	CCG	2	6	2437036	2437041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7423	NC_014334	AAGC	2	8	2437172	2437179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7424	NC_014334	TCGC	2	8	2437204	2437211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7425	NC_014334	CTA	2	6	2437214	2437219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7427	NC_014334	GCC	2	6	2437280	2437285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7428	NC_014334	CTTA	2	8	2437363	2437370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7429	NC_014334	ATGCG	2	10	2437482	2437491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7430	NC_014334	TCG	2	6	2437593	2437598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7431	NC_014334	GGA	2	6	2437620	2437625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7432	NC_014334	CCT	2	6	2437646	2437651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7433	NC_014334	GTT	2	6	2437698	2437703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7434	NC_014334	AGG	2	6	2437888	2437893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7435	NC_014334	GCTC	2	8	2437966	2437973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7436	NC_014334	GT	3	6	2438032	2438037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7437	NC_014334	CCAT	2	8	2438185	2438192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7438	NC_014334	GT	3	6	2438201	2438206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7439	NC_014334	ATG	2	6	2438226	2438231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7440	NC_014334	TCC	2	6	2438252	2438257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7441	NC_014334	CACGA	2	10	2438351	2438360	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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7444	NC_014334	TC	3	6	2438414	2438419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7445	NC_014334	TTC	2	6	2438452	2438457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7446	NC_014334	CAGAC	2	10	2438685	2438694	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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7494	NC_014334	TCAT	2	8	2441330	2441337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7495	NC_014334	TCC	2	6	2441375	2441380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7496	NC_014334	TGA	3	9	2441402	2441410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7498	NC_014334	CTTG	2	8	2442524	2442531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7500	NC_014334	TTTC	2	8	2443590	2443597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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